UPK1B : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

UPK1B

Ідентифікатори

Символи

UPK1B, TSPAN20, UPIB, UPK1, uroplakin 1B

Зовнішні ІД

OMIM: 602380 MGI: 98912 HomoloGene: 5065 GeneCards: UPK1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • apical plasma membrane urothelial plaque
Біологічний процес	• cell surface receptor signaling pathway • epithelial cell differentiation • response to bacterium
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7348


22268

Ensembl


ENSG00000114638


ENSMUSG00000049436

UniProt


O75841


Q9Z2C6

RefSeq (мРНК)


NM_006952


NM_178924

RefSeq (білок)


NP_008883


NP_849255

Локус (UCSC)

Хр. 3: 119.17 – 119.21 Mb

Хр. 16: 38.59 – 38.62 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UPK1B (англ. Uroplakin 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 643^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKDNSTVRC	FQGLLIFGNV	IIGCCGIALT	AECIFFVSDQ	HSLYPLLEAT
DNDDIYGAAW	IGIFVGICLF	CLSVLGIVGI	MKSSRKILLA	YFILMFIVYA
FEVASCITAA	TQQDFFTPNL	FLKQMLERYQ	NNSPPNNDDQ	WKNNGVTKTW
DRLMLQDNCC	GVNGPSDWQK	YTSAFRTENN	DADYPWPRQC	CVMNNLKEPL
NLEACKLGVP	GFYHNQGCYE	LISGPMNRHA	WGVAWFGFAI	LCWTFWVLLG
TMFYWSRIEY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

Finch J.L., Miller J., Aspinall J.O., Cowled P.A. (1999). Cloning of the human uroplakin 1B cDNA and analysis of its expression in urothelial-tumor cell lines and bladder-carcinoma tissue. Int. J. Cancer. 80: 533—538. PMID 9935153 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19990209)80:4<533::AID-IJC9>3.0.CO;2-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Finch J.L., Webb G.C., Evdokiou A., Cowled P.A. (1997). Chromosomal localization of the human urothelial 'tetraspan' gene, UPK1B, to 3q13.3-q21 and detection of a TaqI polymorphism. Genomics. 40: 501—503. PMID 9073521 DOI:10.1006/geno.1996.4589

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12578 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O75841 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.