VPS36 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2HTH, 2ZME, 3CUQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS36, C13orf9, EAP45, CGI-145, vacuolar protein sorting 36 homolog |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610903 MGI: 1917410 HomoloGene: 9374 GeneCards: VPS36 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • protein C-terminus binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • late endosome • мембрана • late endosome membrane • лізосома • екзосома • клітинне ядро • ендосома • ESCRT II complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multivesicular body assembly • transcription, DNA-templated • endosomal transport • protein transport • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • GO:0015915 транспорт • endosome transport via multivesicular body sorting pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016075 NM_001282168 NM_001282169 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001269097 NP_001269098 NP_057159 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 52.41 – 52.45 Mb | Хр. 8: 22.68 – 22.71 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS36 (англ. Vacuolar protein sorting 36 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 43 817[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDRFVWTSGL | | LEINETLVIQ | | QRGVRIYDGE | | EKIKFDAGTL | | LLSTHRLIWR |
DQKNHECCMA | | ILLSQIVFIE | | EQAAGIGKSA | | KIVVHLHPAP | | PNKEPGPFQS |
SKNSYIKLSF | | KEHGQIEFYR | | RLSEEMTQRR | | WENMPVSQSL | | QTNRGPQPGR |
IRAVGIVGIE | | RKLEEKRKET | | DKNISEAFED | | LSKLMIKAKE | | MVELSKSIAN |
KIKDKQGDIT | | EDETIRFKSY | | LLSMGIANPV | | TRETYGSGTQ | | YHMQLAKQLA |
GILQVPLEER | | GGIMSLTEVY | | CLVNRARGME | | LLSPEDLVNA | | CKMLEALKLP |
LRLRVFDSGV | | MVIELQSHKE | | EEMVASALET | | VSEKGSLTSE | | EFAKLVGMSV |
LLAKERLLLA | | EKMGHLCRDD | | SVEGLRFYPN | | LFMTQS |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.
Література
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
- Wang T., Hong W. (2006). RILP interacts with VPS22 and VPS36 of ESCRT-II and regulates their membrane recruitment. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 413—423. PMID 17010938 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.064
- Maleroed L., Stuffers S., Brech A., Stenmark H. (2007). Vps22/EAP30 in ESCRT-II mediates endosomal sorting of growth factor and chemokine receptors destined for lysosomal degradation. Traffic. 8: 1617—1629. PMID 17714434 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00630.x
- Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20312 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q86VN1 (англ.) . Архів оригіналу за 26 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |