WDR1

Ідентифікатори

Символи

WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, WD repeat domain 1, PFITS

Зовнішні ІД

OMIM: 604734 MGI: 1337100 HomoloGene: 6628 GeneCards: WDR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • actin filament binding
Клітинна компонента	• extracellular region • myelin sheath • podosome • міжклітинні контакти • cell projection • екзосома • цитоскелет • мікрофіламент • cell-cell junction • цитоплазма • гіалоплазма • cortical actin cytoskeleton • клітинна мембрана
Біологічний процес	• platelet degranulation • слух • actin cytoskeleton organization • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization • regulation of oligodendrocyte differentiation • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • apical junction assembly • regulation of actin filament depolymerization • neutrophil mediated immunity • regulation of cell shape • actin filament fragmentation • Тромбоцитопоез • positive regulation of actin filament depolymerization • cortical cytoskeleton organization • locomotion • establishment of planar polarity of follicular epithelium • sarcomere organization • neutrophil migration • actin filament depolymerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9948


22388

Ensembl


ENSG00000071127


ENSMUSG00000005103

UniProt


O75083


O88342

RefSeq (мРНК)


NM_005112 NM_017491


NM_011715

RefSeq (білок)


NP_005103 NP_059830


NP_035845

Локус (UCSC)

Хр. 4: 10.07 – 10.12 Mb

Хр. 5: 38.68 – 38.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WDR1 (англ. WD repeat domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 606 амінокислот, а молекулярна маса — 66 194^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPYEIKKVFA	SLPQVERGVS	KIIGGDPKGN	NFLYTNGKCV	ILRNIDNPAL
ADIYTEHAHQ	VVVAKYAPSG	FYIASGDVSG	KLRIWDTTQK	EHLLKYEYQP
FAGKIKDIAW	TEDSKRIAVV	GEGREKFGAV	FLWDSGSSVG	EITGHNKVIN
SVDIKQSRPY	RLATGSDDNC	AAFFEGPPFK	FKFTIGDHSR	FVNCVRFSPD
GNRFATASAD	GQIYIYDGKT	GEKVCALGGS	KAHDGGIYAI	SWSPDSTHLL
SASGDKTSKI	WDVSVNSVVS	TFPMGSTVLD	QQLGCLWQKD	HLLSVSLSGY
INYLDRNNPS	KPLHVIKGHS	KSIQCLTVHK	NGGKSYIYSG	SHDGHINYWD
SETGENDSFA	GKGHTNQVSR	MTVDESGQLI	SCSMDDTVRY	TSLMLRDYSG
QGVVKLDVQP	KCVAVGPGGY	AVVVCIGQIV	LLKDQRKCFS	IDNPGYEPEV
VAVHPGGDTV	AIGGVDGNVR	LYSILGTTLK	DEGKLLEAKG	PVTDVAYSHD
GAFLAVCDAS	KVVTVFSVAD	GYSENNVFYG	HHAKIVCLAW	SPDNEHFASG
GMDMMVYVWT	LSDPETRVKI	QDAHRLHHVS	SLAWLDEHTL	VTTSHDASVK
EWTITY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Adler H.J., Winnicki R.S., Gong T.-W.L., Lomax M.I. (1999). A gene upregulated in the acoustically damaged chick basilar papilla encodes a novel WD40 repeat protein. Genomics. 56: 59—69. PMID 10036186 DOI:10.1006/geno.1998.5672
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cervero P., Himmel M., Kruger M., Linder S. (2012). Proteomic analysis of podosome fractions from macrophages reveals similarities to spreading initiation centres. Eur. J. Cell Biol. 91: 908—922. PMID 22721921 DOI:10.1016/j.ejcb.2012.05.005
Lechuga S., Baranwal S., Ivanov A.I. (2015). Actin-interacting protein 1 controls assembly and permeability of intestinal epithelial apical junctions. Am. J. Physiol. 308: G745—G756. PMID 25792565 DOI:10.1152/ajpgi.00446.2014

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12754 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, O75083 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.