UVSSA : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

UVSSA

Ідентифікатори

Символи

UVSSA, KIAA1530, UVSS3, UV stimulated scaffold protein A

Зовнішні ІД

OMIM: 614632 MGI: 1918351 HomoloGene: 13807 GeneCards: UVSSA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • хромосома
Біологічний процес	• transcription-coupled nucleotide-excision repair • response to UV • Убіквітин-залежний протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57654


71101

Ensembl


ENSG00000163945


ENSMUSG00000037355

UniProt


Q2YD98


Q9D479

RefSeq (мРНК)


NM_020894 NM_001317934 NM_001317935


NM_001081101 NM_027674

RefSeq (білок)


NP_001304863 NP_001304864 NP_065945


NP_001074570 NP_081950

Локус (UCSC)

Хр. 4: 1.35 – 1.4 Mb

Хр. 5: 33.54 – 33.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UVSSA (англ. UV stimulated scaffold protein A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 80 591^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQKLSKLVE	ELTTSGEPRL	NPEKMKELKK	ICKSSEEQLS	RAYRLLIAQL
TQEHAEIRLS	AFQIVEELFV	RSHQFRMLVV	SNFQEFLELT	LGTDPAQPLP
PPREAAQRLR	QATTRAVEGW	NEKFGEAYKK	LALGYHFLRH	NKKVDFQDTN
ARSLAERKRE	EEKQKHLDKI	YQERASQAER	EMQEMSGEIE	SCLTEVESCF
RLLVPFDFDP	NPETESLGMA	SGMSDALRSS	CAGQVGPCRS	GTPDPRDGEQ
PCCSRDLPAS	AGHPRAGGGA	QPSQTATGDP	SDEDEDSDLE	EFVRSHGLGS
HKYTLDVELC	SEGLKVQENE	DNLALIHAAR	DTLKLIRNKF	LPAVCSWIQR
FTRVGTHGGC	LKRAIDLKAE	LELVLRKYKE	LDIEPEGGER	RRTEALGDAE
EDEDDEDFVE	VPEKEGYEPH	IPDHLRPEYG	LEAAPEKDTV	VRCLRTRTRM
DEEVSDPTSA	AAQLRQLRDH	LPPPSSASPS	RALPEPQEAQ	KLAAERARAP
VVPYGVDLHY	WGQELPTAGK	IVKSDSQHRF	WKPSEVEEEV	VNADISEMLR
SRHITFAGKF	EPVQHWCRAP	RPDGRLCERQ	DRLKCPFHGK	IVPRDDEGRP
LDPEDRAREQ	RRQLQKQERP	EWQDPELMRD	VEAATGQDLG	SSRYSGKGRG
KKRRYPSLTN	LKAQADTARA	RIGRKVFAKA	AVRRVVAAMN	RMDQKKHEKF
SNQFNYALN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у хромосомах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29304 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q2YD98 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.