WDR5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CNX, 2CO0, 2G99, 2G9A, 2GNQ, 2H13, 2H14, 2H68, 2H6K, 2H6N, 2H6Q, 2H9L, 2H9M, 2H9N, 2H9P, 2O9K, 3EG6, 3EMH, 3MXX, 3N0D, 3N0E, 3P4F, 3PSL, 3SMR, 3UR4, 3UVK, 3UVL, 3UVM, 3UVN, 3UVO, 4A7J, 4CY1, 4CY2, 4ERQ, 4ERY, 4ERZ, 4ES0, 4ESG, 4EWR, 4GM3, 4GM8, 4GM9, 4GMB, 4IA9, 4O45, 4QL1, 4Y7R, 5EAL, 5EAP, 5EAR, 4QQE, 5EAM

Ідентифікатори

Символи

WDR5, BIG-3, CFAP89, SWD3, WD repeat-containing protein 5, WD repeat domain 5

Зовнішні ІД

OMIM: 609012 MGI: 2155884 HomoloGene: 59931 GeneCards: WDR5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific) • histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific) • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific) • histone-lysine N-methyltransferase activity • GO:0031493 histone binding
Клітинна компонента	• Set1C/COMPASS complex • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • MLL1 complex • MLL3/4 complex • histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • ciliary basal body
Біологічний процес	• skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H4-K5 acetylation • histone H3-K4 methylation • histone H3 acetylation • histone H4-K16 acetylation • neuron projection development • histone H4-K8 acetylation • cilium assembly • посттрансляційна модифікація • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11091


140858

Ensembl


ENSG00000196363


ENSMUSG00000026917

UniProt


P61964


P61965

RefSeq (мРНК)


NM_017588 NM_052821


NM_080848

RefSeq (білок)


NP_060058 NP_438172


NP_543124

Локус (UCSC)

Хр. 9: 134.14 – 134.16 Mb

Хр. 2: 27.41 – 27.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WDR5 (англ. WD repeat domain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 36 588^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATEEKKPET	EAARAQPTPS	SSATQSKPTP	VKPNYALKFT	LAGHTKAVSS
VKFSPNGEWL	ASSSADKLIK	IWGAYDGKFE	KTISGHKLGI	SDVAWSSDSN
LLVSASDDKT	LKIWDVSSGK	CLKTLKGHSN	YVFCCNFNPQ	SNLIVSGSFD
ESVRIWDVKT	GKCLKTLPAH	SDPVSAVHFN	RDGSLIVSSS	YDGLCRIWDT
ASGQCLKTLI	DDDNPPVSFV	KFSPNGKYIL	AATLDNTLKL	WDYSKGKCLK
TYTGHKNEKY	CIFANFSVTG	GKWIVSGSED	NLVYIWNLQT	KEIVQKLQGH
TDVVISTACH	PTENIIASAA	LENDKTIKLW	KSDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
Lee J.-H., Skalnik D.G. (2005). CpG-binding protein (CXXC finger protein 1) is a component of the mammalian Set1 histone H3-Lys4 methyltransferase complex, the analogue of the yeast Set1/COMPASS complex. J. Biol. Chem. 280: 41725—41731. PMID 16253997 DOI:10.1074/jbc.M508312200
Lee J.-H., Tate C.M., You J.-S., Skalnik D.G. (2007). Identification and characterization of the human Set1B histone H3-Lys4 methyltransferase complex. J. Biol. Chem. 282: 13419—13428. PMID 17355966 DOI:10.1074/jbc.M609809200
Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes. Mol. Cell. Biol. 28: 609—618. PMID 17998332 DOI:10.1128/MCB.01356-07
Thompson B.A., Tremblay V., Lin G., Bochar D.A. (2008). CHD8 is an ATP-dependent chromatin remodeling factor that regulates beta-catenin target genes. Mol. Cell. Biol. 28: 3894—3904. PMID 18378692 DOI:10.1128/MCB.00322-08

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12757 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P61964 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.