TRMT13 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRMT13

Ідентифікатори

Символи

TRMT13, CCDC76, tRNA methyltransferase 13 homolog

Зовнішні ІД

MGI: 1925219 HomoloGene: 6875 GeneCards: TRMT13

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54482


229780

Ensembl


ENSG00000122435


ENSMUSG00000033439

UniProt


Q9NUP7


Q8BYH3

RefSeq (мРНК)

NM_019083 NM_001393409 NM_001393410 NM_001393411 NM_001393412
NM_001393413 NM_001393414


NM_030016

RefSeq (білок)


NP_061956


NP_084292

Локус (UCSC)

Хр. 1: 100.13 – 100.15 Mb

Хр. 3: 116.37 – 116.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRMT13 (англ. TRNA methyltransferase 13 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 54 247^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATSATSPHA	PGFPAEGRCG	YYVEKKKRFC	RMVVAAGKRF	CGEHAGAAEE
EDARKRILCP	LDPKHTVYED	QLAKHLKKCN	SREKPKPDFY	IQDINAGLRD
ETEIPEQLVP	ISSLSEEQLE	KLIKKLRKAS	EGLNSTLKDH	IMSHPALHDA
LNDPKNGDSA	TKHLKQQASI	LGNIENLKLL	GPRRCFVEFG	AGKGKLSHWV
DIALKDAEKV	HFILVEKVTT	RFKVDGKHRK	KNSVFERLQI	DIQHLCLNKI
PVLREEKLPV	VGIGKHLCGM	ATDLALRCLV	ETYAASFEER	NEEPLAKRIK
NDKTEKEIYT	LAKEGNEKNV	PEKWNPVAGI	VIALCCHHRC	DWRHYVGKEY
FRALGLGAVE	FHYFQRMSSW	ATCGMRKTSL	ETSNSTTKRQ	DNQNDDSEEH
DDGGYRITDD	GADCLPGLLS	VEEKKKIGHL	CKLLIDQGRI	QYLQQKGFSP
ALQYYTDPLV	SLENVLLTAL	PNHSSSPETT	A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Andreeva A., Tidow H. (2008). A novel CHHC Zn-finger domain found in spliceosomal proteins and tRNA modifying enzymes. Bioinformatics. 24: 2277—2280. PMID 18703587 DOI:10.1093/bioinformatics/btn431

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25502 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NUP7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 15 вересня 2017.