TYSND1

Ідентифікатори

Символи

TYSND1, NET41, trypsin domain containing 1, trypsin like peroxisomal matrix peptidase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611017 MGI: 1919017 HomoloGene: 87946 GeneCards: TYSND1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protease binding • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • hydrolase activity • identical protein binding • serine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• пероксисома • мембрана • peroxisomal matrix • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein processing • regulation of fatty acid beta-oxidation • protein homooligomerization • протеоліз • protein targeting to peroxisome
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


219743


71767

Ensembl


ENSG00000156521


ENSMUSG00000020087

UniProt


Q2T9J0


Q9DBA6

RefSeq (мРНК)


NM_001040273 NM_173555


NM_001272090 NM_001272091 NM_001272092 NM_027912

RefSeq (білок)


NP_001035363 NP_775826


NP_001259019 NP_001259020 NP_001259021 NP_082188

Локус (UCSC)

Хр. 10: 70.14 – 70.15 Mb

Хр. 10: 61.53 – 61.54 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TYSND1 (англ. Trypsin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 59 309^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRQWGSAMR	AAEQAGCMVS	ASRAGQPEAG	PWSCSGVILS	RSPGLVLCHG
GIFVPFLRAG	SEVLTAAGAV	FLPGDSCRDD	LRLHVQWAPT	AAGPGGGAER
GRPGLCTPQC	ASLEPGPPAP	SRGRPLQPRL	PAELLLLLSC	PAFWAHFARL
FGDEAAEQWR	FSSAARDDEV	SEDEEADQLR	ALGWFALLGV	RLGQEEVEEE
RGPAMAVSPL	GAVPKGAPLL	VCGSPFGAFC	PDIFLNTLSC	GVLSNVAGPL
LLTDARCLPG	TEGGGVFTAR	PAGALVALVV	APLCWKAGEW	VGFTLLCAAA
PLFRAARDAL	HRLPHSTAAL	AALLPPEVGV	PWGLPLRDSG	PLWAAAAVLV
ECGTVWGSGV	AVAPRLVVTC	RHVSPREAAR	VLVRSTTPKS	VAIWGRVVFA
TQETCPYDIA	VVSLEEDLDD	VPIPVPAEHF	HEGEAVSVVG	FGVFGQSCGP
SVTSGILSAV	VQVNGTPVML	QTTCAVHSGS	SGGPLFSNHS	GNLLGIITSN
TRDNNTGATY	PHLNFSIPIT	VLQPALQQYS	QTQDLGGLRE	LDRAAEPVRV
VWRLQRPLAE	APRSKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у пероксисомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Okumoto K., Kametani Y., Fujiki Y. (2011). Two proteases, trypsin domain-containing 1 (Tysnd1) and peroxisomal lon protease (PsLon), cooperatively regulate fatty acid beta-oxidation in peroxisomal matrix. J. Biol. Chem. 286: 44367—44379. PMID 22002062 DOI:10.1074/jbc.M111.285197

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Trypsin domain containing 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28531 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q2T9J0 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.