ZBTB48

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3B84

Ідентифікатори

Символи

ZBTB48, HKR3, ZNF855, pp9964, zinc finger and BTB domain containing 48, TZAP, telomeric zinc-finger associated protein

Зовнішні ІД

OMIM: 165270 MGI: 2140248 HomoloGene: 3905 GeneCards: ZBTB48

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • identical protein binding • double-stranded telomeric DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • теломера • хромосома
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • telomere maintenance via telomere lengthening • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3104


100090

Ensembl


ENSG00000204859


ENSMUSG00000028952

UniProt


P10074


Q1H9T6

RefSeq (мРНК)


NM_001278647 NM_001278648 NM_005341


NM_133879 NM_001379628

RefSeq (білок)


NP_001265576 NP_001265577 NP_005332


NP_598640 NP_001366557

Локус (UCSC)

Хр. 1: 6.58 – 6.59 Mb

Хр. 4: 152.1 – 152.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZBTB48 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 77 054^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDGSFVQHSV	RVLQELNKQR	EKGQYCDATL	DVGGLVFKAH	WSVLACCSHF
FQSLYGDGSG	GSVVLPAGFA	EIFGLLLDFF	YTGHLALTSG	NRDQVLLAAR
ELRVPEAVEL	CQSFKPKTSV	GQAAGGQSGL	GPPASQNVNS	HVKEPAGLEE
EEVSRTLGLV	PRDQEPRGSH	SPQRPQLHSP	AQSEGPSSLC	GKLKQALKPC
PLEDKKPEDC	KVPPRPLEAE	GAQLQGGSNE	WEVVVQVEDD	GDGDYMSEPE
AVLTRRKSNV	IRKPCAAEPA	LSAGSLAAEP	AENRKGTAVP	VECPTCHKKF
LSKYYLKVHN	RKHTGEKPFE	CPKCGKCYFR	KENLLEHEAR	NCMNRSEQVF
TCSVCQETFR	RRMELRVHMV	SHTGEMPYKC	SSCSQQFMQK	KDLQSHMIKL
HGAPKPHACP	TCAKCFLSRT	ELQLHEAFKH	RGEKLFVCEE	CGHRASSRNG
LQMHIKAKHR	NERPHVCEFC	SHAFTQKANL	NMHLRTHTGE	KPFQCHLCGK
TFRTQASLDK	HNRTHTGERP	FSCEFCEQRF	TEKGPLLRHV	ASRHQEGRPH
FCQICGKTFK	AVEQLRVHVR	RHKGVRKFEC	TECGYKFTRQ	AHLRRHMEIH
DRVENYNPRQ	RKLRNLIIED	EKMVVVALQP	PAELEVGSAE	VIVESLAQGG
LASQLPGQRL	CAEESFTGPG	VLEPSLIITA	AVPEDCDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Sugawara M., Scholl T., Ponath P.D., Strominger J.L. (1994). A factor that regulates the class II major histocompatibility complex gene DPA is a member of a subfamily of zinc finger proteins that includes a Drosophila developmental control protein. Mol. Cell. Biol. 14: 8438—8450. PMID 7969177 DOI:10.1128/MCB.14.12.8438
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4930 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P10074 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.