WWC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2Z0U

Ідентифікатори

Символи

WWC1, HBEBP3, HBEBP36, KIBRA, MEMRYQTL, PPP1R168, WW and C2 domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610533 MGI: 2388637 HomoloGene: 69180 GeneCards: WWC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • ruffle membrane • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hippo signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of hippo signaling • establishment of cell polarity • regulation of hippo signaling • negative regulation of organ growth • cell migration • positive regulation of MAPK cascade • regulation of intracellular transport • positive regulation of transcription of Notch receptor target
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23286


211652

Ensembl


ENSG00000113645


ENSMUSG00000018849

UniProt


Q8IX03


Q5SXA9

RefSeq (мРНК)


NM_001161661 NM_001161662 NM_015238


NM_170779

RefSeq (білок)


NP_001155133 NP_001155134 NP_056053


NP_740749

Локус (UCSC)

Хр. 5: 168.29 – 168.47 Mb

Хр. 11: 35.73 – 35.87 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WWC1 (англ. WW and C2 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 113 амінокислот, а молекулярна маса — 125 301^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRPELPLPE	GWEEARDFDG	KVYYIDHTNR	TTSWIDPRDR	YTKPLTFADC
ISDELPLGWE	EAYDPQVGDY	FIDHNTKTTQ	IEDPRVQWRR	EQEHMLKDYL
VVAQEALSAQ	KEIYQVKQQR	LELAQQEYQQ	LHAVWEHKLG	SQVSLVSGSS
SSSKYDPEIL	KAEIATAKSR	VNKLKREMVH	LQHELQFKER	GFQTLKKIDK
KMSDAQGSYK	LDEAQAVLRE	TKAIKKAITC	GEKEKQDLIK	SLAMLKDGFR
TDRGSHSDLW	SSSSSLESSS	FPLPKQYLDV	SSQTDISGSF	GINSNNQLAE
KVRLRLRYEE	AKRRIANLKI	QLAKLDSEAW	PGVLDSERDR	LILINEKEEL
LKEMRFISPR	KWTQGEVEQL	EMARKRLEKD	LQAARDTQSK	ALTERLKLNS
KRNQLVRELE	EATRQVATLH	SQLKSLSSSM	QSLSSGSSPG	SLTSSRGSLV
ASSLDSSTSA	SFTDLYYDPF	EQLDSELQSK	VEFLLLEGAT	GFRPSGCITT
IHEDEVAKTQ	KAEGGGRLQA	LRSLSGTPKS	MTSLSPRSSL	SSPSPPCSPL
MADPLLAGDA	FLNSLEFEDP	ELSATLCELS	LGNSAQERYR	LEEPGTEGKQ
LGQAVNTAQG	CGLKVACVSA	AVSDESVAGD	SGVYEASVQR	LGASEAAAFD
SDESEAVGAT	RIQIALKYDE	KNKQFAILII	QLSNLSALLQ	QQDQKVNIRV
AVLPCSESTT	CLFRTRPLDA	SDTLVFNEVF	WVSMSYPALH	QKTLRVDVCT
TDRSHLEECL	GGAQISLAEV	CRSGERSTRW	YNLLSYKYLK	KQSRELKPVG
VMAPASGPAS	TDAVSALLEQ	TAVELEKRQE	GRSSTQTLED	SWRYEETSEN
EAVAEEEEEE	VEEEEGEEDV	FTEKASPDMD	GYPALKVDKE	TNTETPAPSP
TVVRPKDRRV	GTPSQGPFLR	GSTIIRSKTF	SPGPQSQYVC	RLNRSDSDSS
TLSKKPPFVR	NSLERRSVRM	KRPSSVKSLR	SERLIRTSLD	LELDLQATRT
WHSQLTQEIS	VLKELKEQLE	QAKSHGEKEL	PQWLREDERF	RLLLRMLEKR
QMDRAEHKGE	LQTDKMMRAA	AKDVHRLRGQ	SCKEPPEVQS	FREKMAFFTR
PRMNIPALSA	DDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Buether K., Plaas C., Barnekow A., Kremerskothen J. (2004). KIBRA is a novel substrate for protein kinase Czeta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 317: 703—707. PMID 15081397 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.03.107
Johannsen S., Duning K., Pavenstaedt H., Kremerskothen J., Boeckers T.M. (2008). Temporal-spatial expression and novel biochemical properties of the memory-related protein KIBRA. Neuroscience. 155: 1165—1173. PMID 18672031 DOI:10.1016/j.neuroscience.2008.06.054
Genevet A., Wehr M.C., Brain R., Thompson B.J., Tapon N. (2010). Kibra Is a regulator of the Salvador/Warts/Hippo signaling network. Dev. Cell. 18: 300—308. PMID 20159599 DOI:10.1016/j.devcel.2009.12.011

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29435 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IX03 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.