VCPIP1

Ідентифікатори

Символи

VCPIP1, DUBA3, VCIP135, valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1, valosin containing protein interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 611745 MGI: 1917925 HomoloGene: 11814 GeneCards: VCPIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • Golgi stack • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum lumen
Біологічний процес	• endoplasmic reticulum membrane fusion • protein K48-linked deubiquitination • Golgi organization • Убіквітин-залежний протеоліз • protein K11-linked deubiquitination • протеоліз • Golgi reassembly • GO:0007067 мітоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80124


70675

Ensembl


ENSG00000175073


ENSMUSG00000045210

UniProt


Q96JH7


Q8CDG3

RefSeq (мРНК)


NM_025054


NM_173443

RefSeq (білок)


NP_079330


NP_775619

Локус (UCSC)

Хр. 8: 66.63 – 66.67 Mb

Хр. 1: 9.79 – 9.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VCPIP1 (англ. Valosin containing protein interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 222 амінокислот, а молекулярна маса — 134 321^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQPPPPPPP	LPPPPPPPEA	PQTPSSLASA	AASGGLLKRR	DRRILSGSCP
DPKCQARLFF	PASGSVSIEC	TECGQRHEQQ	QLLGVEEVTD	PDVVLHNLLR
NALLGVTGAP	KKNTELVKVM	GLSNYHCKLL	SPILARYGMD	KQTGRAKLLR
DMNQGELFDC	ALLGDRAFLI	EPEHVNTVGY	GKDRSGSLLY	LHDTLEDIKR
ANKSQECLIP	VHVDGDGHCL	VHAVSRALVG	RELFWHALRE	NLKQHFQQHL
ARYQALFHDF	IDAAEWEDII	NECDPLFVPP	EGVPLGLRNI	HIFGLANVLH
RPIILLDSLS	GMRSSGDYSA	TFLPGLIPAE	KCTGKDGHLN	KPICIAWSSS
GRNHYIPLVG	IKGAALPKLP	MNLLPKAWGV	PQDLIKKYIK	LEEDGGCVIG
GDRSLQDKYL	LRLVAAMEEV	FMDKHGIHPS	LVADVHQYFY	RRTGVIGVQP
EEVTAAAKKA	VMDNRLHKCL	LCGALSELHV	PPEWLAPGGK	LYNLAKSTHG
QLRTDKNYSF	PLNNLVCSYD	SVKDVLVPDY	GMSNLTACNW	CHGTSVRKVR
GDGSIVYLDG	DRTNSRSTGG	KCGCGFKHFW	DGKEYDNLPE	AFPITLEWGG
RVVRETVYWF	QYESDSSLNS	NVYDVAMKLV	TKHFPGEFGS	EILVQKVVHT
ILHQTAKKNP	DDYTPVNIDG	AHAQRVGDVQ	GQESESQLPT	KIILTGQKTK
TLHKEELNMS	KTERTIQQNI	TEQASVMQKR	KTEKLKQEQK	GQPRTVSPST
IRDGPSSAPA	TPTKAPYSPT	TSKEKKIRIT	TNDGRQSMVT	LKSSTTFFEL
QESIAREFNI	PPYLQCIRYG	FPPKELMPPQ	AGMEKEPVPL	QHGDRITIEI
LKSKAEGGQS	AAAHSAHTVK	QEDIAVTGKL	SSKELQEQAE	KEMYSLCLLA
TLMGEDVWSY	AKGLPHMFQQ	GGVFYSIMKK	TMGMADGKHC	TFPHLPGKTF
VYNASEDRLE	LCVDAAGHFP	IGPDVEDLVK	EAVSQVRAEA	TTRSRESSPS
HGLLKLGSGG	VVKKKSEQLH	NVTAFQGKGH	SLGTASGNPH	LDPRARETSV
VRKHNTGTDF	SNSSTKTEPS	VFTASSSNSE	LIRIAPGVVT	MRDGRQLDPD
LVEAQRKKLQ	EMVSSIQASM	DRHLRDQSTE	QSPSDLPQRK	TEVVSSSAKS
GSLQTGLPES	FPLTGGTENL	NTETTDGCVA	DALGAAFATR	SKAQRGNSVE
ELEEMDSQDA	EMTNTTEPMD	HS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30897 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96JH7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.