TTF2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TTF2, HuF2, ZGRF6, transcription termination factor, RNA polymerase II, transcription termination factor 2, F2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604718 MGI: 1921294 HomoloGene: 37826 GeneCards: TTF2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • spliceosomal complex • transcription elongation factor complex • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • DNA-templated transcription, termination • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/72/PBB_GE_TTF2_204407_at_fs.png/250px-PBB_GE_TTF2_204407_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 117.06 – 117.11 Mb | Хр. 3: 100.94 – 100.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TTF2 (англ. Transcription termination factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 129 588[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEEVRCPEHG | | TFCFLKTGVR | | DGPNKGKSFY | | VCRADTCSFV | | RATDIPVSHC |
LLHEDFVVEL | | QGLLLPQDKK | | EYRLFFRCIR | | SKAEGKRWCG | | SIPWQDPDSK |
EHSVSNKSQH | | ASETFHHSSN | | WLRNPFKVLD | | KNQEPALWKQ | | LIKGEGEEKK |
ADKKQREKGD | | QLFDQKKEQK | | PEMMEKDLSS | | GLVPKKKQSV | | VQEKKQEEGA |
EIQCEAETGG | | THKRDFSEIK | | SQQCQGNELT | | RPSASSQEKS | | SGKSQDVQRE |
SEPLREKVTQ | | LLPQNVHSHN | | SISKPQKGGP | | LNKEYTNWEA | | KETKAKDGPS |
IQATQKSLPQ | | GHFQERPETH | | SVPAPGGPAA | | QAAPAAPGLS | | LGEGREAATS |
SDDEEEDDVV | | FVSSKPGSPL | | LFDSTLDLET | | KENLQFPDRS | | VQRKVSPASG |
VSKKVEPSDP | | VARRVYLTTQ | | LKQKKSTLAS | | VNIQALPDKG | | QKLIKQIQEL |
EEVLSGLTLS | | PEQGTNEKSN | | SQVPQQSHFT | | KTTTGPPHLV | | PPQPLPRRGT |
QPVGSLELKS | | ACQVTAGGSS | | QCYRGHTNQD | | HVHAVWKITS | | EAIGQLHRSL |
ESCPGETVVA | | EDPAGLKVPL | | LLHQKQALAW | | LLWRESQKPQ | | GGILADDMGL |
GKTLTMIALI | | LTQKNQEKKE | | EKEKSTALTW | | LSKDDSCDFT | | SHGTLIICPA |
SLIHHWKNEV | | EKRVNSNKLR | | VYLYHGPNRD | | SRARVLSTYD | | IVITTYSLVA |
KEIPTNKQEA | | EIPGANLNVE | | GTSTPLLRIA | | WARIILDEAH | | NVKNPRVQTS |
IAVCKLQACA | | RWAVTGTPIQ | | NNLLDMYSLL | | KFLRCSPFDE | | FNLWRSQVDN |
GSKKGGERLS | | ILTKSLLLRR | | TKDQLDSTGR | | PLVILPQRKF | | QLHHLKLSED |
EETVYNVFFA | | RSRSALQSYL | | KRHESRGNQS | | GRSPNNPFSR | | VALEFGSEEP |
RHSEAADSPR | | SSTVHILSQL | | LRLRQCCCHL | | SLLKSALDPM | | ELKGEGLVLS |
LEEQLSALTL | | SELRDSEPSS | | TVSLNGTFFK | | MELFEGMRES | | TKISSLLAEL |
EAIQRNSASQ | | KSVIVSQWTN | | MLKVVALHLK | | KHGLTYATID | | GSVNPKQRMD |
LVEAFNHSRG | | PQVMLISLLA | | GGVGLNLTGG | | NHLFLLDMHW | | NPSLEDQACD |
RIYRVGQQKD | | VVIHRFVCEG | | TVEEKILQLQ | | EKKKDLAKQV | | LSGSGESVTK |
LTLADLRVLF | | GI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Liu M., Xie Z., Price D.H. (1998). A human RNA polymerase II transcription termination factor is a SWI2/SNF2 family member. J. Biol. Chem. 273: 25541—25544. PMID 9748214 DOI:10.1074/jbc.273.40.25541
- Leonard D., Ajuh P., Lamond A.I., Legerski R.J. (2003). hLodestar/HuF2 interacts with CDC5L and is involved in pre-mRNA splicing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 308: 793—801. PMID 12927788 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01486-4
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hara R., Selby C.P., Liu M., Price D.H., Sancar A. (1999). Human transcription release factor 2 dissociates RNA polymerases I and II stalled at a cyclobutane thymine dimer. J. Biol. Chem. 274: 24779—24786. PMID 10455150 DOI:10.1074/jbc.274.35.24779
- Jiang Y., Liu M., Spencer C.A., Price D.H. (2004). Involvement of transcription termination factor 2 in mitotic repression of transcription elongation. Mol. Cell. 14: 375—385. PMID 15125840 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00234-5
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12398 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UNY4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |