UBE2N

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1J7D, 2C2V, 3HCT, 3HCU, 3VON, 3W31, 4DHI, 4DHJ, 4DHZ, 4IP3, 4NR3, 4NRG, 4NRI, 4ONL, 4ONM, 4ONN, 4ORH, 4TKP, 5AIT, 5AIU, 4WHV

Ідентифікатори

Символи

UBE2N, HEL-S-71, UBC13, UBCHBEN; UBC13, UbcH-ben, UbcH13, ubiquitin conjugating enzyme E2 N, UBCHBEN

Зовнішні ІД

OMIM: 603679 MGI: 1934835 HomoloGene: 128406 GeneCards: UBE2N

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin conjugating enzyme activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • UBC13-UEV1A complex • ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • екзосома • UBC13-MMS2 complex • клітинне ядро • fibrillar center • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• postreplication repair • protein K63-linked ubiquitination • regulation of DNA repair • DNA double-strand break processing • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • Fc-epsilon receptor signaling pathway • global genome nucleotide-excision repair • GO:0033129 positive regulation of histone modification • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of histone ubiquitination • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • T cell receptor signaling pathway • double-strand break repair via nonhomologous end joining • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • histone ubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • double-strand break repair via homologous recombination • JNK cascade • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • ubiquitin-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7334


93765

Ensembl


ENSG00000177889


ENSMUSG00000074781

UniProt


P61088


P61089

RefSeq (мРНК)


NM_003348


NM_080560

RefSeq (білок)


NP_003339


NP_542127

Локус (UCSC)

Хр. 12: 93.41 – 93.44 Mb

Хр. 10: 95.35 – 95.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBE2N (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 N) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 138^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGLPRRIIK	ETQRLLAEPV	PGIKAEPDES	NARYFHVVIA	GPQDSPFEGG
TFKLELFLPE	EYPMAAPKVR	FMTKIYHPNV	DKLGRICLDI	LKDKWSPALQ
IRTVLLSIQA	LLSAPNPDDP	LANDVAEQWK	TNEAQAIETA	RAWTRLYAMN
NI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hofmann R.M., Pickart C.M. (1999). Noncanonical MMS2-encoded ubiquitin-conjugating enzyme functions in assembly of novel polyubiquitin chains for DNA repair. Cell. 96: 645—653. PMID 10089880 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80575-9
Bothos J., Summers M.K., Venere M., Scolnick D.M., Halazonetis T.D. (2003). The Chfr mitotic checkpoint protein functions with Ubc13-Mms2 to form Lys63-linked polyubiquitin chains. Oncogene. 22: 7101—7107. PMID 14562038 DOI:10.1038/sj.onc.1206831
Takeuchi T., Yokosawa H. (2005). ISG15 modification of Ubc13 suppresses its ubiquitin-conjugating activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 336: 9—13. PMID 16112642 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.08.034
Scheper J., Oliva B., Villa-Freixa J., Thomson T.M. (2009). Analysis of electrostatic contributions to the selectivity of interactions between RING-finger domains and ubiquitin-conjugating enzymes. Proteins. 74: 92—103. PMID 18615712 DOI:10.1002/prot.22120
David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12492 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P61088 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.