TRAPPC9

Ідентифікатори

Символи

TRAPPC9, IBP, IKBKBBP, MRT13, NIBP, TRS120, T1, trafficking protein particle complex 9, trafficking protein particle complex subunit 9

Зовнішні ІД

OMIM: 611966 MGI: 1923760 HomoloGene: 81931 GeneCards: TRAPPC9

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння, intellectual disability-obesity-brain malformations-facial dysmorphism syndrome, intellectual disability, autosomal recessive 13^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • Golgi membrane • TRAPP complex
Біологічний процес	• диференціація клітин • COPII vesicle coating • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • neuron differentiation • cerebral cortex development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


83696


76510

Ensembl


ENSG00000167632


ENSMUSG00000047921

UniProt


Q96Q05


Q3U0M1

RefSeq (мРНК)

NM_001160372 NM_031466 NM_001321646 NM_001374682 NM_001374683
NM_001374684


NM_001164641 NM_001164642 NM_001164643 NM_029640 NM_180662

RefSeq (білок)

NP_001153844 NP_001308575 NP_113654 NP_001361611 NP_001361612
NP_001361613


NP_001158113 NP_001158115 NP_083916 NP_850993

Локус (UCSC)

Хр. 8: 139.73 – 140.46 Mb

Хр. 15: 72.46 – 72.93 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAPPC9 (англ. Trafficking protein particle complex 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 148 амінокислот, а молекулярна маса — 128 530^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVPDYMQCA	EDHQTLLVVV	QPVGIVSEEN	FFRIYKRICS	VSQISVRDSQ
RVLYIRYRHH	YPPENNEWGD	FQTHRKVVGL	ITITDCFSAK	DWPQTFEKFH
VQKEIYGSTL	YDSRLFVFGL	QGEIVEQPRT	DVAFYPNYED	CQTVEKRIED
FIESLFIVLE	SKRLDRATDK	SGDKIPLLCV	PFEKKDFVGL	DTDSRHYKKR
CQGRMRKHVG	DLCLQAGMLQ	DSLVHYHMSV	ELLRSVNDFL	WLGAALEGLC
SASVIYHYPG	GTGGKSGARR	FQGSTLPAEA	ANRHRPGAQE	VLIDPGALTT
NGINPDTSTE	IGRAKNCLSP	EDIIDKYKEA	ISYYSKYKNA	GVIELEACIK
AVRVLAIQKR	SMEASEFLQN	AVYINLRQLS	EEEKIQRYSI	LSELYELIGF
HRKSAFFKRV	AAMQCVAPSI	AEPGWRACYK	LLLETLPGYS	LSLDPKDFSR
GTHRGWAAVQ	MRLLHELVYA	SRRMGNPALS	VRHLSFLLQT	MLDFLSDQEK
KDVAQSLENY	TSKCPGTMEP	IALPGGLTLP	PVPFTKLPIV	RHVKLLNLPA
SLRPHKMKSL	LGQNVSTKSP	FIYSPIIAHN	RGEERNKKID	FQWVQGDVCE
VQLMVYNPMP	FELRVENMGL	LTSGVEFESL	PAALSLPAES	GLYPVTLVGV
PQTTGTITVN	GYHTTVFGVF	SDCLLDNLPG	IKTSGSTVEV	IPALPRLQIS
TSLPRSAHSL	QPSSGDEIST	NVSVQLYNGE	SQQLIIKLEN	IGMEPLEKLE
VTSKVLTTKE	KLYGDFLSWK	LEETLAQFPL	QPGKVATFTI	NIKVKLDFSC
QENLLQDLSD	DGISVSGFPL	SSPFRQVVRP	RVEGKPVNPP	ESNKAGDYSH
VKTLEAVLNF	KYSGGPGHTE	GYYRNLSLGL	HVEVEPSVFF	TRVSTLPATS
TRQCHLLLDV	FNSTEHELTV	STRSSEALIL	HAGECQRMAI	QVDKFNFESF
PESPGEKGQF	ANPKQLEEER	REARGLEIHS	KLGICWRIPS	LKRSGEASVE
GLLNQLVLEH	LQLAPLQWDV	LVDGQPCDRE	AVAACQVGDP	VRLEVRLTNR
SPRSVGPFAL	TVVPFQDHQN	GVHNYDLHDT	VSFVGSSTFY	LDAVQPSGQS
ACLGALLFLY	TGDFFLHIRF	HEDSTSKELP	PSWFCLPSVH	VCALEAQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRAPPC9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30832 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96Q05 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.