VPS28

Ідентифікатори

Символи

VPS28, ESCRT-I subunit, VPS28 subunit of ESCRT-I

Зовнішні ІД

OMIM: 611952 MGI: 1914164 HomoloGene: 69205 GeneCards: VPS28

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • клітинна мембрана • early endosome • endosome membrane • екзосома • ESCRT I complex • host cell
Біологічний процес	• GO:0046795 intracellular transport of virus • positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • viral budding via host ESCRT complex • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body assembly • endosomal transport • negative regulation of protein ubiquitination • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51160


66914

Ensembl


ENSG00000160948 ENSG00000285339


ENSMUSG00000115987

UniProt


Q9UK41 Q548N1


Q9D1C8

RefSeq (мРНК)


NM_016208 NM_183057


NM_025842 NM_001305668

RefSeq (білок)


NP_057292 NP_898880 NP_057292.1


NP_001292597 NP_080118

Локус (UCSC)

Хр. 8: 144.42 – 144.43 Mb

Хр. 15: 76.51 – 76.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VPS28 (англ. VPS28, ESCRT-I subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 425^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFHGIPATPG	IGAPGNKPEL	YEEVKLYKNA	REREKYDNMA	ELFAVVKTMQ
ALEKAYIKDC	VSPSEYTAAC	SRLLVQYKAA	FRQVQGSEIS	SIDEFCRKFR
LDCPLAMERI	KEDRPITIKD	DKGNLNRCIA	DVVSLFITVM	DKLRLEIRAM
DEIQPDLREL	METMHRMSHL	PPDFEGRQTV	SQWLQTLSGM	SASDELDDSQ
VRQMLFDLES	AYNAFNRFLH	A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bishop N., Horman A., Woodman P. (2002). Mammalian class E vps proteins recognize ubiquitin and act in the removal of endosomal protein-ubiquitin conjugates. J. Cell Biol. 157: 91—101. PMID 11916981 DOI:10.1083/jcb.200112080
Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18178 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UK41 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.