TRIM3

Ідентифікатори

Символи

TRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, tripartite motif containing 3

Зовнішні ІД

OMIM: 605493 MGI: 1860040 HomoloGene: 21290 GeneCards: TRIM3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • early endosome • внутрішньоклітинний • комплекс Ґольджі • дендрит (нейробіологія) • cell projection
Біологічний процес	• protein transport • Убіквітин-залежний протеоліз • нейробіологія розвитку • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10612


55992

Ensembl


ENSG00000110171


ENSMUSG00000036989

UniProt


O75382


Q9R1R2

RefSeq (мРНК)


NM_001248006 NM_001248007 NM_006458 NM_033278 NM_033279


NM_001285870 NM_001285871 NM_001285873 NM_018880 NM_001360425

RefSeq (білок)


NP_001234935 NP_001234936 NP_006449 NP_150594


NP_001272799 NP_001272800 NP_001272802 NP_061368 NP_001347354

Локус (UCSC)

Хр. 11: 6.45 – 6.47 Mb

Хр. 7: 105.25 – 105.28 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM3 (англ. Tripartite motif containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 80 830^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKREDSPGP	EVQPMDKQFL	VCSICLDRYQ	CPKVLPCLHT	FCERCLQNYI
PAQSLTLSCP	VCRQTSILPE	QGVSALQNNF	FISSLMEAMQ	QAPDGAHDPE
DPHPLSVVAG	RPLSCPNHEG	KTMEFYCEAC	ETAMCGECRA	GEHREHGTVL
LRDVVEQHKA	ALQRQLEAVR	GRLPQLSAAI	ALVGGISQQL	QERKAEALAQ
ISAAFEDLEQ	ALQQRKQALV	SDLETICGAK	QKVLQSQLDT	LRQGQEHIGS
SCSFAEQALR	LGSAPEVLLV	RKHMRERLAA	LAAQAFPERP	HENAQLELVL
EVDGLRRSVL	NLGALLTTSA	TAHETVATGE	GLRQALVGQP	ASLTVTTKDK
DGRLVRTGSA	ELRAEITGPD	GTRLPVPVVD	HKNGTYELVY	TARTEGELLL
SVLLYGQPVR	GSPFRVRALR	PGDLPPSPDD	VKRRVKSPGG	PGSHVRQKAV
RRPSSMYSTG	GKRKDNPIED	ELVFRVGSRG	REKGEFTNLQ	GVSAASSGRI
VVADSNNQCI	QVFSNEGQFK	FRFGVRGRSP	GQLQRPTGVA	VDTNGDIIVA
DYDNRWVSIF	SPEGKFKTKI	GAGRLMGPKG	VAVDRNGHII	VVDNKSCCVF
TFQPNGKLVG	RFGGRGATDR	HFAGPHFVAV	NNKNEIVVTD	FHNHSVKVYS
ADGEFLFKFG	SHGEGNGQFN	APTGVAVDSN	GNIIVADWGN	SRIQVFDSSG
SFLSYINTSA	EPLYGPQGLA	LTSDGHVVVA	DAGNHCFKAY	RYLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література

El-Husseini A.E.-D., Fretier P., Vincent S.R. (2001). Cloning and characterization of a gene (RNF22) encoding a novel brain expressed ring finger protein (BERP) that maps to human chromosome 11p15.5. Genomics. 71: 363—367. PMID 11170753 DOI:10.1006/geno.2000.6452
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10064 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O75382 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.