VPS52

Ідентифікатори

Символи

VPS52, ARE1, SAC2, SACM2L, dJ1033B10.5, GARP complex subunit, VPS52 subunit of GARP complex

Зовнішні ІД

OMIM: 603443 MGI: 1330304 HomoloGene: 5756 GeneCards: VPS52

Онтологія гена
Молекулярна функція	• syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome • EARP complex • ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • trans-Golgi network membrane • GARP complex • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein transport • ectodermal cell differentiation • embryonic ectodermal digestive tract development • endocytic recycling • lysosomal transport • Golgi to vacuole transport • retrograde transport, endosome to Golgi
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6293


224705

Ensembl

ENSG00000236014 ENSG00000206286 ENSG00000223501 ENSG00000224455 ENSG00000225590
ENSG00000223618 ENSG00000228425


ENSMUSG00000024319

UniProt


Q8N1B4


Q8C754

RefSeq (мРНК)


NM_001289174 NM_001289175 NM_001289176 NM_022553


NM_172620 NM_001357329 NM_001357330 NM_001379410 NM_001379411

RefSeq (білок)


NP_001276103 NP_001276104 NP_001276105 NP_072047


NP_766208 NP_001344258 NP_001344259 NP_001366339 NP_001366340

Локус (UCSC)

Хр. 6: 33.25 – 33.27 Mb

Хр. 17: 34.17 – 34.19 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VPS52 (англ. VPS52, GARP complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 82 221^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAATMAAA	ARELVLRAGT	SDMEEEEGPL	AGGPGLQEPL	QLGELDITSD
EFILDEVDVH	IQANLEDELV	KEALKTGVDL	RHYSKQVELE	LQQIEQKSIR
DYIQESENIA	SLHNQITACD	AVLERMEQML	GAFQSDLSSI	SSEIRTLQEQ
SGAMNIRLRN	RQAVRGKLGE	LVDGLVVPSA	LVTAILEAPV	TEPRFLEQLQ
ELDAKAAAVR	EQEARGTAAC	ADVRGVLDRL	RVKAVTKIRE	FILQKIYSFR
KPMTNYQIPQ	TALLKYRFFY	QFLLGNERAT	AKEIRDEYVE	TLSKIYLSYY
RSYLGRLMKV	QYEEVAEKDD	LMGVEDTAKK	GFFSKPSLRS	RNTIFTLGTR
GSVISPTELE	APILVPHTAQ	RGEQRYPFEA	LFRSQHYALL	DNSCREYLFI
CEFFVVSGPA	AHDLFHAVMG	RTLSMTLKHL	DSYLADCYDA	IAVFLCIHIV
LRFRNIAAKR	DVPALDRYWE	QVLALLWPRF	ELILEMNVQS	VRSTDPQRLG
GLDTRPHYIT	RRYAEFSSAL	VSINQTIPNE	RTMQLLGQLQ	VEVENFVLRV
AAEFSSRKEQ	LVFLINNYDM	MLGVLMERAA	DDSKEVESFQ	QLLNARTQEF
IEELLSPPFG	GLVAFVKEAE	ALIERGQAER	LRGEEARVTQ	LIRGFGSSWK
SSVESLSQDV	MRSFTNFRNG	TSIIQGALTQ	LIQLYHRFHR	VLSQPQLRAL
PARAELINIH	HLMVELKKHK	PNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Perez-Victoria F.J., Mardones G.A., Bonifacino J.S. (2008). Requirement of the human GARP complex for mannose 6-phosphate-receptor-dependent sorting of cathepsin D to lysosomes. Mol. Biol. Cell. 19: 2350—2362. PMID 18367545 DOI:10.1091/mbc.E07-11-1189
Schindler C., Chen Y., Pu J., Guo X., Bonifacino J.S. (2015). EARP is a multisubunit tethering complex involved in endocytic recycling. Nat. Cell Biol. 17: 639—650. PMID 25799061 DOI:10.1038/ncb3129

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10518 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N1B4 (англ.) . Архів оригіналу за 13 листопада 2017. Процитовано 6 вересня 2017.