TRERF1

Ідентифікатори

Символи

TRERF1, BCAR2, HSA277276, RAPA, TREP132, TReP-132, dJ139D8.5, transcriptional regulating factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610322 MGI: 2442086 HomoloGene: 14129 GeneCards: TRERF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001104 transcription coregulator activity • DNA binding • DNA binding, bending • nuclear receptor coactivator activity • transcription factor binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • histone deacetylase complex • transcription regulator complex • нуклеоплазма • ядерце • гіалоплазма
Біологічний процес	• multicellular organism development • cholesterol catabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • homeostatic process • steroid biosynthetic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of hormone biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55809


224829

Ensembl


ENSG00000124496


ENSMUSG00000064043

UniProt


Q96PN7


Q8BXJ2

RefSeq (мРНК)

NM_001297573 NM_018415 NM_033501 NM_033502 NM_001391983
NM_001391984 NM_001395490


NM_001097623 NM_172622

RefSeq (білок)


NP_001284502 NP_277037


NP_001091092 NP_766210

Локус (UCSC)

Хр. 6: 42.22 – 42.45 Mb

Хр. 17: 47.45 – 47.67 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRERF1 (англ. Transcriptional regulating factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 200 амінокислот, а молекулярна маса — 132 256^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDQQLYKTN	HVAHGSENLF	YQQPPLGVHS	GLNHNYGNAV	TGGGMDAPQA
SPISPHFPQD	TRDGLGLPVG	SKNLGQMDTS	RQGGWGSHAG	PGNHVQLRGN
LANSNMMWGA	PAQAEPTDGY	QYTYSQASEI	RTQKLTSGVL	HKLDSFTQVF
ANQNLRIQVN	NMAQVLHTQS	AVMDGAPDSA	LRQLLSQKPM	EPPAPAIPSR
YQQVPQQPHP	GFTGGLSKPA	LQVGQHPTQG	HLYYDYQQPL	AQVPVQGGQP
LQAPQMLSQH	MQQMQQHQYY	PPQQQQQAGQ	QRISMQEIQT	QPQQIRPSQP
QPPPQQQQPQ	QLQLQQRQGS	MQIPQYYQPQ	PMMQHLQEQQ	QQQMHLQPPS
YHRDPHQYTP	EQAHTVQLIP	LGSMSQYYYQ	EPQQPYSHPL	YQQSHLSQHQ
QREDSQLKTY	SSDRQAQAML	SSHGDLGPPD	TGMGDPASSD	LTRVSSTLPH
RPLLSPSGIH	LNNMGPQHQQ	LSPSAMWPQM	HLPDGRAQPG	SPESSGQPKG
AFGEQFDAKN	KLTCSICLKE	FKNLPALNGH	MRSHGGMRAS	PNLKQEEGEK
VLPPQPQPPL	PPPPPPPPPP	QLPPEAESLT	PMVMPVSVPV	KLLPPKPSSQ
GFTNSTVAAP	SARDKPASSM	SDDEMPVLEI	PRKHQPSVPK	AEEPLKTVQE
KKKFRHRPEP	LFIPPPPSYN	PNPAASYSGA	TLYQSQLRSP	RVLGDHLLLD
PTHELPPYTP	PPMLSPVRQG	SGLFSNVLIS	GHGPGAHPQL	PLTPLTPTPR
VLLCRSNSID	GSNVTVTPGP	GEQTVDVEPR	INIGLRFQAE	IPELQDISAL
AQDTHKATLV	WKPWPELENH	DLQQRVENLL	NLCCSSALPG	GGTNSEFALH
SLFEAKGDVM	VALEMLLLRK	PVRLKCHPLA	NYHYAGSDKW	TSLERKLFNK
ALATYSKDFI	FVQKMVKSKT	VAQCVEYYYT	WKKIMRLGRK	HRTRLAEIID
DCVTSEEEEE	LEEEEEEDPE	EDRKSTKEEE	SEVPKSPEPP	PVPVLAPTEG
PPLQALGQPS	GSFICEMPNC	GAVFSSRQAL	NGHARIHGGT	NQVTKARGAI
PSGKQKPGGT	QSGYCSVKSS	PSHSTTSGET	DPTTIFPCKE	CGKVFFKIKS
RNAHMKTHRQ	QEEQQRQKAQ	KAAFAAEMAA	TIERTTGPVG	APGLLPLDQL
SLIKPIKDVD	ILDDDVVQQL	GGVMEEAEVV	DTDLLLDDQD	SVLLQGDAEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Gizard F., Lavallee B., DeWitte F., Hum D.W. (2001). A novel zinc finger protein TReP-132 interacts with CBP/p300 to regulate human CYP11A1 gene expression. J. Biol. Chem. 276: 33881—33892. PMID 11349124 DOI:10.1074/jbc.M100113200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18273 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96PN7 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.