ZSCAN9 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

ZSCAN9

Ідентифікатори

Символи

ZSCAN9, PRD51, ZNF193, zinc finger and SCAN domain containing 9

Зовнішні ІД

OMIM: 602246 HomoloGene: 55967 GeneCards: ZSCAN9

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7746


н/д

Ensembl


ENSG00000137185


н/д

UniProt


O15535


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001199479 NM_001199480 NM_006299


н/д

RefSeq (білок)


NP_001186408 NP_001186409 NP_006290


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 6: 28.22 – 28.23 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

ZSCAN9 (англ. Zinc finger and SCAN domain containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 45 954^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNTNSKEVLS	LGVQVPEAWE	ELLTMKVEAK	SHLQWQESRL	KRSNPLAREI
FRRHFRQLCY	QETPGPREAL	TRLQELCYQW	LRPHVSTKEQ	ILDLLVLEQF
LSILPKELQG	WVREHCPESG	EEAVILLEDL	ERELDEPQHE	MVAHRHRQEV
LCKEMVPLAE	QTPLTLQSQP	KEPQLTCDSA	QKCHSIGETD	EVTKTEDREL
VLRKDCPKIV	EPHGKMFNEQ	TWEVSQQDPS	HGEVGEHKDR	IERQWGNLLG
EGQHKCDECG	KSFTQSSGLI	RHQRIHTGER	PYECNECGKA	FSRSSGLFNH
RGIHNIQKRY	HCKECGKVFS	QSAGLIQHQR	IHKGEKPYQC	SQCSKSYSRR
SFLIEHQRSH	TGERPHQCIE	CGKSFNRHCN	LIRHQKIHTV	AELV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12984 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O15535 (англ.) . Архів оригіналу за 29 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.