UBP1

Ідентифікатори

Символи

UBP1, LBP-1B, LBP-1a, LBP1A, LBP1B, upstream binding protein 1 (LBP-1a), upstream binding protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609784 MGI: 104889 HomoloGene: 8435 GeneCards: UBP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• viral genome replication • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Ангіогенез • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7342


22221

Ensembl


ENSG00000153560


ENSMUSG00000009741

UniProt


Q9NZI7


Q811S7

RefSeq (мРНК)


NM_001128160 NM_001128161 NM_014517

NM_001083319 NM_013699 NM_001372507 NM_001372508 NM_001372510
NM_001372511 NM_001372512 NM_001372514

RefSeq (білок)


NP_001121632 NP_001121633 NP_055332

NP_001076788 NP_038727 NP_001359436 NP_001359437 NP_001359439
NP_001359440 NP_001359441 NP_001359443

Локус (UCSC)

Хр. 3: 33.39 – 33.44 Mb

Хр. 9: 113.76 – 113.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBP1 (англ. Upstream binding protein 1 (LBP-1a)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 491^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWVLKMDEV	IESGLVHDFD	ASLSGIGQEL	GAGAYSMSDV	LALPIFKQED
SSLPLDGETE	HPPFQYVMCA	ATSPAVKLHD	ETLTYLNQGQ	SYEIRMLDNR
KMGDMPEING	KLVKSIIRVV	FHDRRLQYTE	HQQLEGWKWN	RPGDRLLDLD
IPMSVGIIDT	RTNPSQLNAV	EFLWDPAKRT	SAFIQVHCIS	TEFTPRKHGG
EKGVPFRIQV	DTFKQNENGE	YTDHLHSASC	QIKVFKPKGA	DRKQKTDREK
MEKRTAHEKE	KYQPSYDTTI	LTEMRLEPII	EDAVEHEQKK	SSKRTLPADY
GDSLAKRGSC	SPWPDAPTAY	VNNSPSPAPT	FTSPQQSTCS	VPDSNSSSPN
HQGDGASQTS	GEQIQPSATI	QETQQWLLKN	RFSSYTRLFS	NFSGADLLKL
TKEDLVQICG	AADGIRLYNS	LKSRSVRPRL	TIYVCREQPS	STVLQGQQQA
ASSASENGSG	APYVYHAIYL	EEMIASEVAR	KLALVFNIPL	HQINQVYRQG
PTGIHILVSD	QMVQNFQDES	CFLFSTVKAE	SSDGIHIILK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Yoon J.-B., Li G., Roeder R.G. (1994). Characterization of a family of related cellular transcription factors which can modulate human immunodeficiency virus type 1 transcription in vitro. Mol. Cell. Biol. 14: 1776—1785. PMID 8114710 DOI:10.1128/MCB.14.3.1776
Huang N., Miller W.L. (2000). Cloning of factors related to HIV-inducible LBP proteins that regulate steroidogenic factor-1-independent human placental transcription of the cholesterol side-chain cleavage enzyme, P450scc. J. Biol. Chem. 275: 2852—2858. PMID 10644752 DOI:10.1074/jbc.275.4.2852
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kato H., Horikoshi M., Roeder R.G. (1991). Repression of HIV-1 transcription by a cellular protein. Science. 251: 1476—1479. PMID 2006421 DOI:10.1126/science.2006421

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12507 (англ.) . Архів оригіналу за 21 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NZI7 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.