VARS2

Ідентифікатори

Символи

VARS2, COXPD20, VALRS, VARS2L, VARSL, valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial

Зовнішні ІД

OMIM: 612802 MGI: 1916165 HomoloGene: 57502 GeneCards: VARS2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • valine-tRNA ligase activity • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • aminoacyl-tRNA editing activity
Клітинна компонента	• мітохондрія • гіалоплазма
Біологічний процес	• Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • valyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57176


68915

Ensembl

ENSG00000137411 ENSG00000206476 ENSG00000234032 ENSG00000230985 ENSG00000236178
ENSG00000223494


ENSMUSG00000038838

UniProt


Q5ST30


Q3U2A8

RefSeq (мРНК)


NM_020442 NM_001167733 NM_001167734


NM_175137

RefSeq (білок)


NP_001161205 NP_001161206 NP_065175


NP_780346

Локус (UCSC)

Хр. 6: 30.91 – 30.93 Mb

Хр. 17: 35.97 – 35.98 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VARS2 (англ. Valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 063 амінокислот, а молекулярна маса — 118 490^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPHLPLASFR	PPFWGLRHSR	GLPRFHSVST	QSEPHGSPIS	RRNREAKQKR
LREKQATLEA	EIAGESKSPA	ESIKAWRPKE	LVLYEIPTKP	GEKKDVSGPL
PPAYSPRYVE	AAWYPWWVRE	GFFKPEYQAR	LPQATGETFS	MCIPPPNVTG
SLHIGHALTV	AIQDALVRWH	RMRGDQVLWV	PGSDHAGIAT	QAVVEKQLWK
ERGVRRHELS	REAFLREVWQ	WKEAKGGEIC	EQLRALGASL	DWDRECFTMD
VGSSVAVTEA	FVRLYKAGLL	YRNHQLVNWS	CALRSAISDI	EVENRPLPGH
TQLRLPGCPT	PVSFGLLFSV	AFPVDGEPDA	EVVVGTTRPE	TLPGDVAVAV
HPDDSRYTHL	HGRQLRHPLM	GQPLPLITDY	AVQPHVGTGA	VKVTPAHSPA
DAEMGARHGL	SPLNVIAEDG	TMTSLCGDWL	QGLHRFVARE	KIMSVLSEWG
LFRGLQNHPM	VLPICSRSGD	VIEYLLKNQW	FVRCQEMGAR	AAKAVESGAL
ELSPSFHQKN	WQHWFSHIGD	WCVSRQLWWG	HQIPAYLVVE	DHAQGEEDCW
VVGRSEAEAR	EVAAELTGRP	GAELTLERDP	DVLDTWFSSA	LFPFSALGWP
QETPDLARFY	PLSLLETGSD	LLLFWVGRMV	MLGTQLTGQL	PFSKVLLHPM
VRDRQGRKMS	KSLGNVLDPR	DIISGVEMQV	LQEKLRSGNL	DPAELAIVAA
AQKKDFPHGI	PECGTDALRF	TLCSHGVQAG	DLHLSVSEVQ	SCRHFCNKIW
NALRFILNAL	GEKFVPQPAE	ELSPSSPMDA	WILSRLALAA	QECERGFLTR
ELSLVTHALH	HFWLHNLCDV	YLEAVKPVLW	HSPRPLGPPQ	VLFSCADLGL
RLLAPLMPFL	AEELWQRLPP	RPGCPPAPSI	SVAPYPSACS	LEHWRQPELE
RRFSRVQEVV	QVLRALRATY	QLTKARPRVL	LQSSEPGDQG	LFEAFLEPLG
TLGYCGAVGL	LPPGAAAPSG	WAQAPLSDTA	QVYMELQGLV	DPQIQLPLLA
ARRYKLQKQL	DSLTARTPSE	GEAGTQRQQK	LSSLQLELSK	LDKAASHLRQ
LMDEPPAPGS	PEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-трнк-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21642 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5ST30 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2018. Процитовано 19 вересня 2017.