WAPL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4K6J, 5HDT

Ідентифікатори

Символи

WAPL, FOE, KIAA0261, WAPAL, WAPL cohesin release factor

Зовнішні ІД

OMIM: 610754 MGI: 2675859 HomoloGene: 41002 GeneCards: WAPL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • GO:0000798 cohesin complex • хромосома • Хроматин • synaptonemal complex • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of sister chromatid cohesion • negative regulation of chromatin binding • positive regulation of fibroblast proliferation • negative regulation of DNA replication • regulation of cohesin loading • поділ клітини • regulation of chromosome segregation • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • protein localization to chromatin • response to toxic substance • mitotic sister chromatid cohesion • regulation of chromosome condensation • meiotic chromosome segregation • GO:0007067 мітоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23063


218914

Ensembl


ENSG00000062650


ENSMUSG00000041408

UniProt


Q7Z5K2


Q65Z40

RefSeq (мРНК)


NM_015045 NM_001318328


NM_001004436 NM_001301330

RefSeq (білок)


NP_001305257 NP_055860


NP_001004436 NP_001288259

Локус (UCSC)

Хр. 10: 86.44 – 86.52 Mb

Хр. 14: 34.4 – 34.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WAPL (англ. WAPL cohesin release factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 190 амінокислот, а молекулярна маса — 132 946^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSRFGKTYS	RKGGNGSSKF	DEVFSNKRTT	LSTKWGETTF	MAKLGQKRPN
FKPDIQEIPK	KPKVEEESTG	DPFGFDSDDE	SLPVSSKNLA	QVKCSSYSES
SEAAQLEEVT	SVLEANSKIS	HVVVEDTVVS	DKCFPLEDTL	LGKEKSTNRI
VEDDASISSC	NKLITSDKVE	NFHEEHEKNS	HHIHKNADDS	TKKPNAETTV
ASEIKETNDT	WNSQFGKRPE	SPSEISPIKG	SVRTGLFEWD	NDFEDIRSED
CILSLDSDPL	LEMKDDDFKN	RLENLNEAIE	EDIVQSVLRP	TNCRTYCRAN
KTKSSQGASN	FDKLMDGTSQ	ALAKANSESS	KDGLNQAKKG	GVSCGTSFRG
TVGRTRDYTV	LHPSCLSVCN	VTIQDTMERS	MDEFTASTPA	DLGEAGRLRK
KADIATSKTT	TRFRPSNTKS	KKDVKLEFFG	FEDHETGGDE	GGSGSSNYKI
KYFGFDDLSE	SEDDEDDDCQ	VERKTSKKRT	KTAPSPSLQP	PPESNDNSQD
SQSGTNNAEN	LDFTEDLPGV	PESVKKPINK	QGDKSKENTR	KIFSGPKRSP
TKAVYNARHW	NHPDSEELPG	PPVVKPQSVT	VRLSSKEPNQ	KDDGVFKAPA
PPSKVIKTVT	IPTQPYQDIV	TALKCRREDK	ELYTVVQHVK	HFNDVVEFGE
NQEFTDDIEY	LLSGLKSTQP	LNTRCLSVIS	LATKCAMPSF	RMHLRAHGMV
AMVFKTLDDS	QHHQNLSLCT	AALMYILSRD	RLNMDLDRAS	LDLMIRLLEL
EQDASSAKLL	NEKDMNKIKE	KIRRLCETVH	NKHLDLENIT	TGHLAMETLL
SLTSKRAGDW	FKEELRLLGG	LDHIVDKVKE	CVDHLSRDED	EEKLVASLWG
AERCLRVLES	VTVHNPENQS	YLIAYKDSQL	IVSSAKALQH	CEELIQQYNR
AEDSICLADS	KPLPHQNVTN	HVGKAVEDCM	RAIIGVLLNL	TNDNEWGSTK
TGEQDGLIGT	ALNCVLQVPK	YLPQEQRFDI	RVLGLGLLIN	LVEYSARNRH
CLVNMETSCS	FDSSICSGEG	DDSLRIGGQV	HAVQALVQLF	LERERAAQLA
ESKTDELIKD	APTTQHDKSG	EWQETSGEIQ	WVSTEKTDGT	EEKHKKEEED
EELDLNKALQ	HAGKHMEDCI	VASYTALLLG	CLCQESPINV	TTVREYLPEG
DFSIMTEMLK	KFLSFMNLTC	AVGTTGQKSI	SRVIEYLEHC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Kwiatkowski B.A., Ragoczy T., Ehly J., Schubach W.H. (2004). Identification and cloning of a novel chromatin-associated protein partner of Epstein-Barr nuclear protein 2. Exp. Cell Res. 300: 223—233. PMID 15383329 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.06.028
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gandhi R., Gillespie P.J., Hirano T. (2006). Human Wapl is a cohesin-binding protein that promotes sister-chromatid resolution in mitotic prophase. Curr. Biol. 16: 2406—2417. PMID 17112726 DOI:10.1016/j.cub.2006.10.061
Shintomi K., Hirano T. (2009). Releasing cohesin from chromosome arms in early mitosis: opposing actions of Wapl-Pds5 and Sgo1. Genes Dev. 23: 2224—2236. PMID 19696148 DOI:10.1101/gad.1844309
Terret M.E., Sherwood R., Rahman S., Qin J., Jallepalli P.V. (2009). Cohesin acetylation speeds the replication fork. Nature. 462: 231—234. PMID 19907496 DOI:10.1038/nature08550

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23293 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z5K2 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2017. Процитовано 8 вересня 2017.