ZFYVE16

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3T7L

Ідентифікатори

Символи

ZFYVE16, PPP1R69, zinc finger FYVE-type containing 16

Зовнішні ІД

OMIM: 608880 MGI: 2145181 HomoloGene: 8826 GeneCards: ZFYVE16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• ендосома • early endosome • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of endocytosis • endosomal transport • protein targeting to lysosome • BMP signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • vesicle organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9765


218441

Ensembl


ENSG00000039319


ENSMUSG00000021706

UniProt


Q7Z3T8


Q80U44

RefSeq (мРНК)


NM_001105251 NM_001284236 NM_001284237 NM_014733 NM_001349434


NM_173392

RefSeq (білок)


NP_001098721 NP_001271165 NP_001271166 NP_055548 NP_001336363


NP_775568

Локус (UCSC)

Хр. 5: 80.41 – 80.48 Mb

Хр. 13: 92.62 – 92.67 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZFYVE16 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 539 амінокислот, а молекулярна маса — 168 903^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSYFKAAVS	DLDKLLDDFE	QNPDEQDYLQ	DVQNAYDSNH	CSVSSELASS
QRTSLLPKDQ	ECVNSCASSE	TSYGTNESSL	NEKTLKGLTS	IQNEKNVTGL
DLLSSVDGGT	SDEIQPLYMG	RCSKPICDLI	SDMGNLVHAT	NSEEDIKKLL
PDDFKSNADS	LIGLDLSSVS	DTPCVSSTDH	DSDTVREQQN	DISSELQNRE
IGGIKELGIK	VDTTLSDSYN	YSGTENLKDK	KIFNQLESIV	DFNMSSALTR
QSSKMFHAKD	KLQHKSQPCG	LLKDVGLVKE	EVDVAVITAA	ECLKEEGKTS
ALTCSLPKNE	DLCLNDSNSR	DENFKLPDFS	FQEDKTVIKQ	SAQEDSKSLD
LKDNDVIQDS	SSALHVSSKD	VPSSLSCLPA	SGSMCGSLIE	SKARGDFLPQ
HEHKDNIQDA	VTIHEEIQNS	VVLGGEPFKE	NDLLKQEKCK	SILLQSLIEG
MEDRKIDPDQ	TVIRAESLDG	GDTSSTVVES	QEGLSGTHVP	ESSDCCEGFI
NTFSSNDMDG	QDLDYFNIDE	GAKSGPLISD	AELDAFLTEQ	YLQTTNIKSF
EENVNDSKSQ	MNQIDMKGLD	DGNINNIYFN	AEAGAIGESH	GINIICEIVD
KQNTIENGLS	LGEKSTIPVQ	QGLPTSKSEI	TNQLSVSDIN	SQSVGGARPK
QLFSLPSRTR	SSKDLNKPDV	PDTIESEPST	ADTVVPITCA	IDSTADPQVS
FNSNYIDIES	NSEGGSSFVT	ANEDSVPENT	CKEGLVLGQK	QPTWVPDSEA
PNCMNCQVKF	TFTKRRHHCR	ACGKVFCGVC	CNRKCKLQYL	EKEARVCVVC
YETISKAQAF	ERMMSPTGSN	LKSNHSDECT	TVQPPQENQT	SSIPSPATLP
VSALKQPGVE	GLCSKEQKRV	WFADGILPNG	EVADTTKLSS	GSKRCSEDFS
PLSPDVPMTV	NTVDHSHSTT	VEKPNNETGD	ITRNEIIQSP	ISQVPSVEKL
SMNTGNEGLP	TSGSFTLDDD	VFAETEEPSS	PTGVLVNSNL	PIASISDYRL
LCDINKYVCN	KISLLPNDED	SLPPLLVASG	EKGSVPVVEE	HPSHEQIILL
LEGESFHPVT	FVLNANLLVN	VKFIFYSSDK	YWYFSTNGLH	GLGQAEIIIL
LLCLPNEDTI	PKDIFRLFIT	IYKDALKGKY	IENLDNITFT	ESFLSSKDHG
GFLFITPTFQ	KLDDLSLPSN	PFLCGILIQK	LEIPWAKVFP	MRLMLRLGAE
YKAYPAPLTS	IRGRKPLFGE	IGHTIMNLLV	DLRNYQYTLH	NIDQLLIHME
MGKSCIKIPR	KKYSDVMKVL	NSSNEHVISI	GASFSTEADS	HLVCIQNDGI
YETQANSATG	HPRKVTGASF	VVFNGALKTS	SGFLAKSSIV	EDGLMVQITP
ETMNGLRLAL	REQKDFKITC	GKVDAVDLRE	YVDICWVDAE	EKGNKGVISS
VDGISLQGFP	SEKIKLEADF	ETDEKIVKCT	EVFYFLKDQD	LSILSTSYQF
AKEIAMACSA	ALCPHLKTLK	SNGMNKIGLR	VSIDTDMVEF	QAGSEGQLLP
QHYLNDLDSA	LIPVIHGGTS	NSSLPLEIEL	VFFIIEHLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Seet L.-F., Hong W. (2001). Endofin, an endosomal FYVE domain protein. J. Biol. Chem. 276: 42445—42454. PMID 11546807 DOI:10.1074/jbc.M105917200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Seet L.-F., Liu N., Hanson B.J., Hong W. (2004). Endofin recruits TOM1 to endosomes. J. Biol. Chem. 279: 4670—4679. PMID 14613930 DOI:10.1074/jbc.M311228200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20756 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z3T8 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.