TFDP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CF7

Ідентифікатори

Символи

TFDP2, DP2, transcription factor Dp-2

Зовнішні ІД

OMIM: 602160 MGI: 107167 HomoloGene: 4578 GeneCards: TFDP2

Пов'язані генетичні захворювання

захворювання нирок^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • protein domain specific binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • мітохондрія • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0007067 мітоз • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • heart development • transcription, DNA-templated • positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of G0 to G1 transition • regulation of cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7029


211586

Ensembl


ENSG00000114126


ENSMUSG00000032411

UniProt


Q14188


Q64163

RefSeq (мРНК)

NM_001178138 NM_001178139 NM_001178140 NM_001178141 NM_001178142
NM_006286 NM_001375756 NM_001375773 NM_001375774 NM_001375775 NM_001375776 NM_001375778 NM_001375779 NM_001375780

NM_001184706 NM_001184708 NM_001184709 NM_001184710 NM_001184711
NM_178667

RefSeq (білок)

NP_001171609 NP_001171610 NP_001171611 NP_001171612 NP_001171613
NP_006277 NP_001362685 NP_001362702 NP_001362703 NP_001362704 NP_001362705 NP_001362707 NP_001362708 NP_001362709


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 3: 141.94 – 142.15 Mb

Хр. 9: 96.2 – 96.32 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TFDP2 (англ. Transcription factor Dp-2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 49 236^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAKNVGLTS	TNAEVRGFID	QNLSPTKGNI	SFVAFPVSNT	NSPTKILPKT
LGPINVNVGP	QMIISTPQRL	TSSGSVLIGS	PYTPAPAMVT	QTHIAEATGW
VPGDRKRARK	FIDSDFSESK	RSKKGDKNGK	GLRHFSMKVC	EKVQRKGTTS
YNEVADELVS	EFTNSNNHLA	ADSAYDQKNI	RRRVYDALNV	LMAMNIISKE
KKEIKWIGLP	TNSAQECQNL	EIEKQRRIER	IKQKRAQLQE	LLLQQIAFKN
LVQRNRQNEQ	QNQGPPALNS	TIQLPFIIIN	TSRKTVIDCS	ISSDKFEYLF
NFDNTFEIHD	DIEVLKRMGM	SFGLESGKCS	LEDLKLAKSL	VPKALEGYIT
DISTGPSWLN	QGLLLNSTQS	VSNLDLTTGA	TLPQSSVNQG	LCLDAEVALA
TGQFLAPNSH	QSSSAASHCS	ESRGETPCSF	NDEDEEDDEE	DSSSPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Wu C.-L., Zukerberg L.R., Ngwu C., Harlow E., Lees J.A. (1995). In vivo association of E2F and DP family proteins. Mol. Cell. Biol. 15: 2536—2546. PMID 7739537 DOI:10.1128/MCB.15.5.2536
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rogers K.T., Higgins P.D.R., Milla M.M., Phillips R.S., Horowitz J.M. (1996). DP-2, a heterodimeric partner of E2F: identification and characterization of DP-2 proteins expressed in vivo. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 7594—7599. PMID 8755520 DOI:10.1073/pnas.93.15.7594
Rubin S.M., Gall A.-L., Zheng N., Pavletich N.P. (2005). Structure of the Rb C-terminal domain bound to E2F1-DP1: a mechanism for phosphorylation-induced E2F release. Cell. 123: 1093—1106. PMID 16360038 DOI:10.1016/j.cell.2005.09.044
Zaragoza K., Begay V., Schuetz A., Heinemann U., Leutz A. (2010). Repression of transcriptional activity of C/EBPalpha by E2F-dimerization partner complexes. Mol. Cell. Biol. 30: 2293—2304. PMID 20176812 DOI:10.1128/MCB.01619-09
Zheng N., Fraenkel E., Pabo C.O., Pavletich N.P. (1999). Structural basis of DNA recognition by the heterodimeric cell cycle transcription factor E2F-DP. Genes Dev. 13: 666—674. PMID 10090723 DOI:10.1101/gad.13.6.666

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TFDP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11751 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q14188 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.