TRIM38 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRIM38

Ідентифікатори

Символи

TRIM38, RNF15, RORET, tripartite motif containing 38

Зовнішні ІД

MGI: 2684869 HomoloGene: 48427 GeneCards: TRIM38

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10475


214158

Ensembl


ENSG00000112343


ENSMUSG00000064140

UniProt


O00635


Q5SZ99

RefSeq (мРНК)


NM_006355


NM_001029935

RefSeq (білок)


NP_006346


NP_001025106

Локус (UCSC)

Хр. 6: 25.96 – 25.99 Mb

Хр. 13: 23.95 – 23.98 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM38 (англ. Tripartite motif containing 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 53 416^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASTTSTKKM	MEEATCSICL	SLMTNPVSIN	CGHSYCHLCI	TDFFKNPSQK
QLRQETFCCP	QCRAPFHMDS	LRPNKQLGSL	IEALKETDQE	MSCEEHGEQF
HLFCEDEGQL	ICWRCERAPQ	HKGHTTALVE	DVCQGYKEKL	QKAVTKLKQL
EDRCTEQKLS	TAMRITKWKE	KVQIQRQKIR	SDFKNLQCFL	HEEEKSYLWR
LEKEEQQTLS	RLRDYEAGLG	LKSNELKSHI	LELEEKCQGS	AQKLLQNVND
TLSRSWAVKL	ETSEAVSLEL	HTMCNVSKLY	FDVKKMLRSH	QVSVTLDPDT
AHHELILSED	RRQVTRGYTQ	ENQDTSSRRF	TAFPCVLGCE	GFTSGRRYFE
VDVGEGTGWD	LGVCMENVQR	GTGMKQEPQS	GFWTLRLCKK	KGYVALTSPP
TSLHLHEQPL	LVGIFLDYEA	GVVSFYNGNT	GCHIFTFPKA	SFSDTLRPYF
QVYQYSPLFL	PPPGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10059 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, O00635 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.