YTHDF3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

YTHDF3

Ідентифікатори

Символи

YTHDF3, YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3, DF3

Зовнішні ІД

MGI: 1918850 HomoloGene: 34991 GeneCards: YTHDF3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding • RNA binding • ribosome binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of translation • positive regulation of translational initiation • mRNA destabilization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


253943


229096

Ensembl


ENSG00000185728


ENSMUSG00000047213

UniProt


Q7Z739


Q8BYK6

RefSeq (мРНК)

NM_001277813 NM_001277814 NM_001277815 NM_001277816 NM_001277817
NM_001277818 NM_152758


NM_001145919 NM_172677 NM_001358041 NM_001358042 NM_001358043

RefSeq (білок)

NP_001264742 NP_001264743 NP_001264744 NP_001264745 NP_001264746
NP_001264747 NP_689971


NP_001139391 NP_766265 NP_001344970 NP_001344971 NP_001344972

Локус (UCSC)

Хр. 8: 63.17 – 63.21 Mb

Хр. 3: 16.24 – 16.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

YTHDF3 (англ. YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 63 861^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSATSVDQRP	KGQGNKVSVQ	NGSIHQKDAV	NDDDFEPYLS	SQTNQSNSYP
PMSDPYMPSY	YAPSIGFPYS	LGEAAWSTAG	DQPMPYLTTY	GQMSNGEHHY
IPDGVFSQPG	ALGNTPPFLG	QHGFNFFPGN	ADFSTWGTSG	SQGQSTQSSA
YSSSYGYPPS	SLGRAITDGQ	AGFGNDTLSK	VPGISSIEQG	MTGLKIGGDL
TAAVTKTVGT	ALSSSGMTSI	ATNSVPPVSS	AAPKPTSWAA	IARKPAKPQP
KLKPKGNVGI	GGSAVPPPPI	KHNMNIGTWD	EKGSVVKAPP	TQPVLPPQTI
IQQPQPLIQP	PPLVQSQLPQ	QQPQPPQPQQ	QQGPQPQAQP	HQVQPQQQQL
QNRWVAPRNR	GAGFNQNNGA	GSENFGLGVV	PVSASPSSVE	VHPVLEKLKA
INNYNPKDFD	WNLKNGRVFI	IKSYSEDDIH	RSIKYSIWCS	TEHGNKRLDA
AYRSLNGKGP	LYLLFSVNGS	GHFCGVAEMK	SVVDYNAYAG	VWSQDKWKGK
FEVKWIFVKD	VPNNQLRHIR	LENNDNKPVT	NSRDTQEVPL	EKAKQVLKII
ATFKHTTSIF	DDFAHYEKRQ	EEEEAMRRER	NRNKQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26465 (англ.) . Архів оригіналу за 1 березня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z739 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.