ZMYND11

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4NS5, 5HDA

Ідентифікатори

Символи

ZMYND11, BRAM1, BS69, MRD30, zinc finger MYND-type containing 11

Зовнішні ІД

OMIM: 608668 MGI: 1913755 HomoloGene: 4828 GeneCards: ZMYND11

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 30^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0031493 histone binding • double-stranded DNA binding • zinc ion binding • methylated histone binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of JNK cascade • клітинний цикл • проліферація • GO:0022415 viral process • regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • defense response to virus • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10771


66505

Ensembl


ENSG00000015171


ENSMUSG00000021156

UniProt


Q15326


Q8R5C8

RefSeq (мРНК)

NM_001202464 NM_001202465 NM_001202466 NM_001202467 NM_001202468
NM_006624 NM_212479 NM_001330057

NM_001199141 NM_144516 NM_001347470 NM_001347471 NM_001347472
NM_001347473 NM_001347474 NM_001347476 NM_001347477 NM_001347479 NM_001347480 NM_001347481

RefSeq (білок)

NP_001189393 NP_001189394 NP_001189395 NP_001189396 NP_001189397
NP_001316986 NP_006615 NP_997644 NP_001357026 NP_001357027 NP_001357028 NP_001357029 NP_001357030 NP_001357031 NP_001357032 NP_001357033 NP_001357034 NP_001357035 NP_001357036 NP_001357037 NP_001357038 NP_001357039 NP_001357040 NP_001357041 NP_001357042 NP_001357043 NP_001357044 NP_001357045 NP_001357046 NP_001357047 NP_001357048 NP_001357049 NP_001357050 NP_001357051 NP_001357052 NP_001357053

NP_001186070 NP_001334399 NP_001334400 NP_001334401 NP_001334402
NP_001334403 NP_001334405 NP_001334406 NP_001334408 NP_001334409 NP_001334410 NP_653099

Локус (UCSC)

Хр. 10: 0.13 – 0.25 Mb

Хр. 13: 9.73 – 9.82 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZMYND11 (англ. Zinc finger MYND-type containing 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 602 амінокислот, а молекулярна маса — 70 963^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARLTKRRQA	DTKAIQHLWA	AIEIIRNQKQ	IANIDRITKY	MSRVHGMHPK
ETTRQLSLAV	KDGLIVETLT	VGCKGSKAGI	EQEGYWLPGD	EIDWETENHD
WYCFECHLPG	EVLICDLCFR	VYHSKCLSDE	FRLRDSSSPW	QCPVCRSIKK
KNTNKQEMGT	YLRFIVSRMK	ERAIDLNKKG	KDNKHPMYRR	LVHSAVDVPT
IQEKVNEGKY	RSYEEFKADA	QLLLHNTVIF	YGADSEQADI	ARMLYKDTCH
ELDELQLCKN	CFYLSNARPD	NWFCYPCIPN	HELVWAKMKG	FGFWPAKVMQ
KEDNQVDVRF	FGHHHQRAWI	PSENIQDITV	NIHRLHVKRS	MGWKKACDEL
ELHQRFLREG	RFWKSKNEDR	GEEEAESSIS	STSNEQLKVT	QEPRAKKGRR
NQSVEPKKEE	PEPETEAVSS	SQEIPTMPQP	IEKVSVSTQT	KKLSASSPRM
LHRSTQTTND	GVCQSMCHDK	YTKIFNDFKD	RMKSDHKRET	ERVVREALEK
LRSEMEEEKR	QAVNKAVANM	QGEMDRKCKQ	VKEKCKEEFV	EEIKKLATQH
KQLISQTKKK	QWCYNCEEEA	MYHCCWNTSY	CSIKCQQEHW	HAEHKRTCRR
KR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Velasco G., Grkovic S., Ansieau S. (2006). New insights into BS69 functions. J. Biol. Chem. 281: 16546—16550. PMID 16565076 DOI:10.1074/jbc.M600573200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Masselink H., Bernards R. (2000). The adenovirus E1A binding protein BS69 is a corepressor of transcription through recruitment of N-CoR. Oncogene. 19: 1538—1546. PMID 10734313 DOI:10.1038/sj.onc.1203421
Ansieau S., Leutz A. (2002). The conserved Mynd domain of BS69 binds cellular and oncoviral proteins through a common PXLXP motif. J. Biol. Chem. 277: 4906—4910. PMID 11733528 DOI:10.1074/jbc.M110078200
Chung P.J., Chang Y.S., Liang C.L., Meng C.L. (2002). Negative regulation of Epstein-Barr virus latent membrane protein 1-mediated functions by the bone morphogenetic protein receptor IA-binding protein, BRAM1. J. Biol. Chem. 277: 39850—39857. PMID 12181323 DOI:10.1074/jbc.M206736200
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZMYND11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16966 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15326 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.