TNC
TNC | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TNC, 150-225, DFNA56, GMEM, GP, HXB, JI, TN, TN-C, Tenascin C | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 187380 MGI: 101922 HomoloGene: 55636 GeneCards: TNC | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
рак простати, autosomal dominant nonsyndromic deafness 56[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 115.02 – 115.12 Mb | Хр. 4: 63.88 – 63.97 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
TNC (англ. Tenascin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 201 амінокислот, а молекулярна маса — 240 853[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGAMTQLLAG | VFLAFLALAT | EGGVLKKVIR | HKRQSGVNAT | LPEENQPVVF | ||||
NHVYNIKLPV | GSQCSVDLES | ASGEKDLAPP | SEPSESFQEH | TVDGENQIVF | ||||
THRINIPRRA | CGCAAAPDVK | ELLSRLEELE | NLVSSLREQC | TAGAGCCLQP | ||||
ATGRLDTRPF | CSGRGNFSTE | GCGCVCEPGW | KGPNCSEPEC | PGNCHLRGRC | ||||
IDGQCICDDG | FTGEDCSQLA | CPSDCNDQGK | CVNGVCICFE | GYAGADCSRE | ||||
ICPVPCSEEH | GTCVDGLCVC | HDGFAGDDCN | KPLCLNNCYN | RGRCVENECV | ||||
CDEGFTGEDC | SELICPNDCF | DRGRCINGTC | YCEEGFTGED | CGKPTCPHAC | ||||
HTQGRCEEGQ | CVCDEGFAGV | DCSEKRCPAD | CHNRGRCVDG | RCECDDGFTG | ||||
ADCGELKCPN | GCSGHGRCVN | GQCVCDEGYT | GEDCSQLRCP | NDCHSRGRCV | ||||
EGKCVCEQGF | KGYDCSDMSC | PNDCHQHGRC | VNGMCVCDDG | YTGEDCRDRQ | ||||
CPRDCSNRGL | CVDGQCVCED | GFTGPDCAEL | SCPNDCHGQG | RCVNGQCVCH | ||||
EGFMGKDCKE | QRCPSDCHGQ | GRCVDGQCIC | HEGFTGLDCG | QHSCPSDCNN | ||||
LGQCVSGRCI | CNEGYSGEDC | SEVSPPKDLV | VTEVTEETVN | LAWDNEMRVT | ||||
EYLVVYTPTH | EGGLEMQFRV | PGDQTSTIIQ | ELEPGVEYFI | RVFAILENKK | ||||
SIPVSARVAT | YLPAPEGLKF | KSIKETSVEV | EWDPLDIAFE | TWEIIFRNMN | ||||
KEDEGEITKS | LRRPETSYRQ | TGLAPGQEYE | ISLHIVKNNT | RGPGLKRVTT | ||||
TRLDAPSQIE | VKDVTDTTAL | ITWFKPLAEI | DGIELTYGIK | DVPGDRTTID | ||||
LTEDENQYSI | GNLKPDTEYE | VSLISRRGDM | SSNPAKETFT | TGLDAPRNLR | ||||
RVSQTDNSIT | LEWRNGKAAI | DSYRIKYAPI | SGGDHAEVDV | PKSQQATTKT | ||||
TLTGLRPGTE | YGIGVSAVKE | DKESNPATIN | AATELDTPKD | LQVSETAETS | ||||
LTLLWKTPLA | KFDRYRLNYS | LPTGQWVGVQ | LPRNTTSYVL | RGLEPGQEYN | ||||
VLLTAEKGRH | KSKPARVKAS | TEQAPELENL | TVTEVGWDGL | RLNWTAADQA | ||||
YEHFIIQVQE | ANKVEAARNL | TVPGSLRAVD | IPGLKAATPY | TVSIYGVIQG | ||||
YRTPVLSAEA | STGETPNLGE | VVVAEVGWDA | LKLNWTAPEG | AYEYFFIQVQ | ||||
EADTVEAAQN | LTVPGGLRST | DLPGLKAATH | YTITIRGVTQ | DFSTTPLSVE | ||||
VLTEEVPDMG | NLTVTEVSWD | ALRLNWTTPD | GTYDQFTIQV | QEADQVEEAH | ||||
NLTVPGSLRS | MEIPGLRAGT | PYTVTLHGEV | RGHSTRPLAV | EVVTEDLPQL | ||||
GDLAVSEVGW | DGLRLNWTAA | DNAYEHFVIQ | VQEVNKVEAA | QNLTLPGSLR | ||||
AVDIPGLEAA | TPYRVSIYGV | IRGYRTPVLS | AEASTAKEPE | IGNLNVSDIT | ||||
PESFNLSWMA | TDGIFETFTI | EIIDSNRLLE | TVEYNISGAE | RTAHISGLPP | ||||
STDFIVYLSG | LAPSIRTKTI | SATATTEALP | LLENLTISDI | NPYGFTVSWM | ||||
ASENAFDSFL | VTVVDSGKLL | DPQEFTLSGT | QRKLELRGLI | TGIGYEVMVS | ||||
GFTQGHQTKP | LRAEIVTEAE | PEVDNLLVSD | ATPDGFRLSW | TADEGVFDNF | ||||
VLKIRDTKKQ | SEPLEITLLA | PERTRDITGL | REATEYEIEL | YGISKGRRSQ | ||||
TVSAIATTAM | GSPKEVIFSD | ITENSATVSW | RAPTAQVESF | RITYVPITGG | ||||
TPSMVTVDGT | KTQTRLVKLI | PGVEYLVSII | AMKGFEESEP | VSGSFTTALD | ||||
GPSGLVTANI | TDSEALARWQ | PAIATVDSYV | ISYTGEKVPE | ITRTVSGNTV | ||||
EYALTDLEPA | TEYTLRIFAE | KGPQKSSTIT | AKFTTDLDSP | RDLTATEVQS | ||||
ETALLTWRPP | RASVTGYLLV | YESVDGTVKE | VIVGPDTTSY | SLADLSPSTH | ||||
YTAKIQALNG | PLRSNMIQTI | FTTIGLLYPF | PKDCSQAMLN | GDTTSGLYTI | ||||
YLNGDKAEAL | EVFCDMTSDG | GGWIVFLRRK | NGRENFYQNW | KAYAAGFGDR | ||||
REEFWLGLDN | LNKITAQGQY | ELRVDLRDHG | ETAFAVYDKF | SVGDAKTRYK | ||||
LKVEGYSGTA | GDSMAYHNGR | SFSTFDKDTD | SAITNCALSY | KGAFWYRNCH | ||||
RVNLMGRYGD | NNHSQGVNWF | HWKGHEHSIQ | FAEMKLRPSN | FRNLEGRRKR | ||||
A |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Glumoff V., Savontaus M., Vehanen J., Vuorio E. (1994). Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 613—622. PMID 7524681 DOI:10.1016/0167-4781(94)90220-8
- Gulcher J.R., Nies D.E., Marton L.S., Stefansson K. (1989). An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N-glycosylation sites. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 1588—1592. PMID 2466295 DOI:10.1073/pnas.86.5.1588
- Burg M.A., Tillet E., Timpl R., Stallcup W.B. (1996). Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules. J. Biol. Chem. 271: 26110—26116. PMID 8824254 DOI:10.1074/jbc.271.42.26110
- Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
- Leahy D.J., Hendrickson W.A., Aukhil I., Erickson H.P. (1992). Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein. Science. 258: 987—991. PMID 1279805 DOI:10.1126/science.1279805
- Nies D.E., Hemesath T.J., Kim J.H., Gulcher J.R., Stefansson K. (1991). The complete cDNA sequence of human hexabrachion (Tenascin). A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats. J. Biol. Chem. 266: 2818—2823. PMID 1704365
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5318 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P24821 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 9
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |