TRA2A : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRA2A

Ідентифікатори

Символи

TRA2A, AWMS1, HSU53209, transformer 2 alpha homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 602718 MGI: 1933972 HomoloGene: 40866 GeneCards: TRA2A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29896


101214

Ensembl


ENSG00000164548


ENSMUSG00000029817

UniProt


Q13595


Q6PFR5

RefSeq (мРНК)

NM_001282757 NM_001282758 NM_001282759 NM_013293 NM_001362759
NM_001362760 NM_001362761


NM_198102 NM_001347209 NM_001362188

RefSeq (білок)

NP_001269686 NP_001269687 NP_001269688 NP_037425 NP_001349688
NP_001349689 NP_001349690


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 7: 23.5 – 23.53 Mb

Хр. 6: 49.22 – 49.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRA2A (англ. Transformer 2 alpha homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 32 689^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDVEENNFE	GRESRSQSKS	PTGTPARVKS	ESRSGSRSPS	RVSKHSESHS
RSRSKSRSRS	RRHSHRRYTR	SRSHSHSHRR	RSRSRSYTPE	YRRRRSRSHS
PMSNRRRHTG	SRANPDPNTC	LGVFGLSLYT	TERDLREVFS	RYGPLSGVNV
VYDQRTGRSR	GFAFVYFERI	DDSKEAMERA	NGMELDGRRI	RVDYSITKRA
HTPTPGIYMG	RPTHSGGGGG	GGGGGGGGGG	GRRRDSYYDR	GYDRGYDRYE
DYDYRYRRRS	PSPYYSRYRS	RSRSRSYSPR	RY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dauwalder B., Amaya-Manzanares F., Mattox W. (1996). A human homologue of the Drosophila sex determination factor transformer-2 has conserved splicing regulatory functions. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 9004—9009. PMID 8799144 DOI:10.1073/pnas.93.17.9004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tacke R., Tohyama M., Ogawa S., Manley J.L. (1998). Human Tra2 proteins are sequence-specific activators of pre-mRNA splicing. Cell. 93: 139—148. PMID 9546399 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81153-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16645 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13595 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.