TRAT1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRAT1

Ідентифікатори

Символи

TRAT1, TCRIM, TRIM, HSPC062, pp29/30, T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, T-cell receptor associated transmembrane adaptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604962 MGI: 1924897 HomoloGene: 41130 GeneCards: TRAT1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane receptor protein tyrosine kinase adaptor activity • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex
Біологічний процес	• positive regulation of calcium-mediated signaling • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • positive regulation of T cell receptor signaling pathway • GO:1900301 negative regulation of transport • cellular defense response • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of receptor recycling • GO:0072468 сигнальна трансдукція • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of protein kinase B signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50852


77647

Ensembl


ENSG00000163519


ENSMUSG00000030775

UniProt


Q6PIZ9


Q3UU67

RefSeq (мРНК)


NM_016388 NM_001317747


NM_198297

RefSeq (білок)


NP_001304676 NP_057472


NP_938039

Локус (UCSC)

Хр. 3: 108.82 – 108.86 Mb

Хр. 16: 48.55 – 48.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAT1 (англ. T-cell receptor associated transmembrane adaptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 21 211^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGISGCPFF	LWGLLALLGL	ALVISLIFNI	SHYVEKQRQD	KMYSYSSDHT
RVDEYYIEDT	PIYGNLDDMI	SEPMDENCYE	QMKARPEKSV	NKMQEATPSA
QATNETQMCY	ASLDHSVKGK	RRKPRKQNTH	FSDKDGDEQL	HAIDASVSKT
TLVDSFSPES	QAVEENIHDD	PIRLFGLIRA	KREPIN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30698 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6PIZ9 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.