TRIM22 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM22, GPSTAF50, RNF94, STAF50, tripartite motif containing 22 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606559 HomoloGene: 48399 GeneCards: TRIM22 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • Тільце Кахаля • nuclear speck • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • комплекс Ґольджі |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of autophagy • interferon-gamma-mediated signaling pathway • protein trimerization • response to virus • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • regulation of protein localization • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0022415 viral process • negative regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a4/PBB_GE_TRIM22_213293_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRIM22_213293_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 5.69 – 5.74 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | н/д |
---|
Вікідані |
|
TRIM22 (англ. Tripartite motif containing 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 947[3].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDFSVKVDIE | | KEVTCPICLE | | LLTEPLSLDC | | GHSFCQACIT | | AKIKESVIIS |
RGESSCPVCQ | | TRFQPGNLRP | | NRHLANIVER | | VKEVKMSPQE | | GQKRDVCEHH |
GKKLQIFCKE | | DGKVICWVCE | | LSQEHQGHQT | | FRINEVVKEC | | QEKLQVALQR |
LIKEDQEAEK | | LEDDIRQERT | | AWKNYIQIER | | QKILKGFNEM | | RVILDNEEQR |
ELQKLEEGEV | | NVLDNLAAAT | | DQLVQQRQDA | | STLISDLQRR | | LRGSSVEMLQ |
DVIDVMKRSE | | SWTLKKPKSV | | SKKLKSVFRV | | PDLSGMLQVL | | KELTDVQYYW |
VDVMLNPGSA | | TSNVAISVDQ | | RQVKTVRTCT | | FKNSNPCDFS | | AFGVFGCQYF |
SSGKYYWEVD | | VSGKIAWILG | | VHSKISSLNK | | RKSSGFAFDP | | SVNYSKVYSR |
YRPQYGYWVI | | GLQNTCEYNA | | FEDSSSSDPK | | VLTLFMAVPP | | CRIGVFLDYE |
AGIVSFFNVT | | NHGALIYKFS | | GCRFSRPAYP | | YFNPWNCLVP | | MTVCPPSS |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Tissot C., Mechti N. (1995). Molecular cloning of a new interferon-induced factor that represses human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat expression. J. Biol. Chem. 270: 14891—14898. PMID 7797467 DOI:10.1074/jbc.270.25.14891
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Duan Z., Gao B., Xu W., Xiong S. (2008). Identification of TRIM22 as a RING finger E3 ubiquitin ligase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 502—506. PMID 18656448 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.070
- Barr S.D., Smiley J.R., Bushman F.D. (2008). The interferon response inhibits HIV particle production by induction of TRIM22. PLoS Pathog. 4: E1000007—E1000007. PMID 18389079 DOI:10.1371/journal.ppat.1000007
- Sivaramakrishnan G., Sun Y., Tan S.K., Lin V.C. (2009). Dynamic localization of tripartite motif-containing 22 in nuclear and nucleolar bodies. Exp. Cell Res. 315: 1521—1532. PMID 19331816 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.01.028
- Sivaramakrishnan G., Sun Y., Rajmohan R., Lin V.C. (2009). B30.2/SPRY domain in tripartite motif-containing 22 is essential for the formation of distinct nuclear bodies. FEBS Lett. 583: 2093—2099. PMID 19481078 DOI:10.1016/j.febslet.2009.05.036
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16379 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IYM9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |