TRAF3IP2

Ідентифікатори

Символи

TRAF3IP2, ACT1, C6orf2, C6orf4, C6orf5, C6orf6, CANDF8, CIKS, PSORS13, TRAF3 interacting protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607043 MGI: 2143599 HomoloGene: 15885 GeneCards: TRAF3IP2

Реагує на сполуку

iguratimod^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • компонент клітини
Біологічний процес	• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0007243 intracellular signal transduction • humoral immune response • B cell apoptotic process • positive regulation of defense response to virus by host
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10758


103213

Ensembl


ENSG00000056972


ENSMUSG00000019842

UniProt


O43734


Q8N7N6

RefSeq (мРНК)


NM_001164281 NM_001164282 NM_001164283 NM_147200 NM_147686


NM_134000

RefSeq (білок)


NP_001157753 NP_001157755 NP_671733 NP_679211


NP_598761

Локус (UCSC)

Хр. 6: 111.56 – 111.61 Mb

Хр. 10: 39.49 – 39.53 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAF3IP2 (англ. TRAF3 interacting protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 64 666^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPPQLQETRM	NRSIPVEVDE	SEPYPSQLLK	PIPEYSPEEE	SEPPAPNIRN
MAPNSLSAPT	MLHNSSGDFS	QAHSTLKLAN	HQRPVSRQVT	CLRTQVLEDS
EDSFCRRHPG	LGKAFPSGCS	AVSEPASESV	VGALPAEHQF	SFMEKRNQWL
VSQLSAASPD	TGHDSDKSDQ	SLPNASADSL	GGSQEMVQRP	QPHRNRAGLD
LPTIDTGYDS	QPQDVLGIRQ	LERPLPLTSV	CYPQDLPRPL	RSREFPQFEP
QRYPACAQML	PPNLSPHAPW	NYHYHCPGSP	DHQVPYGHDY	PRAAYQQVIQ
PALPGQPLPG	ASVRGLHPVQ	KVILNYPSPW	DHEERPAQRD	CSFPGLPRHQ
DQPHHQPPNR	AGAPGESLEC	PAELRPQVPQ	PPSPAAVPRP	PSNPPARGTL
KTSNLPEELR	KVFITYSMDT	AMEVVKFVNF	LLVNGFQTAI	DIFEDRIRGI
DIIKWMERYL	RDKTVMIIVA	ISPKYKQDVE	GAESQLDEDE	HGLHTKYIHR
MMQIEFIKQG	SMNFRFIPVL	FPNAKKEHVP	TWLQNTHVYS	WPKNKKNILL
RLLREEEYVA	PPRGPLPTLQ	VVPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

Morelli C., Magnanini C., Mungall A.J., Negrini M., Barbanti-Brodano G. (2000). Cloning and characterization of two overlapping genes in a subregion at 6q21 involved in replicative senescence and schizophrenia. Gene. 252: 217—225. PMID 10903453 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00231-6
Leonardi A., Chariot A., Claudio E., Cunningham K., Siebenlist U. (2000). CIKS, a connection to Ikappa B kinase and stress-activated protein kinase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 10494—10499. PMID 10962033 DOI:10.1073/pnas.190245697
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kanamori M., Kai C., Hayashizaki Y., Suzuki H. (2002). NF-kappaB activator Act1 associates with IL-1/Toll pathway adaptor molecule TRAF6. FEBS Lett. 532: 241—246. PMID 12459498 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03688-8

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з TRAF3 interacting protein 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1343 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O43734 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.