TCF7

Ідентифікатори

Символи

TCF7, TCF-1, transcription factor 7 (T-cell specific, HMG-box), transcription factor 7

Зовнішні ІД

OMIM: 189908 MGI: 98507 HomoloGene: 135816 GeneCards: TCF7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • beta-catenin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• cellular response to interleukin-4 • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • T cell receptor V(D)J recombination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic hindgut morphogenesis • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • canonical Wnt signaling pathway involved in negative regulation of apoptotic process • embryonic genitalia morphogenesis • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • neural tube development • embryonic digestive tract morphogenesis • alpha-beta T cell differentiation • beta-catenin-TCF complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • canonical Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6932


21414

Ensembl


ENSG00000081059


ENSMUSG00000000782

UniProt


P36402


Q00417

RefSeq (мРНК)

NM_001134851 NM_001134852 NM_003202 NM_201632 NM_201634
NM_213648 NM_001346425 NM_001346450 NM_001366502


NM_009331 NM_001313981

RefSeq (білок)

NP_001128323 NP_001333354 NP_001333379 NP_003193 NP_963963
NP_963965 NP_998813 NP_001353431


NP_001300910 NP_033357

Локус (UCSC)

Хр. 5: 134.11 – 134.15 Mb

Хр. 11: 52.25 – 52.28 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF7 (англ. Transcription factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 384 амінокислот, а молекулярна маса — 41 642^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQLDSGGGG	AGGGDDLGAP	DELLAFQDEG	EEQDDKSRDS	AAGPERDLAE
LKSSLVNESE	GAAGGAGIPG	VPGAGAGARG	EAEALGREHA	AQRLFPDKLP
EPLEDGLKAP	ECTSGMYKET	VYSAFNLLMH	YPPPSGAGQH	PQPQPPLHKA
NQPPHGVPQL	SLYEHFNSPH	PTPAPADISQ	KQVHRPLQTP	DLSGFYSLTS
GSMGQLPHTV	SWFTHPSLML	GSGVPGHPAA	IPHPAIVPPS	GKQELQPFDR
NLKTQAESKA	EKEAKKPTIK	KPLNAFMLYM	KEMRAKVIAE	CTLKESAAIN
QILGRRWHAL	SREEQAKYYE	LARKERQLHM	QLYPGWSARD	NYGKKKRRSR
EKHQESTTET	NWPRELKDGN	GQESLSMSSS	SSPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Mayer K., Wolff E., Clevers H., Ballhausen W.G. (1995). The human high mobility group (HMG)-box transcription factor TCF-1: novel isoforms due to alternative splicing and usage of a new exon IXA. Biochim. Biophys. Acta. 1263: 169—172. PMID 7640309 DOI:10.1016/0167-4781(95)00108-S
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors. Nucleic Acids Res. 29: 1410—1419. PMID 11266540 DOI:10.1093/nar/29.7.1410
van de Wetering M., Oosterwegel M.A., Dooijes D., Clevers H. (1991). Identification and cloning of TCF-1, a T lymphocyte-specific transcription factor containing a sequence-specific HMG box. EMBO J. 10: 123—132. PMID 1989880
Van de Wetering M., Castrop J., Korinek V., Clevers H. (1996). Extensive alternative splicing and dual promoter usage generate Tcf-1 protein isoforms with differential transcription control properties. Mol. Cell. Biol. 16: 745—752. PMID 8622675

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11639 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, P36402 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.