UBAP2

Ідентифікатори

Символи

UBAP2, UBAP-2, ubiquitin associated protein 2

Зовнішні ІД

MGI: 1916176 HomoloGene: 73649 GeneCards: UBAP2

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• GO:1901313 positive regulation of gene expression
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55833


68926

Ensembl


ENSG00000137073


ENSMUSG00000028433

UniProt


Q5T6F2


Q91VX2

RefSeq (мРНК)


NM_020867 NM_001282529 NM_001282530 NM_018449


NM_026872

RefSeq (білок)

NP_001269459 NP_060919 NP_001356988 NP_001356991 NP_001356993
NP_001356995 NP_001356996 NP_001356997


NP_081148

Локус (UCSC)

Хр. 9: 33.92 – 34.05 Mb

Хр. 4: 41.19 – 41.28 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBAP2 (англ. Ubiquitin associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 119 амінокислот, а молекулярна маса — 117 116^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMTSVSSDHC	RGAREKPQIS	AAQSTQPQKQ	VVQATAEQMR	LAQVIFDKND
SDFEAKVKQL	MEVTGKNQDE	CIVALHDCNG	DVNKAINILL	EGNSDTTSWE
TVGCKKKNFA	KENSENKENR	EKKSEKESSR	GRGNNNRKGR	GGNRGREFRG
EENGIDCNQV	DKPSDRGKRA	RGRGFGRGRG	RGAGRFSTQG	MGTFNPADYS
DSTSTDVCGT	KLVVWEAAQN	GADEGTELAS	NTHNIAQDLS	NKSSYGLKGA
WKNSVEEWTT	EDWTEDLSET	KVFTASSAPA	ENHILPGQSI	DLVALLQKPV
PHSQASEANS	FETSQQQGFG	QALVFTNSQH	NNQMAPGTGS	STAVNSCSPQ
SLSSVLGSGF	GELAPPKMAN	ITSSQILDQL	KAPSLGQFTT	TPSTQQNSTS
HPTTTTSWDL	KPPTSQSSVL	SHLDFKSQPE	PSPVLSQLSQ	RQQHQSQAVT
VPPPGLESFP	SQAKLRESTP	GDSPSTVNKL	LQLPSTTIEN	ISVSVHQPQP
KHIKLAKRRI	PPASKIPASA	VEMPGSADVT	GLNVQFGALE	FGSEPSLSEF
GSAPSSENSN	QIPISLYSKS	LSEPLNTSLS	MTSAVQNSTY	TTSVITSCSL
TSSSLNSASP	VAMSSSYDQS	SVHNRIPYQS	PVSSSESAPG	TIMNGHGGGR
SQQTLDTPKT	TGPPSALPSV	SSLPSTTSCT	ALLPSTSQHT	GDLTSSPLSQ
LSSSLSSHQS	SLSAHAALSS	STSHTHASVE	SASSHQSSAT	FSTAATSVSS
SASSGASLSS	SMNTANSLCL	GGTPASASSS	SSRAAPLVTS	GKAPPNLPQG
VPPLLHNQYL	VGPGGLLPAY	PIYGYDELQM	LQSRLPVDYY	GIPFAAPTAL
ASRDGSLANN	PYPGDVTKFG	RGDSASPAPA	TTPAQPQQSQ	SQTHHTAQQP
FVNPALPPGY	SYTGLPYYTG	MPSAFQYGPT	MFVPPASAKQ	HGVNLSTPTP
PFQQASGYGQ	HGYSTGYDDL	TQGTAAGDYS	KGGYAGSSQA	PNKSAGSGPG
KGVSVSSSTT	GLPDMTGSVY	NKTQTFDKQG	FHAGTPPPFS	LPSVLGSTGP
LASGAAPGYA	PPPFLHILPA	HQQPHSQLLH	HHLPQDAQSG	SGQRSQPSSL
QPKSQASKPA	YGNSPYWTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ubiquitin associated protein 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14185 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5T6F2 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 8 вересня 2017.