VCPIP1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VCPIP1, DUBA3, VCIP135, valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1, valosin containing protein interacting protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611745 MGI: 1917925 HomoloGene: 11814 GeneCards: VCPIP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Golgi stack • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum lumen |
---|
Біологічний процес | • endoplasmic reticulum membrane fusion • protein K48-linked deubiquitination • Golgi organization • Убіквітин-залежний протеоліз • protein K11-linked deubiquitination • протеоліз • Golgi reassembly • GO:0007067 мітоз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b8/PBB_GE_VCPIP1_219810_at_fs.png/250px-PBB_GE_VCPIP1_219810_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 66.63 – 66.67 Mb | Хр. 1: 9.79 – 9.82 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VCPIP1 (англ. Valosin containing protein interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 222 амінокислот, а молекулярна маса — 134 321[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSQPPPPPPP | | LPPPPPPPEA | | PQTPSSLASA | | AASGGLLKRR | | DRRILSGSCP |
DPKCQARLFF | | PASGSVSIEC | | TECGQRHEQQ | | QLLGVEEVTD | | PDVVLHNLLR |
NALLGVTGAP | | KKNTELVKVM | | GLSNYHCKLL | | SPILARYGMD | | KQTGRAKLLR |
DMNQGELFDC | | ALLGDRAFLI | | EPEHVNTVGY | | GKDRSGSLLY | | LHDTLEDIKR |
ANKSQECLIP | | VHVDGDGHCL | | VHAVSRALVG | | RELFWHALRE | | NLKQHFQQHL |
ARYQALFHDF | | IDAAEWEDII | | NECDPLFVPP | | EGVPLGLRNI | | HIFGLANVLH |
RPIILLDSLS | | GMRSSGDYSA | | TFLPGLIPAE | | KCTGKDGHLN | | KPICIAWSSS |
GRNHYIPLVG | | IKGAALPKLP | | MNLLPKAWGV | | PQDLIKKYIK | | LEEDGGCVIG |
GDRSLQDKYL | | LRLVAAMEEV | | FMDKHGIHPS | | LVADVHQYFY | | RRTGVIGVQP |
EEVTAAAKKA | | VMDNRLHKCL | | LCGALSELHV | | PPEWLAPGGK | | LYNLAKSTHG |
QLRTDKNYSF | | PLNNLVCSYD | | SVKDVLVPDY | | GMSNLTACNW | | CHGTSVRKVR |
GDGSIVYLDG | | DRTNSRSTGG | | KCGCGFKHFW | | DGKEYDNLPE | | AFPITLEWGG |
RVVRETVYWF | | QYESDSSLNS | | NVYDVAMKLV | | TKHFPGEFGS | | EILVQKVVHT |
ILHQTAKKNP | | DDYTPVNIDG | | AHAQRVGDVQ | | GQESESQLPT | | KIILTGQKTK |
TLHKEELNMS | | KTERTIQQNI | | TEQASVMQKR | | KTEKLKQEQK | | GQPRTVSPST |
IRDGPSSAPA | | TPTKAPYSPT | | TSKEKKIRIT | | TNDGRQSMVT | | LKSSTTFFEL |
QESIAREFNI | | PPYLQCIRYG | | FPPKELMPPQ | | AGMEKEPVPL | | QHGDRITIEI |
LKSKAEGGQS | | AAAHSAHTVK | | QEDIAVTGKL | | SSKELQEQAE | | KEMYSLCLLA |
TLMGEDVWSY | | AKGLPHMFQQ | | GGVFYSIMKK | | TMGMADGKHC | | TFPHLPGKTF |
VYNASEDRLE | | LCVDAAGHFP | | IGPDVEDLVK | | EAVSQVRAEA | | TTRSRESSPS |
HGLLKLGSGG | | VVKKKSEQLH | | NVTAFQGKGH | | SLGTASGNPH | | LDPRARETSV |
VRKHNTGTDF | | SNSSTKTEPS | | VFTASSSNSE | | LIRIAPGVVT | | MRDGRQLDPD |
LVEAQRKKLQ | | EMVSSIQASM | | DRHLRDQSTE | | QSPSDLPQRK | | TEVVSSSAKS |
GSLQTGLPES | | FPLTGGTENL | | NTETTDGCVA | | DALGAAFATR | | SKAQRGNSVE |
ELEEMDSQDA | | EMTNTTEPMD | | HS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.
Література
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30897 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96JH7 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |