THBS2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YO8, 2RHP

Ідентифікатори

Символи

THBS2, TSP2, thrombospondin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 188061 MGI: 98738 HomoloGene: 2438 GeneCards: THBS2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heparin binding • extracellular matrix structural constituent
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця • platelet alpha granule • базальна мембрана • extracellular region • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• positive regulation of synapse assembly • negative regulation of angiogenesis • адгезія клітин • extracellular matrix organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7058


21826

Ensembl


ENSG00000186340


ENSMUSG00000023885

UniProt


P35442


Q03350

RefSeq (мРНК)


NM_003247


NM_011581

RefSeq (білок)


NP_003238 NP_001368868 NP_001368869 NP_001368870 NP_001368871


NP_035711

Локус (UCSC)

Хр. 6: 169.22 – 169.25 Mb

Хр. 17: 14.89 – 14.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

THBS2 (англ. Thrombospondin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 172 амінокислот, а молекулярна маса — 129 991^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWRLVLLAL	WVWPSTQAGH	QDKDTTFDLF	SISNINRKTI	GAKQFRGPDP
GVPAYRFVRF	DYIPPVNADD	LSKITKIMRQ	KEGFFLTAQL	KQDGKSRGTL
LALEGPGLSQ	RQFEIVSNGP	ADTLDLTYWI	DGTRHVVSLE	DVGLADSQWK
NVTVQVAGET	YSLHVGCDLI	DSFALDEPFY	EHLQAEKSRM	YVAKGSARES
HFRGLLQNVH	LVFENSVEDI	LSKKGCQQGQ	GAEINAISEN	TETLRLGPHV
TTEYVGPSSE	RRPEVCERSC	EELGNMVQEL	SGLHVLVNQL	SENLKRVSND
NQFLWELIGG	PPKTRNMSAC	WQDGRFFAEN	ETWVVDSCTT	CTCKKFKTIC
HQITCPPATC	ASPSFVEGEC	CPSCLHSVDG	EEGWSPWAEW	TQCSVTCGSG
TQQRGRSCDV	TSNTCLGPSI	QTRACSLSKC	DTRIRQDGGW	SHWSPWSSCS
VTCGVGNITR	IRLCNSPVPQ	MGGKNCKGSG	RETKACQGAP	CPIDGRWSPW
SPWSACTVTC	AGGIRERTRV	CNSPEPQYGG	KACVGDVQER	QMCNKRSCPV
DGCLSNPCFP	GAQCSSFPDG	SWSCGSCPVG	FLGNGTHCED	LDECALVPDI
CFSTSKVPRC	VNTQPGFHCL	PCPPRYRGNQ	PVGVGLEAAK	TEKQVCEPEN
PCKDKTHNCH	KHAECIYLGH	FSDPMYKCEC	QTGYAGDGLI	CGEDSDLDGW
PNLNLVCATN	ATYHCIKDNC	PHLPNSGQED	FDKDGIGDAC	DDDDDNDGVT
DEKDNCQLLF	NPRQADYDKD	EVGDRCDNCP	YVHNPAQIDT	DNNGEGDACS
VDIDGDDVFN	ERDNCPYVYN	TDQRDTDGDG	VGDHCDNCPL	VHNPDQTDVD
NDLVGDQCDN	NEDIDDDGHQ	NNQDNCPYIS	NANQADHDRD	GQGDACDPDD
DNDGVPDDRD	NCRLVFNPDQ	EDLDGDGRGD	ICKDDFDNDN	IPDIDDVCPE
NNAISETDFR	NFQMVPLDPK	GTTQIDPNWV	IRHQGKELVQ	TANSDPGIAV
GFDEFGSVDF	SGTFYVNTDR	DDDYAGFVFG	YQSSSRFYVV	MWKQVTQTYW
EDQPTRAYGY	SGVSLKVVNS	TTGTGEHLRN	ALWHTGNTPG	QVRTLWHDPR
NIGWKDYTAY	RWHLTHRPKT	GYIRVLVHEG	KQVMADSGPI	YDQTYAGGRL
GLFVFSQEMV	YFSDLKYECR	DI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину.

Література

Labell T.L., Byers P.H. (1993). Sequence and characterization of the complete human thrombospondin 2 cDNA: potential regulatory role for the 3' untranslated region. Genomics. 17: 225—229. PMID 8406456 DOI:10.1006/geno.1993.1308
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Labell T.L., McGookey Milewicz D.J., Disteche C.M., Byers P.H. (1992). Thrombospondin II: partial cDNA sequence, chromosome location, and expression of a second member of the thrombospondin gene family in humans. Genomics. 12: 421—429. PMID 1559694 DOI:10.1016/0888-7543(92)90430-Z
Asch A.S., Silbiger S., Heimer E., Nachman R.L. (1992). Thrombospondin sequence motif (CSVTCG) is responsible for CD36 binding. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 1208—1217. PMID 1371676 DOI:10.1016/0006-291X(92)91860-S
Misenheimer T.M., Hahr A.J., Harms A.C., Annis D.S., Mosher D.F. (2001). Disulfide connectivity of recombinant C-terminal region of human thrombospondin 2. J. Biol. Chem. 276: 45882—45887. PMID 11590138 DOI:10.1074/jbc.M104218200
Carlson C.B., Liu Y., Keck J.L., Mosher D.F. (2008). Influences of the N700S thrombospondin-1 polymorphism on protein structure and stability. J. Biol. Chem. 283: 20069—20076. PMID 18499674 DOI:10.1074/jbc.M800223200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11786 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P35442 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.