TGFB1I1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KLA, 1KLC, 1KLD, 3KFD, 4KV5

Ідентифікатори

Символи

TGFB1I1, ARA55, HIC-5, HIC5, TSC-5, transforming growth factor beta 1 induced transcript 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602353 MGI: 102784 HomoloGene: 7572 GeneCards: TGFB1I1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• I-SMAD binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • Roundabout binding • GO:0001104 transcription coregulator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • focal adhesion • nuclear matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • цитоскелет • клітинне ядро • collagen-containing extracellular matrix • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• androgen receptor signaling pathway • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • диференціація клітин • response to heat • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • адгезія клітин • negative regulation of cell population proliferation • morphogenesis of embryonic epithelium • epithelial cell differentiation • cell fate commitment • negative regulation of fat cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7041


21804

Ensembl


ENSG00000140682


ENSMUSG00000030782

UniProt


O43294


Q62219

RefSeq (мРНК)


NM_015927 NM_001042454 NM_001164719


NM_001289550 NM_001289551 NM_001289552 NM_001289553 NM_009365

RefSeq (білок)


NP_001035919 NP_001158191 NP_057011 NP_001158191.1 NP_057011.2


NP_001276479 NP_001276480 NP_001276481 NP_001276482

Локус (UCSC)

Хр. 16: 31.47 – 31.48 Mb

Хр. 7: 127.85 – 127.85 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TGFB1I1 (англ. Transforming growth factor beta 1 induced transcript 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 49 814^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDLDALLSD	LETTTSHMPR	SGAPKERPAE	PLTPPPSYGH	QPQTGSGESS
GASGDKDHLY	STVCKPRSPK	PAAPAAPPFS	SSSGVLGTGL	CELDRLLQEL
NATQFNITDE	IMSQFPSSKV	ASGEQKEDQS	EDKKRPSLPS	SPSPGLPKAS
ATSATLELDR	LMASLSDFRV	QNHLPASGPT	QPPVVSSTNE	GSPSPPEPTG
KGSLDTMLGL	LQSDLSRRGV	PTQAKGLCGS	CNKPIAGQVV	TALGRAWHPE
HFVCGGCSTA	LGGSSFFEKD	GAPFCPECYF	ERFSPRCGFC	NQPIRHKMVT
ALGTHWHPEH	FCCVSCGEPF	GDEGFHEREG	RPYCRRDFLQ	LFAPRCQGCQ
GPILDNYISA	LSALWHPDCF	VCRECFAPFS	GGSFFEHEGR	PLCENHFHAR
RGSLCATCGL	PVTGRCVSAL	GRRFHPDHFT	CTFCLRPLTK	GSFQERAGKP
YCQPCFLKLF	G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ishino M., Aoto H., Sasaski H., Suzuki R., Sasaki T. (2000). Phosphorylation of Hic-5 at tyrosine 60 by CAKbeta and Fyn. FEBS Lett. 474: 179—183. PMID 10838081 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01597-0
Zhang J., Zhang L.-X., Meltzer P.S., Barrett J.C., Trent J.M. (2000). Molecular cloning of human Hic-5, a potential regulator involved in signal transduction and cellular senescence. Mol. Carcinog. 27: 177—183. PMID 10708479 DOI:10.1002/(SICI)1098-2744(200003)27:3<177::AID-MC4>3.3.CO;2-J
Nishiya N., Tachibana K., Shibanuma M., Mashimo J.I., Nose K. (2001). Hic-5-reduced cell spreading on fibronectin: competitive effects between paxillin and Hic-5 through interaction with focal adhesion kinase. Mol. Cell. Biol. 21: 5332—5345. PMID 11463817 DOI:10.1128/MCB.21.16.5332-5345.2001
Fujimoto N., Mizokami A., Harada S., Matsumoto T. (2001). Different expression of androgen receptor coactivators in human prostate. Urology. 58: 289—294. PMID 11489729 DOI:10.1016/S0090-4295(01)01117-7
Kim-Kaneyama J.-R., Shibanuma M., Nose K. (2002). Transcriptional activation of the c-fos gene by a LIM protein, Hic-5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 299: 360—365. PMID 12445807 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02644-X

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11767 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O43294 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.