THBS2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/58/Protein_THBS2_PDB_1yo8.png/250px-Protein_THBS2_PDB_1yo8.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YO8, 2RHP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | THBS2, TSP2, thrombospondin 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 188061 MGI: 98738 HomoloGene: 2438 GeneCards: THBS2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heparin binding • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • platelet alpha granule • базальна мембрана • extracellular region • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of synapse assembly • negative regulation of angiogenesis • адгезія клітин • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/ad/PBB_GE_THBS2_203083_at_fs.png/250px-PBB_GE_THBS2_203083_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_003238 NP_001368868 NP_001368869 NP_001368870 NP_001368871 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 169.22 – 169.25 Mb | Хр. 17: 14.89 – 14.91 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
THBS2 (англ. Thrombospondin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 172 амінокислот, а молекулярна маса — 129 991[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVWRLVLLAL | | WVWPSTQAGH | | QDKDTTFDLF | | SISNINRKTI | | GAKQFRGPDP |
GVPAYRFVRF | | DYIPPVNADD | | LSKITKIMRQ | | KEGFFLTAQL | | KQDGKSRGTL |
LALEGPGLSQ | | RQFEIVSNGP | | ADTLDLTYWI | | DGTRHVVSLE | | DVGLADSQWK |
NVTVQVAGET | | YSLHVGCDLI | | DSFALDEPFY | | EHLQAEKSRM | | YVAKGSARES |
HFRGLLQNVH | | LVFENSVEDI | | LSKKGCQQGQ | | GAEINAISEN | | TETLRLGPHV |
TTEYVGPSSE | | RRPEVCERSC | | EELGNMVQEL | | SGLHVLVNQL | | SENLKRVSND |
NQFLWELIGG | | PPKTRNMSAC | | WQDGRFFAEN | | ETWVVDSCTT | | CTCKKFKTIC |
HQITCPPATC | | ASPSFVEGEC | | CPSCLHSVDG | | EEGWSPWAEW | | TQCSVTCGSG |
TQQRGRSCDV | | TSNTCLGPSI | | QTRACSLSKC | | DTRIRQDGGW | | SHWSPWSSCS |
VTCGVGNITR | | IRLCNSPVPQ | | MGGKNCKGSG | | RETKACQGAP | | CPIDGRWSPW |
SPWSACTVTC | | AGGIRERTRV | | CNSPEPQYGG | | KACVGDVQER | | QMCNKRSCPV |
DGCLSNPCFP | | GAQCSSFPDG | | SWSCGSCPVG | | FLGNGTHCED | | LDECALVPDI |
CFSTSKVPRC | | VNTQPGFHCL | | PCPPRYRGNQ | | PVGVGLEAAK | | TEKQVCEPEN |
PCKDKTHNCH | | KHAECIYLGH | | FSDPMYKCEC | | QTGYAGDGLI | | CGEDSDLDGW |
PNLNLVCATN | | ATYHCIKDNC | | PHLPNSGQED | | FDKDGIGDAC | | DDDDDNDGVT |
DEKDNCQLLF | | NPRQADYDKD | | EVGDRCDNCP | | YVHNPAQIDT | | DNNGEGDACS |
VDIDGDDVFN | | ERDNCPYVYN | | TDQRDTDGDG | | VGDHCDNCPL | | VHNPDQTDVD |
NDLVGDQCDN | | NEDIDDDGHQ | | NNQDNCPYIS | | NANQADHDRD | | GQGDACDPDD |
DNDGVPDDRD | | NCRLVFNPDQ | | EDLDGDGRGD | | ICKDDFDNDN | | IPDIDDVCPE |
NNAISETDFR | | NFQMVPLDPK | | GTTQIDPNWV | | IRHQGKELVQ | | TANSDPGIAV |
GFDEFGSVDF | | SGTFYVNTDR | | DDDYAGFVFG | | YQSSSRFYVV | | MWKQVTQTYW |
EDQPTRAYGY | | SGVSLKVVNS | | TTGTGEHLRN | | ALWHTGNTPG | | QVRTLWHDPR |
NIGWKDYTAY | | RWHLTHRPKT | | GYIRVLVHEG | | KQVMADSGPI | | YDQTYAGGRL |
GLFVFSQEMV | | YFSDLKYECR | | DI |
Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину.
Література
- Labell T.L., Byers P.H. (1993). Sequence and characterization of the complete human thrombospondin 2 cDNA: potential regulatory role for the 3' untranslated region. Genomics. 17: 225—229. PMID 8406456 DOI:10.1006/geno.1993.1308
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Labell T.L., McGookey Milewicz D.J., Disteche C.M., Byers P.H. (1992). Thrombospondin II: partial cDNA sequence, chromosome location, and expression of a second member of the thrombospondin gene family in humans. Genomics. 12: 421—429. PMID 1559694 DOI:10.1016/0888-7543(92)90430-Z
- Asch A.S., Silbiger S., Heimer E., Nachman R.L. (1992). Thrombospondin sequence motif (CSVTCG) is responsible for CD36 binding. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 1208—1217. PMID 1371676 DOI:10.1016/0006-291X(92)91860-S
- Misenheimer T.M., Hahr A.J., Harms A.C., Annis D.S., Mosher D.F. (2001). Disulfide connectivity of recombinant C-terminal region of human thrombospondin 2. J. Biol. Chem. 276: 45882—45887. PMID 11590138 DOI:10.1074/jbc.M104218200
- Carlson C.B., Liu Y., Keck J.L., Mosher D.F. (2008). Influences of the N700S thrombospondin-1 polymorphism on protein structure and stability. J. Biol. Chem. 283: 20069—20076. PMID 18499674 DOI:10.1074/jbc.M800223200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11786 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P35442 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |