TACSTD2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MAE, 2MVK, 2MVL

Ідентифікатори

Символи

TACSTD2, EGP-1, EGP1, GA733-1, GA7331, GP50, M1S1, TROP2, tumor-associated calcium signal transducer 2, tumor associated calcium signal transducer 2

Зовнішні ІД

OMIM: 137290 MGI: 1861606 HomoloGene: 1763 GeneCards: TACSTD2

Пов'язані генетичні захворювання

gelatinous drop-like corneal dystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity • cadherin binding involved in cell-cell adhesion
Клітинна компонента	• integral component of membrane • гіалоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • basal plasma membrane • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • bicellular tight junction
Біологічний процес	• ureteric bud morphogenesis • відповідь на стимул • negative regulation of ruffle assembly • negative regulation of cell motility • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • проліферація • regulation of epithelial cell proliferation • negative regulation of stress fiber assembly • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • negative regulation of epithelial cell migration • зір • cell-cell adhesion • positive regulation of stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4070


56753

Ensembl


ENSG00000184292


ENSMUSG00000051397

UniProt


P09758


Q8BGV3

RefSeq (мРНК)


NM_002353


NM_020047

RefSeq (білок)


NP_002344


NP_064431

Локус (UCSC)

Хр. 1: 58.58 – 58.58 Mb

Хр. 6: 67.51 – 67.51 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TACSTD2 (англ. Tumor associated calcium signal transducer 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 323 амінокислот, а молекулярна маса — 35 709^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARGPGLAPP	PLRLPLLLLV	LAAVTGHTAA	QDNCTCPTNK	MTVCSPDGPG
GRCQCRALGS	GMAVDCSTLT	SKCLLLKARM	SAPKNARTLV	RPSEHALVDN
DGLYDPDCDP	EGRFKARQCN	QTSVCWCVNS	VGVRRTDKGD	LSLRCDELVR
THHILIDLRH	RPTAGAFNHS	DLDAELRRLF	RERYRLHPKF	VAAVHYEQPT
IQIELRQNTS	QKAAGDVDIG	DAAYYFERDI	KGESLFQGRG	GLDLRVRGEP
LQVERTLIYY	LDEIPPKFSM	KRLTAGLIAV	IVVVVVALVA	GMAVLVITNR
RKSGKYKKVE	IKELGELRKE	PSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TACSTD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11530 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P09758 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.