ZHX2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DMP, 3NAU

Ідентифікатори

Символи

ZHX2, AFR1, RAF, zinc fingers and homeoboxes 2

Зовнішні ІД

OMIM: 609185 MGI: 2683087 HomoloGene: 8968 GeneCards: ZHX2

Пов'язані генетичні захворювання

натуральна віспа^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • mRNA catabolic process • negative regulation of neuron differentiation • somatic stem cell population maintenance • transcription, DNA-templated • retinal bipolar neuron differentiation • нейробіологія розвитку • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22882


387609

Ensembl


ENSG00000178764


ENSMUSG00000071757

UniProt


Q9Y6X8


Q8C0C0

RefSeq (мРНК)


NM_014943 NM_001362797


NM_199449

RefSeq (білок)


NP_055758 NP_001349726


NP_955520

Локус (UCSC)

Хр. 8: 122.78 – 122.97 Mb

Хр. 15: 57.56 – 57.7 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZHX2 (англ. Zinc fingers and homeoboxes 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 837 амінокислот, а молекулярна маса — 92 307^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASKRKSTTP	CMVRTSQVVE	QDVPEEVDRA	KEKGIGTPQP	DVAKDSWAAE
LENSSKENEV	IEVKSMGESQ	SKKLQGGYEC	KYCPYSTQNL	NEFTEHVDMQ
HPNVILNPLY	VCAECNFTTK	KYDSLSDHNS	KFHPGEANFK	LKLIKRNNQT
VLEQSIETTN	HVVSITTSGP	GTGDSDSGIS	VSKTPIMKPG	KPKADAKKVP
KKPEEITPEN	HVEGTARLVT	DTAEILSRLG	GVELLQDTLG	HVMPSVQLPP
NINLVPKVPV	PLNTTKYNSA	LDTNATMINS	FNKFPYPTQA	ELSWLTAASK
HPEEHIRIWF	ATQRLKHGIS	WSPEEVEEAR	KKMFNGTIQS	VPPTITVLPA
QLAPTKVTQP	ILQTALPCQI	LGQTSLVLTQ	VTSGSTTVSC	SPITLAVAGV
TNHGQKRPLV	TPQAAPEPKR	PHIAQVPEPP	PKVANPPLTP	ASDRKKTKEQ
IAHLKASFLQ	SQFPDDAEVY	RLIEVTGLAR	SEIKKWFSDH	RYRCQRGIVH
ITSESLAKDQ	LAIAASRHGR	TYHAYPDFAP	QKFKEKTQGQ	VKILEDSFLK
SSFPTQAELD	RLRVETKLSR	REIDSWFSER	RKLRDSMEQA	VLDSMGSGKK
GQDVGAPNGA	LSRLDQLSGA	QLTSSLPSPS	PAIAKSQEQV	HLLRSTFART
QWPTPQEYDQ	LAAKTGLVRT	EIVRWFKENR	CLLKTGTVKW	MEQYQHQPMA
DDHGYDAVAR	KATKPMAESP	KNGGDVVPQY	YKDPKKLCEE	DLEKLVTRVK
VGSEPAKDCL	PAKPSEATSD	RSEGSSRDGQ	GSDENEESSV	VDYVEVTVGE
EDAISDRSDS	WSQAAAEGVS	ELAESDSDCV	PAEAGQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liu G., Clement L.C., Kanwar Y.S., Avila-Casado C., Chugh S.S. (2006). ZHX proteins regulate podocyte gene expression during the development of nephrotic syndrome. J. Biol. Chem. 281: 39681—39692. PMID 17056598 DOI:10.1074/jbc.M606664200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZHX2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18513 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6X8 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.