TONSL |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TONSL, IKBR, NFKBIL2, tonsoku-like, DNA repair protein, tonsoku like, DNA repair protein, SEMDSP |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604546 MGI: 1919999 HomoloGene: 22754 GeneCards: TONSL |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
spondyloepimetaphyseal dysplasia, Sponastrime type[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • DNA replication factor A complex • nuclear replication fork • MCM complex • клітинне ядро • FACT complex • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • cytoplasmic sequestering of transcription factor • double-strand break repair via homologous recombination • replication fork processing • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 144.43 – 144.44 Mb | Хр. 15: 76.51 – 76.52 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TONSL (англ. Tonsoku like, DNA repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 378 амінокислот, а молекулярна маса — 150 929[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLERELRQL | | SKAKAKAQRA | | GQRREEAALC | | HQLGELLAGH | | GRYAEALEQH |
WQELQLRERA | | DDPLGCAVAH | | RKIGERLAEM | | EDYPAALQHQ | | HQYLELAHSL |
RNHTELQRAW | | ATIGRTHLDI | | YDHCQSRDAL | | LQAQAAFEKS | | LAIVDEELEG |
TLAQGELNEM | | RTRLYLNLGL | | TFESLQQTAL | | CNDYFRKSIF | | LAEQNHLYED |
LFRARYNLGT | | IHWRAGQHSQ | | AMRCLEGARE | | CAHTMRKRFM | | ESECCVVIAQ |
VLQDLGDFLA | | AKRALKKAYR | | LGSQKPVQRA | | AICQNLQHVL | | AVVRLQQQLE |
EAEGRDPQGA | | MVICEQLGDL | | FSKAGDFPRA | | AEAYQKQLRF | | AELLDRPGAE |
RAIIHVSLAT | | TLGDMKDHHG | | AVRHYEEELR | | LRSGNVLEEA | | KTWLNIALSR |
EEAGDAYELL | | APCFQKALSC | | AQQAQRPQLQ | | RQVLQHLHTV | | QLRLQPQEAP |
ETETRLRELS | | VAEDEDEEEE | | AEEAAATAES | | EALEAGEVEL | | SEGEDDTDGL |
TPQLEEDEEL | | QGHLGRRKGS | | KWNRRNDMGE | | TLLHRACIEG | | QLRRVQDLVR |
QGHPLNPRDY | | CGWTPLHEAC | | NYGHLEIVRF | | LLDHGAAVDD | | PGGQGCEGIT |
PLHDALNCGH | | FEVAELLLER | | GASVTLRTRK | | GLSPLETLQQ | | WVKLYRRDLD |
LETRQKARAM | | EMLLQAAASG | | QDPHSSQAFH | | TPSSLLFDPE | | TSPPLSPCPE |
PPSNSTRLPE | | ASQAHVRVSP | | GQAAPAMARP | | RRSRHGPASS | | SSSSEGEDSA |
GPARPSQKRP | | RCSATAQRVA | | AWTPGPASNR | | EAATASTSRA | | AYQAAIRGVG |
SAQSRLGPGP | | PRGHSKALAP | | QAALIPEEEC | | LAGDWLELDM | | PLTRSRRPRP |
RGTGDNRRPS | | STSGSDSEES | | RPRARAKQVR | | LTCMQSCSAP | | VNAGPSSLAS |
EPPGSPSTPR | | VSEPSGDSSA | | AGQPLGPAPP | | PPIRVRVQVQ | | DHLFLIPVPH |
SSDTHSVAWL | | AEQAAQRYYQ | | TCGLLPRLTL | | RKEGALLAPQ | | DLIPDVLQSN |
DEVLAEVTSW | | DLPPLTDRYR | | RACQSLGQGE | | HQQVLQAVEL | | QGLGLSFSAC |
SLALDQAQLT | | PLLRALKLHT | | ALRELRLAGN | | RLGDKCVAEL | | VAALGTMPSL |
ALLDLSSNHL | | GPEGLRQLAM | | GLPGQATLQS | | LEELDLSMNP | | LGDGCGQSLA |
SLLHACPLLS | | TLRLQACGFG | | PSFFLSHQTA | | LGSAFQDAEH | | LKTLSLSYNA |
LGAPALARTL | | QSLPAGTLLH | | LELSSVAAGK | | GDSDLMEPVF | | RYLAKEGCAL |
AHLTLSANHL | | GDKAVRDLCR | | CLSLCPSLIS | | LDLSANPEIS | | CASLEELLST |
LQKRPQGLSF | | LGLSGCAVQG | | PLGLGLWDKI | | AAQLRELQLC | | SRRLCAEDRD |
ALRQLQPSRP | | GPGECTLDHG | | SKLFFRRL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Ray P., Zhang D.H., Elias J.A., Ray A. (1995). Cloning of a differentially expressed I kappa B-related protein. J. Biol. Chem. 270: 10680—10685. PMID 7738005 DOI:10.1074/jbc.270.18.10680
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Norman D.A., Barton P.J. (2000). Isolation, sequence, and chromosomal localisation of the human IkappaBR gene (NFKBIL2). Ann. Hum. Genet. 64: 15—23. PMID 11246458 DOI:10.1046/j.1469-1809.2000.6410015.x
- Ray P., Yang L., Zhang D.H., Ghosh S.K., Ray A. (1997). Selective up-regulation of cytokine-induced RANTES gene expression in lung epithelial cells by overexpression of IkappaBR. J. Biol. Chem. 272: 20191—20197. PMID 9242696 DOI:10.1074/jbc.272.32.20191
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TONSL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7801 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96HA7 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |