USP19

USP19
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1WH0, 4X3G

Ідентифікатори
Символи USP19, ZMYND9, ubiquitin specific peptidase 19
Зовнішні ІД OMIM: 614471 MGI: 1918722 HomoloGene: 41730 GeneCards: USP19
Онтологія гена
Молекулярна функція

• Hsp90 protein binding
• cysteine-type peptidase activity
• зв'язування з іоном металу
• Lys48-specific deubiquitinase activity
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• thiol-dependent deubiquitinase
• hydrolase activity
• ubiquitin protein ligase binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• endoplasmic reticulum membrane
• мембрана
• ендоплазматичний ретикулум
• гіалоплазма
• клітинне ядро

Біологічний процес

• protein K48-linked deubiquitination
• regulation of protein stability
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein stabilization
• response to endoplasmic reticulum stress
• протеоліз
• regulation of ERAD pathway
• regulation of cellular response to hypoxia
• negative regulation of skeletal muscle tissue development
• positive regulation of cell cycle process
• ubiquitin-dependent ERAD pathway
• negative regulation of proteasomal protein catabolic process
• protein deubiquitination

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10869
71472
Ensembl
ENSG00000172046
ENSMUSG00000006676
UniProt
O94966
Q3UJD6
RefSeq (мРНК)
NM_001199160
NM_001199161
NM_001199162
NM_006677
NM_001351098
NM_001351099
NM_001351100
NM_001351101
NM_001351102
NM_001351103
NM_001351104
NM_001351105
NM_001351106
NM_001351107
NM_001351108
NM_001389594
NM_001389595
NM_001389596
NM_001389597
NM_001389598
NM_001389599
NM_001389600
NM_001389601
NM_001389602
NM_001389603
NM_001389604
NM_001389605
NM_001389606
NM_001389607
NM_001389608
NM_001400288
NM_001400290
NM_001400292
NM_001400293
NM_001400294
NM_001400295
NM_001400296
NM_001400297
NM_001400298
NM_001400299
NM_001168371
NM_001168372
NM_001168373
NM_027804
NM_145407
RefSeq (білок)
NP_001186089
NP_001186090
NP_001186091
NP_006668
NP_001338027
NP_001338028
NP_001338029
NP_001338030
NP_001338031
NP_001338032
NP_001338033
NP_001338034
NP_001338035
NP_001338036
NP_001338037
NP_001161843
NP_001161844
NP_001161845
NP_082080
NP_663382
Локус (UCSC) Хр. 3: 49.11 – 49.12 Mb Хр. 9: 108.37 – 108.38 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

USP19 (англ. Ubiquitin specific peptidase 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 318 амінокислот, а молекулярна маса — 145 651[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSGGASATGPRRGPPGLEDTTSKKKQKDRANQESKDGDPRKETGSRYVAQ
AGLEPLASGDPSASASHAAGITGSRHRTRLFFPSSSGSASTPQEEQTKEG
ACEDPHDLLATPTPELLLDWRQSAEEVIVKLRVGVGPLQLEDVDAAFTDT
DCVVRFAGGQQWGGVFYAEIKSSCAKVQTRKGSLLHLTLPKKVPMLTWPS
LLVEADEQLCIPPLNSQTCLLGSEENLAPLAGEKAVPPGNDPVSPAMVRS
RNPGKDDCAKEEMAVAADAATLVDEPESMVNLAFVKNDSYEKGPDSVVVH
VYVKEICRDTSRVLFREQDFTLIFQTRDGNFLRLHPGCGPHTTFRWQVKL
RNLIEPEQCTFCFTASRIDICLRKRQSQRWGGLEAPAARVGGAKVAVPTG
PTPLDSTPPGGAPHPLTGQEEARAVEKDKSKARSEDTGLDSVATRTPMEH
VTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGLV
NLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGF
AVLLRALWKGTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGL
HEDLNRIQNKPYTETVDSDGRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIVDLFQGQY
KSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLPQKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFL
VSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDT
VSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQQS
EDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASR
LTYARLAQLLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMALESQSPGCTTLLSTGSLEA
GDSERDPIQPPELQLVTPMAEGDTGLPRVWAAPDRGPVPSTSGISSEMLA
SGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMNAHTPQFFIYKIDSSNRE
QRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAG
EAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLP
NVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYD
LYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQ
VVTRYAYVLFYRRRNSPVERPPRAGHSEHHPDLGPAAEAAASQASRIWQE
LEAEEEPVPEGSGPLGPWGPQDWVGPLPRGPTTPDEGCLRYFVLGTVAAL
VALVLNVFYPLVSQSRWR

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Mei Y., Hahn A.A., Hu S., Yang X. (2011). The USP19 deubiquitinase regulates the stability of c-IAP1 and c-IAP2. J. Biol. Chem. 286: 35380—35387. PMID 21849505 DOI:10.1074/jbc.M111.282020

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12617 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, O94966 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.