PABPN1

PABPN1
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

3B4D、​3B4M、​3UCG

識別號
别名PABPN1;, OPMD, PAB2, PABII, PABP-2, PABP2, poly(A) binding protein nuclear 1
外部IDOMIM:602279 MGI:1859158 HomoloGene:3412 GeneCards:PABPN1
相關疾病
眼咽肌营养不良[1]
基因位置(人类
14號染色體
染色体14號染色體[2]
14號染色體
PABPN1的基因位置
PABPN1的基因位置
基因座14q11.2起始23,321,457 bp[2]
终止23,326,163 bp[2]
基因位置(小鼠
小鼠14号染色体
染色体小鼠14号染色体[3]
小鼠14号染色体
PABPN1的基因位置
PABPN1的基因位置
基因座14 C3|14 27.98 cM起始55,129,957 bp[3]
终止55,135,626 bp[3]
RNA表达模式


查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 血浆蛋白结合
nucleic acid binding
RNA binding
RNA polymerase binding
細胞組分 細胞質
核质
nuclear inclusion body
细胞核
nuclear speck
核糖核蛋白
生物學過程 mRNA splicing, via spliceosome
termination of RNA polymerase II transcription
RNA processing
肌肉收缩
mRNA processing
poly(A)+ mRNA export from nucleus
modification by virus of host mRNA processing
mRNA 3'-end processing
MAPK cascade
cellular response to lipopolysaccharide
positive regulation of polynucleotide adenylyltransferase activity
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

8106

54196

Ensembl

ENSG00000100836

ENSMUSG00000022194

UniProt

Q86U42

Q8CCS6

mRNA​序列

NM_004643
​NM_001360551
​NM_001360552

NM_019402

蛋白序列

NP_004634
​NP_001347480
​NP_001347481

NP_062275

基因位置​(UCSC)Chr 14: 23.32 – 23.33 MbChr 14: 55.13 – 55.14 Mb
PubMed​查找[4][5]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

PABPN1(PABP-2)全名為多聚腺苷酸結合核蛋白1(polyadenylate-binding nuclear protein 1),在人類基因組中由14號染色體編碼,是一種多聚腺苷酸結合蛋白(PABP)[6][7]。此蛋白位於細胞核中,其N端有一捲曲螺旋結構域,中間為RNA识别基序英语RNA recognition motif(RRM),C端則有核定位序列[8]。在mRNA轉錄結束後即參與多腺苷酸化的反應,以N端與多聚腺苷酸聚合酶英语Polynucleotide adenylyltransferase(PAP)結合,並以RRM與剛生成的多腺苷酸尾結合以促進多腺苷酸化進行[8],且可抑制細胞在較靠近終止密碼子的多腺苷酸化訊號(PAS)以CPSF切割mRNA並加上多腺苷酸尾,促使其使用距離較遠的多腺苷酸化訊號,因而形成較長的3'非轉譯區(3'UTR)[9]

遺傳疾病眼咽型肌营养不良英语oculopharyngeal muscular dystrophy(OPMD)即爲PABPN1基因突變,使其N端多出了數個丙氨酸重複所致[10]

參考文獻

  • 分子与细胞生物学主题
  1. ^ 與PABPN1相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100836 - Ensembl, May 2017
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022194 - Ensembl, May 2017
  4. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  6. ^ Brais B, Xie YG, Sanson M, Morgan K, Weissenbach J, Korczyn AD, Blumen SC, Fardeau M, Tomé FM, Bouchard JP. The oculopharyngeal muscular dystrophy locus maps to the region of the cardiac alpha and beta myosin heavy chain genes on chromosome 14q11.2-q13. Hum Mol Genet. Aug 1995, 4 (3): 429–34. PMID 7795598. doi:10.1093/hmg/4.3.429. 
  7. ^ Entrez Gene: PABPN1 poly(A) binding protein, nuclear 1. [2021-05-03]. (原始内容存档于2010-03-06). 
  8. ^ 8.0 8.1 Banerjee A, Apponi LH, Pavlath GK, Corbett AH. PABPN1: molecular function and muscle disease.. FEBS J. 2013, 280 (17): 4230–50. PMC 3786098可免费查阅. PMID 23601051. doi:10.1111/febs.12294. 
  9. ^ Jenal M, Elkon R, Loayza-Puch F, van Haaften G, Kühn U, Menzies FM; et al. The poly(A)-binding protein nuclear 1 suppresses alternative cleavage and polyadenylation sites.. Cell. 2012, 149 (3): 538–53. PMID 22502866. doi:10.1016/j.cell.2012.03.022. 
  10. ^ Riaz M, Raz Y, van Putten M, Paniagua-Soriano G, Krom YD, Florea BI; et al. PABPN1-Dependent mRNA Processing Induces Muscle Wasting.. PLoS Genet. 2016, 12 (5): e1006031. PMC 4859507可免费查阅. PMID 27152426. doi:10.1371/journal.pgen.1006031. 
细胞核
前信使RNA · 5'端加帽 · 多腺苷酸化 · 多聚腺苷酸结合蛋白CPSFCstF、PAP、

PAB2、CFI及CFII)

RNA剪接内含子 / 外显子 · snRNA · snRNP · 剪接體次要剪切体英语Minor spliceosomeU1英语U1 spliceosomal RNA · 選擇性剪接 · 前体mRNA加工因子 (PLRG1、PRPF3、PRPF4、PRPF4B、PRPF6、PRPF8、PRPF18、PRPF19、PRPF31、PRPF38A、PRPF38B、PRPF39、PRPF40A及PRPF40B)

RNA编辑 · 多聚尿苷酸化
细胞质
遗传学索引
描述
  • 生化
  • 基因表达
  • DNA
    • 复制
    • 周期蛋白
    • 基因重组
    • 修复
  • 转录
    • 转录因子与细胞内受体
    • 辅调节因子
    • RNA
    • 重复序列
    • 转录后修饰
  • 翻译
    • 核糖体亚基
    • 翻译后修饰
    • 分拣蛋白英语Template:Sorting nexin
  • DNA结合蛋白英语Template:DNA-binding proteins/RNA结合蛋白英语Template:RNA-binding proteins
    • 核糖核蛋白)
  • 蛋白质
    • 结构域
    • 结构
      • 2+°
疾病
  • Replication and repair英语Template:DNA replication and repair-deficiency disorder
  • Transcription factor英语Template:Transcription factor and coregulator deficiencies
  • 转录相关疾病英语Template:Disorders of transcription and post transcriptional modification
  • 轉譯相關疾病