TRAF5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAF5, MGC:39780, RNF84, TNF receptor associated factor 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602356 MGI: 107548 HomoloGene: 27079 GeneCards: TRAF5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • thioesterase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • tumor necrosis factor receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • cytoplasmic side of plasma membrane • центросома • CD40 receptor complex • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/PBB_GE_TRAF5_204352_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRAF5_204352_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001033910 NM_004619 NM_145759 NM_001319207 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001029082 NP_001306136 NP_004610 NP_665702 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 211.33 – 211.37 Mb | Хр. 1: 191.73 – 191.78 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAF5 (англ. TNF receptor associated factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 64 406[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAYSEEHKGM | | PCGFIRQNSG | | NSISLDFEPS | | IEYQFVERLE | | ERYKCAFCHS |
VLHNPHQTGC | | GHRFCQHCIL | | SLRELNTVPI | | CPVDKEVIKS | | QEVFKDNCCK |
REVLNLYVYC | | SNAPGCNAKV | | ILGRYQDHLQ | | QCLFQPVQCS | | NEKCREPVLR |
KDLKEHLSAS | | CQFRKEKCLY | | CKKDVVVINL | | QNHEENLCPE | | YPVFCPNNCA |
KIILKTEVDE | | HLAVCPEAEQ | | DCPFKHYGCA | | VTDKRRNLQQ | | HEHSALREHM |
RLVLEKNVQL | | EEQISDLHKS | | LEQKESKIQQ | | LAETIKKLEK | | EFKQFAQLFG |
KNGSFLPNIQ | | VFASHIDKSA | | WLEAQVHQLL | | QMVNQQQNKF | | DLRPLMEAVD |
TVKQKITLLE | | NNDQRLAVLE | | EETNKHDTHI | | NIHKAQLSKN | | EERFKLLEGT |
CYNGKLIWKV | | TDYKMKKREA | | VDGHTVSIFS | | QSFYTSRCGY | | RLCARAYLNG |
DGSGRGSHLS | | LYFVVMRGEF | | DSLLQWPFRQ | | RVTLMLLDQS | | GKKNIMETFK |
PDPNSSSFKR | | PDGEMNIASG | | CPRFVAHSVL | | ENAKNAYIKD | | DTLFLKVAVD |
LTDLEDL |
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wajant H., Henkler F., Scheurich P. (2001). The TNF-receptor-associated factor family: scaffold molecules for cytokine receptors, kinases and their regulators. Cell. Signal. 13: 389—400. PMID 11384837 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00160-7
- Bradley J.R., Pober J.S. (2001). Tumor necrosis factor receptor-associated factors (TRAFs). Oncogene. 20: 6482—6491. PMID 11607847 DOI:10.1038/sj.onc.1204788
- Song H.Y., Regnier C.H., Kirschning C.J., Goeddel D.V., Rothe M. (1997). Tumor necrosis factor (TNF)-mediated kinase cascades: bifurcation of nuclear factor-kappaB and c-jun N-terminal kinase (JNK/SAPK) pathways at TNF receptor-associated factor 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9792—9796. PMID 9275204 DOI:10.1073/pnas.94.18.9792
- Kawamata S., Hori T., Imura A., Takaori-Kondo A., Uchiyama T. (1998). Activation of OX40 signal transduction pathways leads to tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 2- and TRAF5-mediated NF-kappaB activation. J. Biol. Chem. 273: 5808—5814. PMID 9488716 DOI:10.1074/jbc.273.10.5808
- McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12035 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O00463 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |