TTF2

Ідентифікатори

Символи

TTF2, HuF2, ZGRF6, transcription termination factor, RNA polymerase II, transcription termination factor 2, F2

Зовнішні ІД

OMIM: 604718 MGI: 1921294 HomoloGene: 37826 GeneCards: TTF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• spliceosomal complex • transcription elongation factor complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• DNA-templated transcription, termination • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8458


74044

Ensembl


ENSG00000116830


ENSMUSG00000033222

UniProt


Q9UNY4


Q5NC05

RefSeq (мРНК)


NM_003594


NM_001013026

RefSeq (білок)


NP_003585


NP_001013044

Локус (UCSC)

Хр. 1: 117.06 – 117.11 Mb

Хр. 3: 100.94 – 100.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TTF2 (англ. Transcription termination factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 129 588^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEVRCPEHG	TFCFLKTGVR	DGPNKGKSFY	VCRADTCSFV	RATDIPVSHC
LLHEDFVVEL	QGLLLPQDKK	EYRLFFRCIR	SKAEGKRWCG	SIPWQDPDSK
EHSVSNKSQH	ASETFHHSSN	WLRNPFKVLD	KNQEPALWKQ	LIKGEGEEKK
ADKKQREKGD	QLFDQKKEQK	PEMMEKDLSS	GLVPKKKQSV	VQEKKQEEGA
EIQCEAETGG	THKRDFSEIK	SQQCQGNELT	RPSASSQEKS	SGKSQDVQRE
SEPLREKVTQ	LLPQNVHSHN	SISKPQKGGP	LNKEYTNWEA	KETKAKDGPS
IQATQKSLPQ	GHFQERPETH	SVPAPGGPAA	QAAPAAPGLS	LGEGREAATS
SDDEEEDDVV	FVSSKPGSPL	LFDSTLDLET	KENLQFPDRS	VQRKVSPASG
VSKKVEPSDP	VARRVYLTTQ	LKQKKSTLAS	VNIQALPDKG	QKLIKQIQEL
EEVLSGLTLS	PEQGTNEKSN	SQVPQQSHFT	KTTTGPPHLV	PPQPLPRRGT
QPVGSLELKS	ACQVTAGGSS	QCYRGHTNQD	HVHAVWKITS	EAIGQLHRSL
ESCPGETVVA	EDPAGLKVPL	LLHQKQALAW	LLWRESQKPQ	GGILADDMGL
GKTLTMIALI	LTQKNQEKKE	EKEKSTALTW	LSKDDSCDFT	SHGTLIICPA
SLIHHWKNEV	EKRVNSNKLR	VYLYHGPNRD	SRARVLSTYD	IVITTYSLVA
KEIPTNKQEA	EIPGANLNVE	GTSTPLLRIA	WARIILDEAH	NVKNPRVQTS
IAVCKLQACA	RWAVTGTPIQ	NNLLDMYSLL	KFLRCSPFDE	FNLWRSQVDN
GSKKGGERLS	ILTKSLLLRR	TKDQLDSTGR	PLVILPQRKF	QLHHLKLSED
EETVYNVFFA	RSRSALQSYL	KRHESRGNQS	GRSPNNPFSR	VALEFGSEEP
RHSEAADSPR	SSTVHILSQL	LRLRQCCCHL	SLLKSALDPM	ELKGEGLVLS
LEEQLSALTL	SELRDSEPSS	TVSLNGTFFK	MELFEGMRES	TKISSLLAEL
EAIQRNSASQ	KSVIVSQWTN	MLKVVALHLK	KHGLTYATID	GSVNPKQRMD
LVEAFNHSRG	PQVMLISLLA	GGVGLNLTGG	NHLFLLDMHW	NPSLEDQACD
RIYRVGQQKD	VVIHRFVCEG	TVEEKILQLQ	EKKKDLAKQV	LSGSGESVTK
LTLADLRVLF	GI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu M., Xie Z., Price D.H. (1998). A human RNA polymerase II transcription termination factor is a SWI2/SNF2 family member. J. Biol. Chem. 273: 25541—25544. PMID 9748214 DOI:10.1074/jbc.273.40.25541
Leonard D., Ajuh P., Lamond A.I., Legerski R.J. (2003). hLodestar/HuF2 interacts with CDC5L and is involved in pre-mRNA splicing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308: 793—801. PMID 12927788 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01486-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hara R., Selby C.P., Liu M., Price D.H., Sancar A. (1999). Human transcription release factor 2 dissociates RNA polymerases I and II stalled at a cyclobutane thymine dimer. J. Biol. Chem. 274: 24779—24786. PMID 10455150 DOI:10.1074/jbc.274.35.24779
Jiang Y., Liu M., Spencer C.A., Price D.H. (2004). Involvement of transcription termination factor 2 in mitotic repression of transcription elongation. Mol. Cell. 14: 375—385. PMID 15125840 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00234-5

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12398 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UNY4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.