WIPI2

Ідентифікатори

Символи

WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, IDDSSA

Зовнішні ІД

OMIM: 609225 MGI: 1923831 HomoloGene: 90887 GeneCards: WIPI2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • lipid binding
Клітинна компонента	• autophagosome • гіалоплазма • phagophore assembly site membrane • мембрана • phagophore assembly site • extrinsic component of membrane • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • macroautophagy • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • autophagy of nucleus • protein localization to phagophore assembly site • protein lipidation involved in autophagosome assembly • xenophagy • cellular response to starvation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26100


74781

Ensembl


ENSG00000157954


ENSMUSG00000029578

UniProt


Q9Y4P8


Q80W47

RefSeq (мРНК)

NM_001033518 NM_001033519 NM_001033520 NM_001278299 NM_015610
NM_016003


NM_178398

RefSeq (білок)

NP_001028690 NP_001028691 NP_001028692 NP_001265228 NP_056425
NP_057087 NP_056425.1


NP_848485

Локус (UCSC)

Хр. 7: 5.19 – 5.23 Mb

Хр. 5: 142.61 – 142.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WIPI2 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 49 408^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNLASQSGEA	GAGQLLFANF	NQDNTEVKGA	SRAAGLGRRA	VVWSLAVGSK
SGYKFFSLSS	VDKLEQIYEC	TDTEDVCIVE	RLFSSSLVAI	VSLKAPRKLK
VCHFKKGTEI	CNYSYSNTIL	AVKLNRQRLI	VCLEESLYIH	NIRDMKVLHT
IRETPPNPAG	LCALSINNDN	CYLAYPGSAT	IGEVQVFDTI	NLRAANMIPA
HDSPLAALAF	DASGTKLATA	SEKGTVIRVF	SIPEGQKLFE	FRRGVKRCVS
ICSLAFSMDG	MFLSASSNTE	TVHIFKLETV	KEKPPEEPTT	WTGYFGKVLM
ASTSYLPSQV	TEMFNQGRAF	ATVRLPFCGH	KNICSLATIQ	KIPRLLVGAA
DGYLYMYNLD	PQEGGECALM	KQHRLDGSLE	TTNEILDSAS	HDCPLVTQTY
GAAAGKGTYV	PSSPTRLAYT	DDLGAVGGAC	LEDEASALRL	DEDSEHPPMI
LRTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:32225 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4P8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.