GATA2

GATA2
Identifiants
AliasesGATA2
IDs externesOMIM: 137295 MGI: 95662 HomoloGene: 32030 GeneCards: GATA2
Position du gène (Homme)
Chromosome 3 humain
Chr.Chromosome 3 humain[1]
Chromosome 3 humain
Localisation génomique pour GATA2
Localisation génomique pour GATA2
Locus3q21.3Début128,479,427 bp[1]
Fin128,493,201 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour GATA2
Localisation génomique pour GATA2
Locus6 D1|6 39.2 cMDébut88,170,873 bp[2]
Fin88,184,014 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • vésicule séminale

  • poumon droit

  • left uterine tube

  • Médullaire rénale

  • prostate

  • body of uterus

  • urètre

  • endocol

  • upper lobe of left lung

  • placenta
Fortement exprimé dans
  • vésicule séminale

  • gastrula

  • medullary collecting duct

  • placenta

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • vestibular membrane of cochlear duct

  • canal déférent

  • vestibular sensory epithelium

  • primary trophoblast giant cell

  • inner renal medulla
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • liaison ADN
  • sequence-specific DNA binding
  • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • zinc ion binding
  • transcription factor binding
  • liaison de chromatine
  • C2H2 zinc finger domain binding
  • liaison ion métal
  • liaison protéique
  • cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • transcription regulator complex
  • nucléoplasme
  • noyau
  • cytoplasme
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain
  • positive regulation of phagocytosis
  • différenciation cellulaire
  • negative regulation of fat cell differentiation
  • pituitary gland development
  • positive regulation of phagocytosis, engulfment
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • positive regulation of erythrocyte differentiation
  • somatic stem cell population maintenance
  • negative regulation of macrophage differentiation
  • GABAergic neuron differentiation
  • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
  • negative regulation of fat cell proliferation
  • negative regulation of neural precursor cell proliferation
  • embryonic placenta development
  • migration d'un neurone
  • coagulation sanguine
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • maturation cellulaire
  • semicircular canal development
  • transcription, DNA-templated
  • regulation of primitive erythrocyte differentiation
  • ventral spinal cord interneuron differentiation
  • response to lipid
  • cell differentiation in hindbrain
  • central nervous system neuron development
  • inner ear morphogenesis
  • positive regulation of neuron differentiation
  • regulation of histone acetylation
  • différenciation d'un neurone
  • regulation of forebrain neuron differentiation
  • phagocytose
  • urogenital system development
  • cell fate determination
  • homeostasis of number of cells within a tissue
  • definitive hemopoiesis
  • neuron fate commitment
  • negative regulation of myeloid cell differentiation
  • positive regulation of megakaryocyte differentiation
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • negative regulation of Notch signaling pathway
  • eosinophil fate commitment
  • positive regulation of mast cell degranulation
  • cochlea development
  • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
  • positive regulation of angiogenesis
  • negative regulation of endothelial cell apoptotic process
  • positive regulation of gene expression
  • negative regulation of gene expression
  • hématopoïèse
  • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
  • positive regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis
  • développement du cœur
  • morphogenèse d'un organe animal
  • histogenèse
  • développement d'une cellule
  • structure anatomique impliquée dans la morphogenèse
  • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
  • digestive tract development
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

2624

14461

Ensembl

ENSG00000179348

ENSMUSG00000015053

UniProt

P23769

O09100

RefSeq (mRNA)

NM_032638
NM_001145661
NM_001145662

NM_008090
NM_001355253

RefSeq (protéine)

NP_001139133
NP_001139134
NP_116027

NP_032116
NP_001342182

Localisation (UCSC)Chr 3: 128.48 – 128.49 MbChr 6: 88.17 – 88.18 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le GATA2 est une protéine appartenant à la famille des facteurs de transcription de type GATA dont le gène est le GATA2 situé sur le chromosome 3 humain.

Rôle

Il est exprimé dans les valves des vaisseaux lymphatiques et contribue aux développements de ces dernières[5]. Il module l'expression du récepteur au VGEF, le VGEFR2[6], du facteur de von Willebrand[7], de l'endothéline 1[8] et de l'oxyde nitrique synthase[9]. Il interagit avec l'Ap-1 qui régule l'inflammation[10]; ainsi qu'avec PROX1, SPI1, FOXC2 et NFATC1[11]. Il augmente l'expression du VCAM-1[12].

Il intervient également dans l'hématopoïèse[13], dans la fonction des cellules hypophysaires[14], des neurones GABAergiques[15] ainsi que dans l'immunité[16].

Il module l'expression de l'endomucine[17].

Il joue également sur l'expression de certains micro-ARN dont le miR 126 et le miR 221[18].

En médecine

La mutation de son gène provoque le syndrome d'Emberger caractérisé par un lymphœdème et un risque de développer une leucémie aiguë myéloblastique[19].

Certains variants de son gène sont corrélés avec la survenue d'une hypercholestérolémie[20] et un risque augmenté de maladie cardio-vasculaire précoce[21].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000179348 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015053 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Kazenwadel J, Secker GA, Liu YJ et al. Loss-of-function germline GATA2 mutations in patients with MDS/AML or MonoMAC syndrome and primary lymphedema reveal a key role for GATA2 in the lymphatic vasculature, Blood, 2012;119:1283–1291
  6. Mammoto A, Connor KM, Mammoto T et al. A mechanosensitive transcriptional mechanism that controls angiogenesis, Nature, 2009;457:1103–1108
  7. Jahroudi N, Lynch DC, Endothelial-cell-specific regulation of von Willebrand factor gene expression, Mol Cell Biol, 1994;14:999–1008
  8. Dorfman DM, Wilson DB, Bruns GA, Orkin SH, Human transcription factor GATA-2. Evidence for regulation of preproendothelin-1 gene expression in endothelial cells, J Biol Chem, 1992;267:1279–1285
  9. Zhang R, Min W, Sessa WC, Functional analysis of the human endothelial nitric oxide synthase promoter. Sp1 and GATA factors are necessary for basal transcription in endothelial cells, J Biol Chem, 1995;270:15320–15326
  10. Linnemann AK, O’Geen H, Keles S, Farnham PJ, Bresnick EH, Genetic framework for GATA factor function in vascular biology, Proc Natl Acad Sci U S A, 2011;108:13641–13646
  11. Kazenwadel J, Betterman KL, Chong CE et al. GATA2 is required for lymphatic vessel valve development and maintenance, J Clin Investig, 2015;125:2979-2994
  12. Minami T, Aird WC, Thrombin stimulation of the vascular cell adhesion molecule-1 promoter in endothelial cells is mediated by tandem nuclear factor-kappa B and GATA motifs, J Biol Chem, 2001;276:47632–47641
  13. Johnson KD, Hsu AP, Ryu MJ et al. Cis-element mutated in GATA2-dependent immunodeficiency governs hematopoiesis and vascular integrity, J Clin Invest, 2012;122:3692–3704
  14. Charles MA, Saunders TL, Wood WM et al. Pituitary-specific Gata2 knockout: effects on gonadotrope and thyrotrope function, Mol Endocrinol, 2006;20:1366–1377
  15. Kala K, Haugas M, Lilleväli K et al. Gata2 is a tissue-specific post-mitotic selector gene for midbrain GABAergic neurons, Development, 2009;136:253–262
  16. Spinner MA, Sanchez LA, Hsu AP et al. GATA2 deficiency: a protean disorder of hematopoiesis, lymphatics, and immunity, Blood, 2013;123:809–821
  17. Kanki Y, Kohro T, Jiang S et al. Epigenetically coordinated GATA2 binding is necessary for endothelium-specific endomucin expression, EMBO J, 2011;30:2582–2595
  18. Hartmann D, Fiedler H, Sonnenschein K et al. MicroRNA-based therapy of GATA2-deficient vascular disease, Circulation, 2016;134:1973-1990
  19. Ostergaard P, Simpson MA, Connell FC et al. Mutations in GATA2 cause primary lymphedema associated with a predisposition to acute myeloid leukemia (Emberger syndrome), Nat Genet, 2011;43:929–931
  20. Muiya NP, Wakil S, Al-Najai M et al. A study of the role of GATA2 gene polymorphism in coronary artery disease risk traits, Gene, 2014;544:152–158
  21. Connelly JJ, Wang T, Cox JE et al. GATA2 is associated with familial early-onset coronary artery disease, PLoS Genet, 2006;2:e139
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