VPS52 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS52, ARE1, SAC2, SACM2L, dJ1033B10.5, GARP complex subunit, VPS52 subunit of GARP complex |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603443 MGI: 1330304 HomoloGene: 5756 GeneCards: VPS52 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • perinuclear region of cytoplasm • recycling endosome • EARP complex • ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • мембрана • trans-Golgi network membrane • GARP complex • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • protein transport • ectodermal cell differentiation • embryonic ectodermal digestive tract development • endocytic recycling • lysosomal transport • Golgi to vacuole transport • retrograde transport, endosome to Golgi |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8f/PBB_GE_VPS52_214585_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_VPS52_214585_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000236014 ENSG00000206286 ENSG00000223501 ENSG00000224455 ENSG00000225590
| ENSG00000223618 ENSG00000228425 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001289174 NM_001289175 NM_001289176 NM_022553 |
| | NM_172620 NM_001357329 NM_001357330 NM_001379410 NM_001379411 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001276103 NP_001276104 NP_001276105 NP_072047 |
| | NP_766208 NP_001344258 NP_001344259 NP_001366339 NP_001366340 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 33.25 – 33.27 Mb | Хр. 17: 34.17 – 34.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS52 (англ. VPS52, GARP complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 82 221[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAATMAAA | | ARELVLRAGT | | SDMEEEEGPL | | AGGPGLQEPL | | QLGELDITSD |
EFILDEVDVH | | IQANLEDELV | | KEALKTGVDL | | RHYSKQVELE | | LQQIEQKSIR |
DYIQESENIA | | SLHNQITACD | | AVLERMEQML | | GAFQSDLSSI | | SSEIRTLQEQ |
SGAMNIRLRN | | RQAVRGKLGE | | LVDGLVVPSA | | LVTAILEAPV | | TEPRFLEQLQ |
ELDAKAAAVR | | EQEARGTAAC | | ADVRGVLDRL | | RVKAVTKIRE | | FILQKIYSFR |
KPMTNYQIPQ | | TALLKYRFFY | | QFLLGNERAT | | AKEIRDEYVE | | TLSKIYLSYY |
RSYLGRLMKV | | QYEEVAEKDD | | LMGVEDTAKK | | GFFSKPSLRS | | RNTIFTLGTR |
GSVISPTELE | | APILVPHTAQ | | RGEQRYPFEA | | LFRSQHYALL | | DNSCREYLFI |
CEFFVVSGPA | | AHDLFHAVMG | | RTLSMTLKHL | | DSYLADCYDA | | IAVFLCIHIV |
LRFRNIAAKR | | DVPALDRYWE | | QVLALLWPRF | | ELILEMNVQS | | VRSTDPQRLG |
GLDTRPHYIT | | RRYAEFSSAL | | VSINQTIPNE | | RTMQLLGQLQ | | VEVENFVLRV |
AAEFSSRKEQ | | LVFLINNYDM | | MLGVLMERAA | | DDSKEVESFQ | | QLLNARTQEF |
IEELLSPPFG | | GLVAFVKEAE | | ALIERGQAER | | LRGEEARVTQ | | LIRGFGSSWK |
SSVESLSQDV | | MRSFTNFRNG | | TSIIQGALTQ | | LIQLYHRFHR | | VLSQPQLRAL |
PARAELINIH | | HLMVELKKHK | | PNF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Perez-Victoria F.J., Mardones G.A., Bonifacino J.S. (2008). Requirement of the human GARP complex for mannose 6-phosphate-receptor-dependent sorting of cathepsin D to lysosomes. Mol. Biol. Cell. 19: 2350—2362. PMID 18367545 DOI:10.1091/mbc.E07-11-1189
- Schindler C., Chen Y., Pu J., Guo X., Bonifacino J.S. (2015). EARP is a multisubunit tethering complex involved in endocytic recycling. Nat. Cell Biol. 17: 639—650. PMID 25799061 DOI:10.1038/ncb3129
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10518 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8N1B4 (англ.) . Архів оригіналу за 13 листопада 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |