WIPI2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, IDDSSA |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609225 MGI: 1923831 HomoloGene: 90887 GeneCards: WIPI2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • autophagosome • гіалоплазма • phagophore assembly site membrane • мембрана • phagophore assembly site • extrinsic component of membrane • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • macroautophagy • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • autophagy of nucleus • protein localization to phagophore assembly site • protein lipidation involved in autophagosome assembly • xenophagy • cellular response to starvation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/69/PBB_GE_WIPI2_202031_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_WIPI2_202031_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d9/PBB_GE_WIPI2_214699_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_WIPI2_214699_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/62/PBB_GE_WIPI2_204710_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_WIPI2_204710_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001033518 NM_001033519 NM_001033520 NM_001278299 NM_015610
| NM_016003 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001028690 NP_001028691 NP_001028692 NP_001265228 NP_056425
| NP_057087 NP_056425.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 5.19 – 5.23 Mb | Хр. 5: 142.61 – 142.66 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WIPI2 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 49 408[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNLASQSGEA | | GAGQLLFANF | | NQDNTEVKGA | | SRAAGLGRRA | | VVWSLAVGSK |
SGYKFFSLSS | | VDKLEQIYEC | | TDTEDVCIVE | | RLFSSSLVAI | | VSLKAPRKLK |
VCHFKKGTEI | | CNYSYSNTIL | | AVKLNRQRLI | | VCLEESLYIH | | NIRDMKVLHT |
IRETPPNPAG | | LCALSINNDN | | CYLAYPGSAT | | IGEVQVFDTI | | NLRAANMIPA |
HDSPLAALAF | | DASGTKLATA | | SEKGTVIRVF | | SIPEGQKLFE | | FRRGVKRCVS |
ICSLAFSMDG | | MFLSASSNTE | | TVHIFKLETV | | KEKPPEEPTT | | WTGYFGKVLM |
ASTSYLPSQV | | TEMFNQGRAF | | ATVRLPFCGH | | KNICSLATIQ | | KIPRLLVGAA |
DGYLYMYNLD | | PQEGGECALM | | KQHRLDGSLE | | TTNEILDSAS | | HDCPLVTQTY |
GAAAGKGTYV | | PSSPTRLAYT | | DDLGAVGGAC | | LEDEASALRL | | DEDSEHPPMI |
LRTD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:32225 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4P8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |