TNPO3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4C0O, 4C0P, 4C0Q, 4OL0

Ідентифікатори

Символи

TNPO3, IPO12, LGMD1F, MTR10A, TRN-SR, TRN-SR2, TRNSR, transportin 3, LGMDD2

Зовнішні ІД

OMIM: 610032 MGI: 1196412 HomoloGene: 40848 GeneCards: TNPO3

Пов'язані генетичні захворювання

системний червоний вовчак, autosomal dominant limb-girdle muscular dystrophy type 1F^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclear localization sequence binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • signaling receptor activity • nuclear import signal receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро
Біологічний процес	• protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein import into nucleus • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23534


320938

Ensembl


ENSG00000064419


ENSMUSG00000012535

UniProt


Q9Y5L0


Q6P2B1

RefSeq (мРНК)


NM_001191028 NM_012470


NM_177296 NM_001347079 NM_001361290

RefSeq (білок)

NP_001177957 NP_036602 NP_001369145 NP_001369146 NP_001369147
NP_001369148 NP_001369149 NP_001369150 NP_001369151 NP_001369152 NP_036602.1


NP_001334008 NP_796270 NP_001348219

Локус (UCSC)

Хр. 7: 128.95 – 129.06 Mb

Хр. 6: 29.54 – 29.61 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNPO3 (англ. Transportin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 104 203^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGAKPTLQL	VYQAVQALYH	DPDPSGKERA	SFWLGELQRS	VHAWEISDQL
LQIRQDVESC	YFAAQTMKMK	IQTSFYELPT	DSHASLRDSL	LTHIQNLKDL
SPVIVTQLAL	AIADLALQMP	SWKGCVQTLV	EKYSNDVTSL	PFLLEILTVL
PEEVHSRSLR	IGANRRTEII	EDLAFYSSTV	VSLLMTCVEK	AGTDEKMLMK
VFRCLGSWFN	LGVLDSNFMA	NNKLLALLFE	VLQQDKTSSN	LHEAASDCVC
SALYAIENVE	TNLPLAMQLF	QGVLTLETAY	HMAVAREDLD	KVLNYCRIFT
ELCETFLEKI	VCTPGQGLGD	LRTLELLLIC	AGHPQYEVVE	ISFNFWYRLG
EHLYKTNDEV	IHGIFKAYIQ	RLLHALARHC	QLEPDHEGVP	EETDDFGEFR
MRVSDLVKDL	IFLIGSMECF	AQLYSTLKEG	NPPWEVTEAV	LFIMAAIAKS
VDPENNPTLV	EVLEGVVRLP	ETVHTAVRYT	SIELVGEMSE	VVDRNPQFLD
PVLGYLMKGL	CEKPLASAAA	KAIHNICSVC	RDHMAQHFNG	LLEIARSLDS
FLLSPEAAVG	LLKGTALVLA	RLPLDKITEC	LSELCSVQVM	ALKKLLSQEP
SNGISSDPTV	FLDRLAVIFR	HTNPIVENGQ	THPCQKVIQE	IWPVLSETLN
KHRADNRIVE	RCCRCLRFAV	RCVGKGSAAL	LQPLVTQMVN	VYHVHQHSCF
LYLGSILVDE	YGMEEGCRQG	LLDMLQALCI	PTFQLLEQQN	GLQNHPDTVD
DLFRLATRFI	QRSPVTLLRS	QVVIPILQWA	IASTTLDHRD	ANCSVMRFLR
DLIHTGVAND	HEEDFELRKE	LIGQVMNQLG	QQLVSQLLHT	CCFCLPPYTL
PDVAEVLWEI	MQVDRPTFCR	WLENSLKGLP	KETTVGAVTV	THKQLTDFHK
QVTSAEECKQ	VCWALRDFTR	LFR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Kataoka N., Bachorik J.L., Dreyfuss G. (1999). Transportin-SR, a nuclear import receptor for SR proteins. J. Cell Biol. 145: 1145—1152. PMID 10366588 DOI:10.1083/jcb.145.6.1145
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lai M.-C., Lin R.-I., Huang S.-Y., Tsai C.-W., Tarn W.-Y. (2000). A human importin-beta family protein, transportin-SR2, interacts with the phosphorylated RS domain of SR proteins. J. Biol. Chem. 275: 7950—7957. PMID 10713112 DOI:10.1074/jbc.275.11.7950
Lai M.-C., Lin R.-I., Tarn W.-Y. (2001). Transportin-SR2 mediates nuclear import of phosphorylated SR proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10154—10159. PMID 11517331 DOI:10.1073/pnas.181354098
Lai M.-C., Kuo H.-W., Chang W.-C., Tarn W.-Y. (2003). A novel splicing regulator shares a nuclear import pathway with SR proteins. EMBO J. 22: 1359—1369. PMID 12628928 DOI:10.1093/emboj/cdg126

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNPO3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17103 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5L0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.