TRIP13

Ідентифікатори

Символи

TRIP13, 16E1BP, thyroid hormone receptor interactor 13, MVA3, OOMD9

Зовнішні ІД

OMIM: 604507 MGI: 1916966 HomoloGene: 3125 GeneCards: TRIP13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • ATP binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• male germ cell nucleus • клітинне ядро • хромосома
Біологічний процес	• GO:0007126 мейоз • reciprocal meiotic recombination • male meiosis I • диференціація клітин • oocyte maturation • double-strand break repair • transcription by RNA polymerase II • synaptonemal complex assembly • Сперматогенез • female meiosis I • spermatid development • Оогенез • mitotic spindle assembly checkpoint signaling • regulation of nucleic acid-templated transcription • meiotic recombination checkpoint signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9319


69716

Ensembl


ENSG00000071539


ENSMUSG00000021569

UniProt


Q15645


Q3UA06

RefSeq (мРНК)


NM_001166260 NM_004237


NM_027182

RefSeq (білок)


NP_001159732 NP_004228


NP_081458

Локус (UCSC)

Хр. 5: 0.89 – 0.92 Mb

Хр. 13: 74.06 – 74.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIP13 (англ. Thyroid hormone receptor interactor 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 432 амінокислот, а молекулярна маса — 48 551^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEAVGDLKQ	ALPCVAESPT	VHVEVHQRGS	STAKKEDINL	SVRKLLNRHN
IVFGDYTWTE	FDEPFLTRNV	QSVSIIDTEL	KVKDSQPIDL	SACTVALHIF
QLNEDGPSSE	NLEEETENII	AANHWVLPAA	EFHGLWDSLV	YDVEVKSHLL
DYVMTTLLFS	DKNVNSNLIT	WNRVVLLHGP	PGTGKTSLCK	ALAQKLTIRL
SSRYRYGQLI	EINSHSLFSK	WFSESGKLVT	KMFQKIQDLI	DDKDALVFVL
IDEVESLTAA	RNACRAGTEP	SDAIRVVNAV	LTQIDQIKRH	SNVVILTTSN
ITEKIDVAFV	DRADIKQYIG	PPSAAAIFKI	YLSCLEELMK	CQIIYPRQQL
LTLRELEMIG	FIENNVSKLS	LLLNDISRKS	EGLSGRVLRK	LPFLAHALYV
QAPTVTIEGF	LQALSLAVDK	QFEERKKLAA	YI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
Yasugi T., Vidal M., Sakai H., Howley P.M., Benson J.D. (1997). Two classes of human papillomavirus type 16 E1 mutants suggest pleiotropic conformational constraints affecting E1 multimerization, E2 interaction, and interaction with cellular proteins. J. Virol. 71: 5942—5951. PMID 9223484

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12307 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15645 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 5 вересня 2017.