UIMC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MKF, 2MKG, 2RR9, 2N9E | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | UIMC1, RAP80, X2HRIP110, ubiquitin interaction motif containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609433 MGI: 103185 HomoloGene: 9455 GeneCards: UIMC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0031493 histone binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • BRCA1-A complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • response to ionizing radiation • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • histone H2A K63-linked deubiquitination • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/55/PBB_GE_UIMC1_220746_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_UIMC1_220746_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199297 NM_001199298 NM_016290 NM_001317961 |
| | NM_001293660 NM_011307 NM_001359757 NM_001359758 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186226 NP_001186227 NP_001304890 NP_057374 |
| | NP_001280589 NP_035437 NP_001346686 NP_001346687 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 176.91 – 177.02 Mb | Хр. 13: 55.18 – 55.25 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UIMC1 (англ. Ubiquitin interaction motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 719 амінокислот, а молекулярна маса — 79 727[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRRKKKVKE | | VSESRNLEKK | | DVETTSSVSV | | KRKRRLEDAF | | IVISDSDGEE |
PKEENGLQKT | | KTKQSNRAKC | | LAKRKIAQMT | | EEEQFALALK | | MSEQEAREVN |
SQEEEEEELL | | RKAIAESLNS | | CRPSDASATR | | SRPLATGPSS | | QSHQEKTTDS |
GLTEGIWQLV | | PPSLFKGSHI | | SQGNEAEERE | | EPWDHTEKTE | | EEPVSGSSGS |
WDQSSQPVFE | | NVNVKSFDRC | | TGHSAEHTQC | | GKPQESTGRG | | SAFLKAVQGS |
GDTSRHCLPT | | LADAKGLQDT | | GGTVNYFWGI | | PFCPDGVDPN | | QYTKVILCQL |
EVYQKSLKMA | | QRQLLNKKGF | | GEPVLPRPPS | | LIQNECGQGE | | QASEKNECIS |
EDMGDEDKEE | | RQESRASDWH | | SKTKDFQESS | | IKSLKEKLLL | | EEEPTTSHGQ |
SSQGIVEETS | | EEGNSVPASQ | | SVAALTSKRS | | LVLMPESSAE | | EITVCPETQL |
SSSETFDLER | | EVSPGSRDIL | | DGVRIIMADK | | EVGNKEDAEK | | EVAISTFSSS |
NQVSCPLCDQ | | CFPPTKIERH | | AMYCNGLMEE | | DTVLTRRQKE | | AKTKSDSGTA |
AQTSLDIDKN | | EKCYLCKSLV | | PFREYQCHVD | | SCLQLAKADQ | | GDGPEGSGRA |
CSTVEGKWQQ | | RLKNPKEKGH | | SEGRLLSFLE | | QSEHKTSDAD | | IKSSETGAFR |
VPSPGMEEAG | | CSREMQSSFT | | RRDLNESPVK | | SFVSISEATD | | CLVDFKKQVT |
VQPGSRTRTK | | AGRGRRRKF |
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.
Література
- Yan Z., Kim Y.-S., Jetten A.M. (2002). RAP80: a novel nuclear protein that interacts with the retinoid-related testis-associated receptor. J. Biol. Chem. 277: 32379—32388. PMID 12080054 DOI:10.1074/jbc.M203475200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yan J., Yang X.-P., Kim Y.-S., Joo J.H., Jetten A.M. (2007). RAP80 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is a novel target for sumoylation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 362: 132—138. PMID 17698038 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.07.158
- Liu Z., Wu J., Yu X. (2007). CCDC98 targets BRCA1 to DNA damage sites. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 716—720. PMID 17643121 DOI:10.1038/nsmb1279
- Kim H., Huang J., Chen J. (2007). CCDC98 is a BRCA1-BRCT domain-binding protein involved in the DNA damage response. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 710—715. PMID 17643122 DOI:10.1038/nsmb1277
- Wang B., Elledge S.J. (2007). Ubc13/Rnf8 ubiquitin ligases control foci formation of the Rap80/Abraxas/Brca1/Brcc36 complex in response to DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 20759—20763. PMID 18077395 DOI:10.1073/pnas.0710061104
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30298 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96RL1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |