ZKSCAN5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EM5, 2EMM, 2EMZ, 2EN3, 2EOM, 2EON, 2EOO, 2YSO, 2YTG

Ідентифікатори

Символи

ZKSCAN5, ZFP95, ZNF914, ZSCAN37, ZFP-95, zinc finger with KRAB and SCAN domains 5

Зовнішні ІД

OMIM: 611272 MGI: 107533 HomoloGene: 8734 GeneCards: ZKSCAN5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23660


22757

Ensembl


ENSG00000196652


ENSMUSG00000055991

UniProt


Q9Y2L8


Q9Z1D8

RefSeq (мРНК)


NM_014569 NM_145102 NM_001318082 NM_001318083 NM_001318084

NM_001167944 NM_016683 NM_001359187 NM_001359188 NM_001359189
NM_001359190 NM_001359191 NM_001359192

RefSeq (білок)


NP_001305011 NP_001305012 NP_001305013 NP_055384 NP_659570

NP_001161416 NP_057892 NP_001346116 NP_001346117 NP_001346118
NP_001346119 NP_001346120 NP_001346121

Локус (UCSC)

Хр. 7: 99.5 – 99.53 Mb

Хр. 5: 145.14 – 145.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZKSCAN5 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 96 903^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIMTESREVI	DLDPPAETSQ	EQEDLFIVKV	EEEDCTWMQE	YNPPTFETFY
QRFRHFQYHE	ASGPREALSQ	LRVLCCEWLR	PELHTKEQIL	ELLVLEQFLT
ILPEEFQPWV	REHHPESGEE	AVAVIENIQR	ELEERRQQIV	ACPDVLPRKM
ATPGAVQESC	SPHPLTVDTQ	PEQAPQKPRL	LEENALPVLQ	VPSLPLKDSQ
ELTASLLSTG	SQKLVKIEEV	ADVAVSFILE	EWGHLDQSQK	SLYRDDRKEN
YGSITSMGYE	SRDNMELIVK	QISDDSESHW	VAPEHTERSV	PQDPDFAEVS
DLKGMVQRWQ	VNPTVGKSRQ	NPSQKRDLDA	ITDISPKQST	HGERGHRCSD
CGKFFLQASN	FIQHRRIHTG	EKPFKCGECG	KSYNQRVHLT	QHQRVHTGEK
PYKCQVCGKA	FRVSSHLVQH	HSVHSGERPY	GCNECGKNFG	RHSHLIEHLK
RHFREKSQRC	SDKRSKNTKL	SVKKKISEYS	EADMELSGKT	QRNVSQVQDF
GEGCEFQGKL	DRKQGIPMKE	ILGQPSSKRM	NYSEVPYVHK	KSSTGERPHK
CNECGKSFIQ	SAHLIQHQRI	HTGEKPFRCE	ECGKSYNQRV	HLTQHQRVHT
GEKPYTCPLC	GKAFRVRSHL	VQHQSVHSGE	RPFKCNECGK	GFGRRSHLAG
HLRLHSREKS	HQCRECGEIF	FQYVSLIEHQ	VLHMGQKNEK	NGICEEAYSW
NLTVIEDKKI	ELQEQPYQCD	ICGKAFGYSS	DLIQHYRTHT	AEKPYQCDIC
RENVGQCSHT	KQHQKIYSST	KSHQCHECGR	GFTLKSHLNQ	HQRIHTGEKP
FQCKECGMNF	SWSCSLFKHL	RSHERTDPIN	TLSVEGSLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Dreyer S.D., Zheng Q., Zabel B., Winterpacht A., Lee B. (1999). Isolation, characterization, and mapping of a zinc finger gene, ZFP95, containing both a SCAN box and an alternatively spliced KRAB A domain. Genomics. 62: 119—122. PMID 10585779 DOI:10.1006/geno.1999.5981

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12867 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2L8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.