TDRD7 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, tudor domain containing 7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611258 MGI: 2140279 HomoloGene: 8618 GeneCards: TDRD7 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
cataract 36[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein N-terminus binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • chromatoid body • мітохондріальний матрикс • ribonucleoprotein granule |
---|
Біологічний процес | • posttranscriptional regulation of gene expression • диференціація клітин • lens fiber cell differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • Сперматогенез |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c3/PBB_GE_TDRD7_213361_at_fs.png/250px-PBB_GE_TDRD7_213361_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001290475 NM_146142 NM_001355189 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001277404 NP_666254 NP_001342118 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 97.41 – 97.5 Mb | Хр. 4: 45.97 – 46.03 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TDRD7 (англ. Tudor domain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 098 амінокислот, а молекулярна маса — 123 586[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLEGDLVSKM | | LRAVLQSHKN | | GVALPRLQGE | | YRSLTGDWIP | | FKQLGFPTLE |
AYLRSVPAVV | | RIETSRSGEI | | TCYAMACTET | | ARIAQLVARQ | | RSSKRKTGRQ |
VNCQMRVKKT | | MPFFLEGKPK | | ATLRQPGFAS | | NFSVGKKPNP | | APLRDKGNSV |
GVKPDAEMSP | | YMLHTTLGNE | | AFKDIPVQRH | | VTMSTNNRFS | | PKASLQPPLQ |
MHLSRTSTKE | | MSDNLNQTVE | | KPNVKPPASY | | TYKMDEVQNR | | IKEILNKHNN |
GIWISKLPHF | | YKELYKEDLN | | QGILQQFEHW | | PHICTVEKPC | | SGGQDLLLYP |
AKRKQLLRSE | | LDTEKVPLSP | | LPGPKQTPPL | | KGCPTVMAGD | | FKEKVADLLV |
KYTSGLWASA | | LPKAFEEMYK | | VKFPEDALKN | | LASLSDVCSI | | DYISGNPQKA |
ILYAKLPLPT | | DKIQKDAGQA | | HGDNDIKAMV | | EQEYLQVEES | | IAESANTFME |
DITVPPLMIP | | TEASPSVLVV | | ELSNTNEVVI | | RYVGKDYSAA | | QELMEDEMKE |
YYSKNPKITP | | VQAVNVGQLL | | AVNAEEDAWL | | RAQVISTEEN | | KIKVCYVDYG |
FSENVEKSKA | | YKLNPKFCSL | | SFQATKCKLA | | GLEVLSDDPD | | LVKVVESLTC |
GKIFAVEILD | | KADIPLVVLY | | DTSGEDDINI | | NATCLKAICD | | KSLEVHLQVD |
AMYTNVKVTN | | ICSDGTLYCQ | | VPCKGLNKLS | | DLLRKIEDYF | | HCKHMTSECF |
VSLPFCGKIC | | LFHCKGKWLR | | VEITNVHSSR | | ALDVQFLDSG | | TVTSVKVSEL |
REIPPRFLQE | | MIAIPPQAIK | | CCLADLPQSI | | GMWTPDAVLW | | LRDSVLNCSD |
CSIKVTKVDE | | TRGIAHVYLF | | TPKNFPDPHR | | SINRQITNAD | | LWKHQKDVFL |
SAISSGADSP | | NSKNGNMPMS | | GNTGENFRKN | | LTDVIKKSMV | | DHTSAFSTEE |
LPPPVHLSKP | | GEHMDVYVPV | | ACHPGYFVIQ | | PWQEIHKLEV | | LMEEMILYYS |
VSEERHIAVE | | KDQVYAAKVE | | NKWHRVLLKG | | ILTNGLVSVY | | ELDYGKHELV |
NIRKVQPLVD | | MFRKLPFQAV | | TAQLAGVKCN | | QWSEEASMVF | | RNHVEKKPLV |
ALVQTVIENA | | NPWDRKVVVY | | LVDTSLPDTD | | TWIHDFMSEY | | LIELSKVN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Callebaut I., Mornon J.P. (2010). LOTUS, a new domain associated with small RNA pathways in the germline. Bioinformatics. 26: 1140—1144. PMID 20305267 DOI:10.1093/bioinformatics/btq122
- Anantharaman V., Zhang D., Aravind L. (2010). OST-HTH: a novel predicted RNA-binding domain. Biol. Direct. 5: 13—13. PMID 20302647 DOI:10.1186/1745-6150-5-13
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TDRD7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30831 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NHU6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |