TDP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 5J3S, 5INO, 5J3P | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TDP2, AD022, EAP2, EAPII, TTRAP, dJ30M3.3, htyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605764 MGI: 1860486 HomoloGene: 9591 GeneCards: TDP2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal recessive cerebellar ataxia-epilepsy-intellectual disability syndrome due to TUD deficiency[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • single-stranded DNA binding • nuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 5'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity • manganese ion binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • magnesium ion binding • tyrosyl-RNA phosphodiesterase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • PML body • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • aggresome • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • cell surface receptor signaling pathway • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • neuron development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/81/PBB_GE_TTRAP_202266_at_fs.png/250px-PBB_GE_TTRAP_202266_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 24.65 – 24.67 Mb | Хр. 13: 25.02 – 25.03 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TDP2 (англ. Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 40 930[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MELGSCLEGG | | REAAEEEGEP | | EVKKRRLLCV | | EFASVASCDA | | AVAQCFLAEN |
DWEMERALNS | | YFEPPVEESA | | LERRPETISE | | PKTYVDLTNE | | ETTDSTTSKI |
SPSEDTQQEN | | GSMFSLITWN | | IDGLDLNNLS | | ERARGVCSYL | | ALYSPDVIFL |
QEVIPPYYSY | | LKKRSSNYEI | | ITGHEEGYFT | | AIMLKKSRVK | | LKSQEIIPFP |
STKMMRNLLC | | VHVNVSGNEL | | CLMTSHLEST | | RGHAAERMNQ | | LKMVLKKMQE |
APESATVIFA | | GDTNLRDREV | | TRCGGLPNNI | | VDVWEFLGKP | | KHCQYTWDTQ |
MNSNLGITAA | | CKLRFDRIFF | | RAAAEEGHII | | PRSLDLLGLE | | KLDCGRFPSD |
HWGLLCNLDI | | IL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ledesma F.C., El Khamisy S.F., Zuma M.C., Osborn K., Caldecott K.W. (2009). A human 5'-tyrosyl DNA phosphodiesterase that repairs topoisomerase-mediated DNA damage. Nature. 461: 674—678. PMID 19794497 DOI:10.1038/nature08444
- Zeng Z., Cortes-Ledesma F., El Khamisy S.F., Caldecott K.W. (2011). TDP2/TTRAP is the major 5'-tyrosyl DNA phosphodiesterase activity in vertebrate cells and is critical for cellular resistance to topoisomerase II-induced DNA damage. J. Biol. Chem. 286: 403—409. PMID 21030584 DOI:10.1074/jbc.M110.181016
- Varady G., Sarkadi B., Fatyol K. (2011). TTRAP is a novel component of the non-canonical TRAF6-TAK1 TGF-beta signaling pathway. PLoS ONE. 6: E25548—E25548. PMID 21980489 DOI:10.1371/journal.pone.0025548
- Gao R., Huang S.Y., Marchand C., Pommier Y. (2012). Biochemical characterization of human Tyrosyl DNA Phosphodiesterase 2 (TDP2/TTRAP): a Mg2+/Mn2+-dependent phosphodiesterase specific for the repair of topoisomerase cleavage complexes. J. Biol. Chem. 287: 30842—30852. PMID 22822062 DOI:10.1074/jbc.M112.393983
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TDP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17768 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95551 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |