YKT6

Ідентифікатори

Символи

YKT6, YKT6 v-SNARE homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 606209 MGI: 1927550 HomoloGene: 4778 GeneCards: YKT6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity • transferase activity • SNAP receptor activity • SNARE binding • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • integral component of plasma membrane • basal dendrite • transport vesicle • neuronal cell body • SNARE complex • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • cytoplasmic vesicle membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • apical dendrite • гіалоплазма
Біологічний процес	• vesicle targeting • vesicle docking involved in exocytosis • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • vesicle fusion • vesicle-mediated transport • membrane fusion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10652


56418

Ensembl


ENSG00000106636


ENSMUSG00000002741

UniProt


O15498


Q9CQW1

RefSeq (мРНК)


NM_006555 NM_001363678


NM_019661

RefSeq (білок)


NP_006546 NP_001350607 NP_006546.1


NP_062635

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.2 – 44.21 Mb

Хр. 11: 5.91 – 5.92 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YKT6 (англ. YKT6 v-SNARE homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 22 418^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLYSLSVLY	KGEAKVVLLK	AAYDVSSFSF	FQRSSVQEFM	TFTSQLIVER
SSKGTRASVK	EQDYLCHVYV	RNDSLAGVVI	ADNEYPSRVA	FTLLEKVLDE
FSKQVDRIDW	PVGSPATIHY	PALDGHLSRY	QNPREADPMT	KVQAELDETK
IILHNTMESL	LERGEKLDDL	VSKSEVLGTQ	SKAFYKTARK	QNSCCAIM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Veit M. (2004). The human SNARE protein Ykt6 mediates its own palmitoylation at C-terminal cysteine residues. Biochem. J. 384: 233—237. PMID 15479160 DOI:10.1042/BJ20041474
Fukasawa M., Varlamov O., Eng W.S., Soellner T.H., Rothman J.E. (2004). Localization and activity of the SNARE Ykt6 determined by its regulatory domain and palmitoylation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 4815—4820. PMID 15044687 DOI:10.1073/pnas.0401183101

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16959 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O15498 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.